ethylmalonyl-CoA | 6049-57-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: ethylmalonyl-CoA
• 英文别名: Ethylmalonyl coenzyme A；2-[2-[3-[[(2R)-4-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxy-3-phosphonooxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxy-2-hydroxy-3,3-dimethylbutanoyl]amino]propanoylamino]ethylsulfanylcarbonyl]butanoic acid
• CAS: 6049-57-6
• 化学式: C₂₆H₄₂N₇O₁₉P₃S
• 分子量: 881.642
• InChiKey: VUGZQVCBBBEZQE-MIZDRFBCSA-N

物化性质

• 密度：
  1.88±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -5
• 重原子数：
  56
• 可旋转键数：
  23
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.65
• 拓扑面积：
  426
• 氢给体数：
  10
• 氢受体数：
  24

安全信息

• 储存条件：
  -20°C，密封保存于干燥处。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  ethylmalonyl-CoA 、 L-aminoadipate semialdehyde 在 CarB W₇₉A 作用下， 以6%的产率得到(7S)-7-ethyl-(2S,5S)-carboxymethylpipecolic acid
  参考文献：
  名称：

  工程化羧甲基脯氨酸合酶催化的立体选择性 C-C 键形成

  摘要：

  烯醇（酸酯）与亲电试剂的反应广泛用于有机合成中，用于立体选择性 C-C 键的形成。基于蛋白质的催化剂在通过烯醇化物化学选择性形成 C-C 键的立体选择性形成方面的应用相对有限。我们描述了对巴豆酶超家族成员 5-羧甲基脯氨酸合酶的蛋白质工程研究，旨在通过控制三取代的烯醇中间体来实现立体选择性 C-C 键形成，从而产生N-杂环。活性位点取代，包括氧阴离子结合位点，能够产生取代的N-通过立体控制的烯醇化物形成和反应产生高非对映体过量的杂环。结果揭示了普遍存在的巴豆糖酶超家族作为控制烯醇化物化学的适应性催化剂的潜力。

  DOI：

  10.1038/nchem.1011
• 作为产物：
  描述：

  乙基丙二酸 、 辅酶 A 在 1,4-dithio-D,L-threitol 、 MatB T₂₀₇G/M₃₀₆I 、 5’-三磷酸腺苷 、 magnesium chloride 作用下， 以 aq. phosphate buffer 为溶剂， 生成 ethylmalonyl-CoA
  参考文献：
  名称：

  通过模块化聚酮合酶内的酰基转移酶域交换扩展非天然聚酮生物合成的扩展底物选择

  摘要：

  模块化聚酮合酶 (PKS) 是使用 α-羧基辅酶 A 作为增量底物的聚合酶。该酶家族包含多个催化模块，其中每个模块负责单轮聚酮化合物链延伸。尽管 PKS 模块通常使用丙二酰辅酶 A 或甲基丙二酰辅酶 A 进行链延长，但许多其他丙二酰辅酶 A 类似物用于使自然界中的聚酮化合物结构多样化。以前，我们开发了一种方法，通过在保持蛋白质折叠的同时交换酰基转移酶 (AT) 结构域来改变给定模块的延伸底物。在这里，我们报告了13 种 PKS（野生型 PKS 和 12 种具有异常 AT 的 AT 交换 PKS）和 14 种扩展底物的体外聚酮化合物生物合成。我们的 ~200体外反应产生了 13 种结构不同的聚酮化合物，其中包括几种尚未报道的聚酮化合物。在某些情况下，AT 交换的 PKS 产生的目标聚酮化合物是野生型 PKS 的 100 倍以上。这些数据还表明，大多数不寻常的 AT 结构域不包含丙二酰辅酶 A

  DOI：

  10.1021/jacs.2c11027

文献信息

• Epothilone derivatives and methods for making and using the same
  申请人：——

  公开号：US20030045711A1

  公开（公告）日：2003-03-06

  This invention relates to compounds of formula (I) 1 and to pharmaceutically acceptable salts and solvates thereof, wherein R 1 , R 2 , R 3 , R 4 , R 5 , W, X, Y, and Ar are as defined herein. Compounds of formula (I) are useful in the treatment of diseases or conditions characterized by cellular hyperproliferation. This invention also relates to means for the preparation of compounds of formula (I); formulations containing compounds of formula (I); and methods for the use of said compounds and formulations in the treatment of a disease or condition characterized by cellular hyperproliferation, including cancer.

  这项发明涉及公式（I）的化合物及其药用可接受的盐和溶剂化合物，其中R1、R2、R3、R4、R5、W、X、Y和Ar的定义如本文所述。公式（I）的化合物在治疗细胞过度增殖引起的疾病或症状方面是有用的。这项发明还涉及制备公式（I）化合物的方法；含有公式（I）化合物的配方；以及使用所述化合物和配方治疗细胞过度增殖引起的疾病或症状，包括癌症的方法。
• Bio-intermediates for use in the chemical synthesis of polyketides
  申请人：——

  公开号：US20040018598A1

  公开（公告）日：2004-01-29

  The present invention relates to compounds made by a subset of modules from one or more polyketide synthase (“PKS”) genes that are used as starting material in the chemical synthesis of novel molecules, particularly naturally occurring polyketides or derivatives thereof. The biologically derived intermediates (“bio-intermediates”) generally represent particularly difficult compounds to synthesize using traditional chemical approaches due to one or more stereocenters. In one aspect of the invention, an intermediate in the synthesis of epothilone is provided that feeds into the synthetic protocol of Danishefsky and co-workers. In another aspect of the invention, intermediates in the synthesis of discodermolide are provided that feed into the synthetic protocol of Smith and co-workers. By taking advantage of the inherent stereochemical specificity of biological processes, the syntheses of key intermediates and thus the overall syntheses of compounds like epothilone and discodermolide are greatly simplified.

  本发明涉及由一个或多个聚酮合酶合成酶（“PKS”）基因的子模块制备的化合物，这些化合物作为起始物质用于化学合成新颖分子，特别是天然存在的聚酮类化合物或其衍生物。生物衍生的中间体（“生物中间体”）通常代表着尤其难以使用传统化学方法合成的化合物，因为其中一个或多个立体中心。在本发明的一个方面，提供了用于累积素合成的中间体，该中间体进入Danishefsky及其同事的合成方案。在本发明的另一个方面，提供了用于二十碳二烯酮合成的中间体，这些中间体进入Smith及其同事的合成方案。通过利用生物过程固有的立体化学特异性，关键中间体的合成以及诸如累积素和二十碳二烯酮等化合物的整体合成大大简化了。
• NOVEL TACROLIMUS ANALOGUES, A NEUROPROTECTIVE COMPOSITION COMPRISING THE SAME, AN IMMUNOSUPPRESSIVE COMPOSITION COMPRISING THE SAME, A METHOD FOR PREPARING THE SAME, AND A MUTANT FOR PRODUCING THE SAME
  申请人：EWHA UNIVERSITY- INDUSTRY COLLABORATION FOUNDATION

  公开号：US20130230559A1

  公开（公告）日：2013-09-05

  The present invention relates to novel tacrolimus analogues, a composition for the prevention or treatment of neurological diseases or immune hypersensitivity disorders comprising the same, a method for preventing or treating neurological diseases or immune hypersensitivity disorders comprising administering the analogues to a subject, a method for preparing the analogues using an isolated modified Streptomyces sp. strain wherein the activity of one or more enzymes selected from the group consisting of TcsA, TcsB, TcsC and TcsD is reduced; and the isolated modified Streptomyces sp. strain for prepare the analogues.

  本发明涉及新型他克莫司类似物，一种用于预防或治疗神经疾病或免疫过敏性疾病的组合物，包括相同的组成部分，一种通过向受试者施用类似物来预防或治疗神经疾病或免疫过敏性疾病的方法，一种使用经过改良的分离链霉菌菌株制备类似物的方法，其中来自于TcsA、TcsB、TcsC和TcsD组中选择的一个或多个酶的活性被降低；以及用于制备类似物的经过改良的分离链霉菌菌株。
• Producing 3-hydroxycarboxylic acid and ketone using polyketide synthases
  申请人：The Regents of the University of California

  公开号：US10233431B2

  公开（公告）日：2019-03-19

  The present invention provides for a polyketide synthase (PKS) capable of synthesizing a 3-hydroxycarboxylic acid or ketone. The present invention also provides for a host cell comprising the PKS and when cultured produces the 3-hydroxycarboxylic acid or ketone.

  本发明提供了一种能够合成3-羟基羧酸或酮的聚酮合酶（PKS）。本发明还提供了一种包含该PKS的宿主细胞，当培养时产生3-羟基羧酸或酮。
• Establishing a Toolkit for Precursor-Directed Polyketide Biosynthesis: Exploring Substrate Promiscuities of Acid-CoA Ligases
  作者：Maybelle Kho Go、Jeng Yeong Chow、Vivian Wing Ngar Cheung、Yan Ping Lim、Wen Shan Yew

  DOI：10.1021/bi300425j

  日期：2012.6.5

  biosynthesized from acyl-CoA precursors by polyketide synthases. One of the limitations to combinatorial biosynthesis of polyketides has been the lack of a toolkit that describes the means of delivering novel acyl-CoA precursors necessary for polyketide biosynthesis. Using five acid-CoA ligases obtained from various plants and microorganisms, we biosynthesized an initial library of 79 acyl-CoA thioesters by screening

  聚酮化合物是化学上多样化且具有医学上重要意义的生物化学物质，它们是通过聚酮化合物合酶从酰基辅酶A前体生物合成的。聚酮化合物的组合生物合成的局限性之一是缺少工具包，该工具包描述了递送聚酮化合物生物合成所必需的新型酰基-CoA前体的方法。使用从各种植物和微生物中获得的5种酸性CoA连接酶，我们通过针对123种羧酸的文库筛选每种酸性CoA连接酶，生物合成了79种酰基CoA硫酯的初始文库。酰基-CoA硫酯库包括肉桂基-CoA，3-苯基丙酰基-CoA，苯甲酰基-CoA，苯乙酰基-CoA，丙二酰-CoA，饱和和不饱和脂族CoA硫酯和双环芳族CoA硫酯的衍生物。在我们对新型酰基辅酶A前体的生物合成路线的搜索中，我们发现了两种以前未报道过的丙二酰辅酶A衍生物（3-硫代苯丙氨酰辅酶A和苯基丙二酰辅酶A），无法通过规范的丙二酰辅酶A合成酶生产。该报告强调了确定常规底物池之外底物混杂的实用性和重要性，并描述了建