1-methyl-4-[1-methyl-4-(1-methyl-1H-pyrrole-2-amido)-1H-pyrrole-2-amido]-1H-pyrrole-2-carboxylic acid | 295805-52-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: 1-methyl-4-[1-methyl-4-(1-methyl-1H-pyrrole-2-amido)-1H-pyrrole-2-amido]-1H-pyrrole-2-carboxylic acid
• 英文别名: 1-Methyl-4-[[1-methyl-4-[(1-methylpyrrole-2-carbonyl)amino]pyrrole-2-carbonyl]amino]pyrrole-2-carboxylic acid
• CAS: 295805-52-6
• 化学式: C₁₈H₁₉N₅O₄
• 分子量: 369.38
• InChiKey: SLUQECOSBKWDCF-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.3
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.17
• 拓扑面积：
  110
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-methyl-4-[1-methyl-4-(1-methyl-1H-pyrrole-2-amido)-1H-pyrrole-2-amido]-1H-pyrrole-2-carboxylic acid 在 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 氯仿 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 9.0h， 生成 N-(5-{[3-(dimethylamino)propyl]carbamoyl}-1-methyl-1H-pyrrole-3-yl)-1-methyl-4-(1-methyl-1H-pyrrole-2-amido)-1H-pyrrole-2-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  基于2，6-二取代的氨基蒽-9,10-二酮的二聚双霉素类似物对启动子G-Quadruplex DNA的特异性稳定作用及其选择性的癌细胞毒性。

  摘要：

  我们已经设计并合成了含有蒽醌的化合物，这些化合物具有不同长度的寡吡咯侧链。这些化合物稳定了在c-MYC癌基因的启动子区域中形成的G-四链体DNA，选择性地超过了双链体DNA。使用紫外可见光谱滴定，荧光测量和圆二色性（CD）光谱滴定记录这些观察结果。从热变性实验已经显示出化合物稳定G4 DNA的效力。该化合物通过堆叠模式与c-MYC G-四链体DNA相互作用，该堆叠模式是从溴化乙锭置换试验，循环伏安滴定和对接实验中获得的。分子模型研究表明，蒽醌部分在G4结构的G-四联体上的堆积负责这种四链体二级结构的稳定性。此外，在上述化合物存在下，聚合酶终止试验也支持稳定的G4结构的形成。根据基于MTT的细胞生存力测定法确定的化合物，在体外条件下，该化合物对正常细胞（NIH3T3和HDFa）具有选择性的癌细胞（HeLa和HEK293T）细胞毒性。从膜联蛋白V-FITC和PI双重染色测定法中发现，凋亡是癌细胞细胞毒性的机制途径，其通过AO

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2020.112202
• 作为产物：
  描述：

  1-甲基-4-硝基吡咯-2-羧酸 在 palladium 10% on activated carbon 、 水 、 氢气 、 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 、 sodium hydroxide 作用下， 以 甲醇 、 乙醇 、 乙酸乙酯 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 20.0 ℃ 、206.85 kPa 条件下， 反应 67.16h， 生成 1-methyl-4-[1-methyl-4-(1-methyl-1H-pyrrole-2-amido)-1H-pyrrole-2-amido]-1H-pyrrole-2-carboxylic acid
  参考文献：
  名称：

  [EN] DNA BINDING AGENTS WITH A MINOR GROOVE BINDING TAIL
  [FR] AGENTS LIANT L'ADN AVEC UNE QUEUE SE LIANT AU SILLON MINEUR

  摘要：

  本文提供的是一些能够插入细胞DNA并能够穿过血脑屏障的化合物。此外，本文还提供了这些化合物的药物组合物以及治疗癌症的方法，例如大脑、肺部或胰腺癌。

  公开号：

  WO2017049091A1

文献信息

• [EN] SEQUENCE SELECTIVE PYRROLE AND IMIDAZOLE POLYAMIDE METALLOCOMPLEXES<br/>[FR] MÉTALLOCOMPLEXES POLYAMIDES DE PYRROLE ET IMIDAZOLE SELECTIFS VIS-A-VIS DE SEQUENCES
  申请人：UNIV WESTERN SYDNEY

  公开号：WO2005033077A1

  公开（公告）日：2005-04-14

  The present invention relates to sequence selective compounds for targeting therapeutic or diagnostic groups to polynucleotides. More particularly, the present invention relates to sequence selective targeting of metallocomplexes, such as metallodrugs and metallodiagnostics, to polynucleotides.

  本发明涉及用于将治疗或诊断组靶向到多核苷酸的序列选择性化合物。更具体地说，本发明涉及将金属配合物（如金属药物和金属诊断试剂）的序列选择性靶向到多核苷酸。
• Novel polyamide amidine anthraquinone platinum(II) complexes: cytotoxicity, cellular accumulation, and fluorescence distributions in 2D and 3D cell culture models
  作者：Anthony T. S. Lo、Nicole S. Bryce、Alice V. Klein、Mathew H. Todd、Trevor W. Hambley

  DOI：10.1007/s00775-020-01847-3

  日期：2021.5

  5-Aminoalkylamine substituted anthraquinones (AAQs, 1C3 and 1,5C3) were peptide coupled to 1-, 2-, and 3-pyrrole lexitropsins to generate compounds that incorporated both DNA minor groove and intercalating moieties. The corresponding platinum(II) amidine complexes were synthesized through a synthetically facile amine-to-platinum mediated nitrile ‘Click’ reaction. The precursors as well as the corresponding platinum(II)

  1- 和 1,5- 氨基烷基胺取代的蒽醌（AAQ、1C3 和 1,5C3）与 1-、2- 和 3-吡咯 lexitropsins 进行肽偶联，生成掺入 DNA 小沟和嵌入部分的化合物。通过合成简便的胺-铂介导的腈“点击”反应合成了相应的铂(II)脒络合物。在 2D 单层细胞和 3D 肿瘤细胞模型中对前体以及相应的铂 (II) 配合物进行了生物学评估。尽管铂复合物的细胞累积水平比顺铂低五倍，但其细胞毒性仅低三倍。具有两个或三个吡咯基团的复合物的累积量最低，但后者是复合物中活性最高的，超过了 MDA-MB-231 细胞系中顺铂的活性。所有化合物均表现出中等至良好的 DLD-1 细胞球体渗透性，其分布与球体缺乏营养物区域中含吡咯复合物的主动吸收一致。  图文摘要
• Novel Oligopyrrole Carboxamide based Nickel(II) and Palladium(II) Salens, Their Targeting of Human G-Quadruplex DNA, and Selective Cancer Cell Toxicity
  作者：Asfa Ali、Mohini Kamra、Soma Roy、K. Muniyappa、Santanu Bhattacharya

  DOI：10.1002/asia.201600655

  日期：2016.9.20

  DNA targeting by various metal complexes is a key strategy toward the restriction of cancer cell proliferation. Toward this end, we designed and synthesized novel salen‐based NiII and PdII metal complexes with positively charged flanking side chains comprising N‐methylpyrrole carboxamides of varying lengths. The compounds showed high specificity toward G‐quadruplex DNA over duplex DNA. Sufficient inhibition

  各种金属配合物靶向DNA是限制癌细胞增殖的关键策略。为此，我们设计并合成了基于新型塞伦的Ni II和Pd II金属配合物，该配合物具有带正电荷的侧翼侧链，其中N-长度不同的甲基吡咯羧酰胺。该化合物对G-四链体DNA的特异性高于双链体DNA。观察到对端粒酶活性的充分抑制，这可以通过长期细胞生存力和端粒酶抑制试验中癌细胞增殖的显着限制来确定。这些化合物在凋亡途径后表现出选择性的癌细胞死亡。结合模式的分析表明，Salen部分在G-tetrads上部分堆叠，并且寡聚吡咯侧链羧酰胺侧链单元与凹槽相关。四键结合的金属salen核与凹槽定向的柔性寡吡咯部分的缀合导致人类G-四链体DNA结构的高选择性和稳定性。
• Synthesis of Lipid Derivatives of Pyrrole Polyamide and Their Biological Activity
  作者：Masahiko YAMAMOTO、Changjin ZHU、Lui YI、Zheng RONG、Yoshie MIURA、Minoru IZUMI、Shuhei NAKAJIMA、Ken-ichi TANAMOTO、Sakayu SHIMIZU、Naomichi BABA

  DOI：10.1271/bbb.60650

  日期：2007.4.23

  Novel fatty acyl and phospholipid derivatives of pyrrole polyamide were synthesized. Their cytotoxicity against a cancer cell line of MT-4 cells and those infected by human immunodeficiency virus (HIV) was examined. Although no anti-HIV activity was found, their cytotoxicitty against the cancer cells was significantly enhanced by introducing a lipophilic group into the pyrrole polyamide.

  合成了新型脂肪酰和磷脂衍生物的吡咯聚酰胺。对其在MT-4细胞癌细胞系及人类免疫缺陷病毒（HIV）感染细胞中的细胞毒性进行了研究。尽管未发现抗HIV活性，但通过在吡咯聚酰胺中引入疏水基团，其对癌细胞的细胞毒性显著增强。
• Fluorous synthesis of minor groove binding agents related to distamycin
  作者：Sreeman K. Mamidyala、Steven M. Firestine

  DOI：10.1016/j.tetlet.2006.08.058

  日期：2006.10

  Minor groove binding agents related to distamycin have been shown to target specific DNA sequences with high affinity. We report a new method for the preparation of these agents using fluorous synthesis in which the fluorous tag is located on what will become the cationic tail of the molecule. We demonstrate that fluorous synthesis yields both simple and complex polyamides in good yields and in high

  与distamycin相关的小沟结合剂已显示出以高亲和力靶向特定的DNA序列。我们报道了一种使用氟合成制备这些试剂的新方法，其中氟标签位于将成为分子阳离子尾部的位置。我们证明了氟的合成可以以良好的产率和高纯度产生简单和复杂的聚酰胺。