2-[6-[bis(tert-butoxycarbonyl)amino]-9H-purin-9-yl]acetic acid | 175695-25-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: 2-[6-[bis(tert-butoxycarbonyl)amino]-9H-purin-9-yl]acetic acid
• 英文别名: 2-[6-[Bis(t-butoxycarbonyl)amino]-9h-purin-9-yl]acetic acid；2-[6-[bis[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonyl]amino]purin-9-yl]acetic acid
• CAS: 175695-25-7
• 化学式: C₁₇H₂₃N₅O₆
• 分子量: 393.4
• InChiKey: OZGQCTKNFHJPFU-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 熔点：
  104-105 °C
• 沸点：
  549.7±60.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.34±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2
• 重原子数：
  28
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.53
• 拓扑面积：
  137
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-[6-[bis(tert-butoxycarbonyl)amino]-9H-purin-9-yl]acetic acid 在 吗啉 、 N-甲基吗啉 、 N-溴代丁二酰亚胺(NBS) 、 四(三苯基膦)钯 、 三苯基膦 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 生成 2-[[2-[6-[Bis[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonyl]amino]purin-9-yl]acetyl]-[2-(phenylmethoxycarbonylamino)ethyl]amino]acetic acid
  参考文献：
  名称：

  肽核酸二聚体的液相合成

  摘要：

  已经以良好的产率实现了包含精氨酸和腺嘌呤的肽核酸（PNA_）二聚体的第一液相合成。为了避开受保护的PNA的困难耦合，制定了新的策略。

  DOI：

  10.1016/0040-4039(96)00037-8
• 作为产物：
  描述：

  6-乙基水杨酸甲酯 在 4-二甲氨基吡啶 、 lithium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 18.0h， 生成 2-[6-[bis(tert-butoxycarbonyl)amino]-9H-purin-9-yl]acetic acid
  参考文献：
  名称：

  Lipophilic peptide nucleic acids containing a 1,3-diyne function: synthesis, characterization and production of derived polydiacetylene liposomes

  摘要：

  Adenine-, cytosine- and thymine-containing peptide nucleic acid (PNA) monomers have been synthesized in which either diacetylenic or stearoyl moieties are attached to the N-or C-terminus; the diacetylenic group is embedded within a long hydrocarbon chain. A range of analogous lipophilic functionalized PNA oligomers have been prepared using either solid phase synthesis or a post-synthetic solution phase procedure following cleavage of the PNA oligomer from the solid Support. Selected functionalized PNA monomers and oligomers have been incorporated into liposomal polydiacetylenes and characterized by UV-vis absorption spectroscopy. Preliminary investigations show that blue PDA-liposomes containing thymine-based PNAs can be formed and that production of liposomes with other PNA systems are viable. (c) 2005 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.tet.2005.07.021

文献信息

• Switchable Protecting Strategy for Solid Phase Synthesis of DNA and RNA Interacting Nucleopeptides
  作者：Maria Emilia Mercurio、Stefano Tomassi、Maria Gaglione、Rosita Russo、Angela Chambery、Stefania Lama、Paola Stiuso、Sandro Cosconati、Ettore Novellino、Salvatore Di Maro、Anna Messere

  DOI：10.1021/acs.joc.6b01829

  日期：2016.12.2

  nucleobases. They can recognize DNA and RNA targets modulating their biological functions. To date, the lack of an effective strategy for the synthesis of nucleopeptides prevents their evaluation for biological and biomedical applications. Herein, we describe an unprecedented approach that enables the synthesis of cationic both homo and heterosequence nucleopeptides wholly on solid support with high yield

  核酸肽是有希望的核酸模拟物，其中肽主链带有核碱基。他们可以识别调节其生物学功能的DNA和RNA靶标。迄今为止，缺乏合成核苷酸肽的有效策略阻止了其对生物和生物医学应用的评估。在这里，我们描述了一种前所未有的方法，该方法能够以高产率和纯度完全在固体支持物上合成阳离子同核苷酸和异核苷酸核苷酸。光谱研究表明核肽在结合，热力学稳定性和序列特异性识别方面的有利性质。生物稳定性测定和激光扫描共聚焦显微镜分析表明，核肽具有可接受的血清稳定性和穿过细胞膜的能力。
• A Practical and Efficient Approach to PNA Monomers Compatible with Fmoc-Mediated Solid-Phase Synthesis Protocols
  作者：Andrea Porcheddu、Giampaolo Giacomelli、Ivana Piredda、Mariolino Carta、Giammario Nieddu

  DOI：10.1002/ejoc.200800891

  日期：2008.12

  A straightforward synthesis of orthogonally protected PNA monomers is described. Protected aminoethylglycine (Aeg) monomers were efficiently prepared by reductive amination of N-Fmoc-glycinaldehyde with glycine methyl ester and the subsequent acylation of the free amine with N-bis-Boc-protected nucleobase acetic acids. The exocyclic amine group of the nucleobases, including the notoriously difficult-to-protect

  描述了正交保护的 PNA 单体的直接合成。受保护的氨基乙基甘氨酸 (Aeg) 单体通过 N-Fmoc-甘氨酸醛与甘氨酸甲酯的还原胺化和随后的游离胺与 N-双-Boc 保护的核碱基乙酸酰化来有效制备。核碱基的环外胺基团，包括众所周知的难以保护的鸟嘌呤核碱基，被双 Boc 氨基甲酸酯基团保护；这增加了核碱基在最常见有机溶剂中的溶解度。目前的协议允许在微观和宏观尺度上制备所有 Aeg 单体, 这避免或最大限度地减少了有毒试剂或溶剂的使用, 此外, 还使用了廉价的起始材料。
• Acyclic nucleoside phosphonates containing the amide bond: hydroxy derivatives
  作者：Iwona E. Głowacka、Dorota G. Piotrowska、Graciela Andrei、Dominique Schols、Robert Snoeck、Andrzej E. Wróblewski

  DOI：10.1007/s00706-019-2351-y

  日期：2019.4

  rigidity and changes in donor–acceptor properties, three series of nucleotide analogs containing a P–X–HN–C(O)– residue (X=CH(OH)CH2, CH(OH)CH2CH2, CH2CH(OH)CH2) as a replacement for the P–CH2–O–CHR– fragment in acyclic nucleoside phosphonates, e.g., adefovir, cidofovir, were synthesized. EDC proved to provide good yields of the analogs from the respective ω-amino-1- or -2-hydroxyalkylphosphonates and

  摘要为了研究接头刚性和供体-受体特性变化的影响，三个系列的核苷酸类似物含有 P-X-HN-C(O)- 残基 (X=CH(OH)CH 2 , CH(OH)CH合成了2 CH 2 , CH 2 CH(OH)CH 2 ) 作为无环核苷膦酸盐（例如阿德福韦、西多福韦）中 P-CH 2 -O-CHR- 片段的替代物。EDC 证明从各自的 ω-氨基-1-或 -2-羟基烷基膦酸盐和核碱基衍生的乙酸中提供了良好的类似物产率。新型磷-核碱基接头的特征在于酰胺键和四原子单元中的两个受限旋转片段（P-CH(OH)-CH 2 -N、P-CH(OH)-CH 2-C 和 P-CH 2 -CH(OH)-C)，其中 P 和 N/C 原子的反周面排列是从1 H 和13 C NMR 光谱数据推导出来的。合成的类似物 P-X-HNC(O)-CH 2 B [X=CH(OH)CH 2 , CH(OH)CH 2 CH 2 , CH 2
• Acyclic nucleoside phosphonates containing the amide bond
  作者：Iwona E. Głowacka、Dorota G. Piotrowska、Graciela Andrei、Dominique Schols、Robert Snoeck、Andrzej E. Wróblewski

  DOI：10.1007/s00706-016-1848-x

  日期：2016.12

  AbstractTo study the influence of a linker rigidity and donor–acceptor properties, the P–CH2–O–CHR– fragment in acyclic nucleoside phosphonates (e.g., acyclovir, tenofovir) was replaced by the P–CH2–HN–C(O)– residue. The respective phosphonates were synthesized in good yields by coupling the straight chain of ω-aminophosphonates and nucleobase-derived acetic acids with EDC. Based on the 1H and 13C

  抽象的为了研究接头刚性和供体-受体性质的影响，将无环核苷膦酸酯（例如，无环鸟苷，替诺福韦）中的P–CH 2 – O–CHR –片段替换为P–CH 2 – HN–C（O ） –残留物。通过将ω-氨基膦酸酯的直链和核碱基衍生的乙酸与EDC偶联，可以高收率合成各种膦酸酯。基于1 H和13 C NMR数据，确认了系列a和b的膦酸酯中亚甲基和1,2-亚乙基连接基内的旋转不受限制。对于含1,3-亚丙基的膦酸酯（系列c）碎片，确定了大块O，O-二乙基膦酸酯和取代的氨基甲基基团的反平面布置。合成的ANP P–X–HNC（O）–CH 2 B（X = CH 2，CH 2 CH 2，CH 2 CH 2 CH 2，CH 2 OCH 2 CH 2）在针对多种浓度高达100μM的DNA和RNA病毒，同时具有很小的抗增殖活性（L1210细胞，IC 50  = 89±16μM，HeLa细胞，IC 50 对于衍生自（5-氟尿嘧啶-1-基）乙酸和O，O
• A Convenient Route to <i>N</i>-[2-(Fmoc)aminoethyl]glycine Esters and PNA Oligomerization Using a Bis-<i>N</i>-Boc Nucleobase Protecting Group Strategy
  作者：Filip Wojciechowski、Robert H. E. Hudson

  DOI：10.1021/jo800195j

  日期：2008.5.1

  A simple and practical synthesis of the benzyl, allyl, and 4-nitrobenzyl esters of N-[2-(Fmoc)aminoethyl]glycine is described starting from the known N-(2-aminoethyl)glycine. These esters are stored as stable hydrochloride salts and were used in the synthesis of peptide nucleic acid monomers possessing bis-N-Boc-protected nucleobase moieties on the exocyclic amino groups of ethyl cytosin-1-ylacetate

  描述了从已知的N-（2-氨基乙基）甘氨酸开始的N- [2-（Fmoc）氨基乙基]甘氨酸的苄基，烯丙基和4-硝基苄基酯的简单而实用的合成。这些酯以稳定的盐酸盐形式储存，用于合成在胞嘧啶-1-基乙酸乙酯，腺嘌呤-9-乙酸乙酯和乙酯的环外氨基上具有双-N -Boc保护的核碱基部分的肽核酸单体（O 6-苄基鸟嘌呤-9-基）乙酸盐。酯水解后，将相应的核碱基乙酸与N- [2-（Fmoc）氨基乙基]甘氨酸苄基酯或N- [2-（Fmoc）氨基乙基]甘氨酸烯丙基酯偶联，以保留N- [2-（Fmoc）氨基乙基]甘氨酸烯丙基酯。鸟嘌呤的O 6苄基醚保护基。Fmoc /双-N -Boc保护的单体已成功用于混合序列10-mer PNA低聚物的Fmoc介导的固相肽合成，并被证明是目前使用最广泛的Fmoc / Bhoc-保护的肽核酸单体。