Computer‐aided drug design of small molecule inhibitors of the ERCC1‐XPF protein–protein interaction
作者:Francesco Gentile、Ahmed H. Elmenoufy、Gloria Ciniero、David Jay、Feridoun Karimi‐Busheri、Khaled H. Barakat、Michael Weinfeld、Frederick G. West、Jack A. Tuszynski
DOI:10.1111/cbdd.13660
日期:2020.4
and crosslinking agents, thus its inhibition is a promising strategy to enhance the effect of these therapies. In this study, we rationally modified the structure of F06, a small molecule inhibitor of the ERCC1-XPF interaction (Jordheim et al., 2013), to improve its binding to the target. We followed a multi-step computational approach to investigate potential modification sites of F06, rationally
DNA切除修复蛋白ERCC-1和DNA修复核酸内切酶XPF(ERCC1-XPF)的异二聚体是核苷酸切除修复(NER)途径必不可少的5´-3´结构特异性核酸内切酶,并且它也参与其他DNA修复途径。在癌细胞中,ERCC1-XPF在修复化学疗法(包括铂基和交联剂)引起的DNA损伤中起着核心作用,因此其抑制作用是增强这些疗法效果的有前途的策略。在这项研究中,我们合理地修饰了F06(ERCC1-XPF相互作用的小分子抑制剂)的结构(Jordheim等,2013),以改善其与靶标的结合。我们采用了多步计算方法来研究F06的潜在修饰位点,合理设计和排列类似物库,并确定化学合成和体外测试的候选对象。我们的顶级化合物B5对ERCC1-XPF核酸内切酶活性的抑制作用显示出改善的半最大抑制浓度(IC50)值为0.49 µM,为进一步的测试和优化奠定了基础。同样,此处报道的计算方法可用于开发靶向ERCC1-XPF复合物的DNA修复抑制剂。