N²-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-N⁴-[2-N-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl]-L-asparagine tert-butyl ester | 131287-38-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: N²-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-N⁴-[2-N-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl]-L-asparagine tert-butyl ester
• 英文别名: N-α-9-fluorenylmethoxycarbonyl-N-β-(2-N-acetylamido-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl)-L-asparagine tert-butyl ester；Fmoc-Asn(GlcNAc)-OtBu；tert-butyl (2S)-4-[[(2R,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]amino]-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-4-oxobutanoate
• CAS: 131287-38-2
• 化学式: C₃₁H₃₉N₃O₁₀
• 分子量: 613.665
• InChiKey: HZYREEKVYBPTLW-HHWMNBLUSA-N

物化性质

• 熔点：
  182-184 °C
• 沸点：
  934.5±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.38±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.1
• 重原子数：
  44
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.48
• 拓扑面积：
  193
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N²-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-N⁴-[2-N-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl]-L-asparagine tert-butyl ester 在 吡啶 、 三氟乙酸 作用下， 反应 13.0h， 生成 N-(9-芴甲氧羰基)-N’-(2-乙酰氨基-2-脱氧-3,4,6-三-O-乙酰基-beta-D-吡喃葡萄糖基)-L-天冬酰胺
  参考文献：
  名称：

  Novel sequential solid-phase synthesis of N-linked glycopeptides from natural sources

  摘要：

  本报告展示了一种从天然来源固相合成 N-连接糖肽的实用且多功能的方法。该方法基于温和的肼解程序，以完整的未还原形式从天然糖蛋白（如胎盘素和核糖核酸酶 B）中释放出 N-连接寡糖，随后形成相应的糖基胺。用碳酸氢铵在水或二甲基亚砜（DMSO）中的饱和溶液处理还原糖 1-7，几乎可以得到定量的糖基胺 8-14。将未受保护的糖基胺 8-14 与侧链激活的天冬氨酸衍生物 Fmoc-Asp(ODhbt)-OBut 16 偶联，可得到 N-糖基化的天冬酰胺衍生物 17-23。随后通过三氟乙酸（TFA）处理对碳水化合物羟基进行乙酰化并裂解叔丁酯，可得到糖基化的 N-连接构筑模块 31-37。然后，将这些结构单元 31-37 加入小鼠血红蛋白衍生的十肽 Hb（67-76）VITAFNEGLK 的糖肽 T 细胞表位类似物 40-46 的多柱肽合成方案中。十肽序列 VITAFNEGLK 与 MHC II 类 Ek 分子结合良好，对 CBA/J 小鼠无免疫原性。本文介绍了在十肽 Hb（67-76）上进行几种天然和非天然糖基化，如 N-乙酰葡糖胺、N,N′-二乙酰壳寡糖、葡萄糖、麦芽三糖、麦芽庚糖以及二元和三元泛酰复合寡糖，从而得到 N-连接的糖肽 40-46。通过 1D- 和 2D-1H 和 13C NMR 光谱以及 ES-MS 对 N-连接的糖肽 40-46 进行了全面鉴定。

  DOI：

  10.1039/a705528e
• 作为产物：
  描述：

  D-GlcNAc 在 四(三苯基膦)钯 苯硅烷 、 碳酸氢钠 、 碳酸氢铵 作用下， 以 1,4-二氧六环 为溶剂， 反应 25.0h， 生成 N²-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)-N⁴-[2-N-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl]-L-asparagine tert-butyl ester
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of N-Linked Glycosyl Asparagine Derivatives with Unprotected Sugar Components

  摘要：

  本文介绍了一种有效形成天冬酰胺（Asn）N-糖苷键的通用方法，该方法无需保护糖成分羟基。天冬氨酸氟化物与 N-烯丙氧羰基（Alloc）糖基胺结合使用。在二噁烷水溶液中进行了 Pd(0)-PhSiH3 介导的原位 Alloc 脱除-偶联反应，得到了高产率的 Asn 链接碳水化合物。

  DOI：

  10.1055/s-2002-22716

文献信息

• Chemoselective peptide bond formation using formyl-substituted nitrophenylthio ester
  作者：Akihiro Ishiwata、Tsuyoshi Ichiyanagi、Maki Takatani、Yukishige Ito

  DOI：10.1016/s0040-4039(03)00471-4

  日期：2003.4

  A novel method for peptide bond formation utilizing amino acid 2-formyl-4-nitrophenylthio ester has been developed. The reaction can be performed in water-containing media and is compatible with various types of amino acid side-chain functional groups. Use of N-methylmaleinimide as an additive is essential for the reaction to proceed with high efficiency. It captures liberated formyl-substituted thiophenol

  已经开发出一种利用氨基酸2-甲酰基-4-硝基苯硫基酯形成肽键的新方法。该反应可以在含水介质中进行并且与各种类型的氨基酸侧链官能团相容。使用N-甲基马来酰亚胺作为添加剂对于反应以高效率进行是必不可少的。它通过1，4-加成，然后醛醇环化，捕获释放的甲酰基取代的苯硫酚。
• Intein-Mediated Synthesis of Proteins Containing Carbohydrates and Other Molecular Probes
  作者：Thomas J. Tolbert、Chi-Huey Wong

  DOI：10.1021/ja0000192

  日期：2000.6.1

  We report here the use of an intein-mediated protein ligation strategy for the synthesis of glycoproteins and proteins containing various molecular probes. Several simple cysteine derivatives are synthesized and used as nucleophiles for specific incorporation onto the C-terminus of proteins expressed as N-terminal intein fusions. Examples of C-terminal carbohydrate labeling, fluorescence labeling,

  我们在这里报告了使用内含肽介导的蛋白质连接策略来合成含有各种分子探针的糖蛋白和蛋白质。几种简单的半胱氨酸衍生物被合成并用作亲核试剂，用于特异性掺入表达为 N 端内含肽融合蛋白的蛋白质的 C 端。介绍了 C 端碳水化合物标记、荧光标记、金属螯合剂的掺入和核苷酸的掺入的例子。
• An Efficient Synthetic Route to Glycoamino Acid Building Blocks for Glycopeptide Synthesis
  作者：Mallesham Bejugam、Sabine L. Flitsch

  DOI：10.1021/ol048342n

  日期：2004.10.1

  requires access to gram quantities of glycosylated amino acid building blocks. Hence, the efficiency of synthesis of such building blocks is of great importance. Here, we report a fast and highly efficient synthetic route to Fmoc-protected asparaginyl glycosides from unprotected sugars in three steps with high yields. The glycosylated amino acids were successfully incorporated into target glycopeptides

  [反应：见正文]化学糖肽合成需要获得克量的糖基化氨基酸构件。因此，这种结构单元的合成效率非常重要。在这里，我们报告了一种快速高效的合成路线，可分三步以高收率从未保护的糖中合成Fmoc保护的天冬酰胺基糖苷。通过标准的Fmoc固相肽合成，将糖基化的氨基酸成功地掺入靶糖肽7和8中。
• Unprotected Oligosaccharides as Phase Tags:  Solution-Phase Synthesis of Glycopeptides with Solid-Phase Workups
  作者：Showming Wen、Zhongwu Guo

  DOI：10.1021/ol0101988

  日期：2001.11.1

  [reaction--see text] N-Linked glycopeptides were synthesized from glycosyl asparagines containing unprotected oligosaccharides and other simple amino acids by an Fmoc method. The free oligosaccharide chains were used as phase tags to facilitate the product isolation by a precipitation method. Thus, while the elongation of glycopeptides was achieved in a solution of N-methylpyrrolidinone (NMP), the

  [反应-见正文] N-连接的糖肽是通过Fmoc方法由含有未保护的寡糖和其他简单氨基酸的糖基天冬酰胺合成的。游离的寡糖链用作相标签，以利于通过沉淀法分离产物。因此，尽管在N-甲基吡咯烷酮（NMP）的溶液中实现了糖肽的伸长，但是可以通过将醚加入反应混合物中来沉淀每个步骤的产物。该策略还消除了糖肽合成中碳水化合物脱保护的最后步骤。
• Direct deprotected glycosyl–asparagine ligation
  作者：Katie J. Doores、Yusuke Mimura、Raymond A. Dwek、Pauline M. Rudd、Tim Elliott、Benjamin G. Davis

  DOI：10.1039/b515472c

  日期：——

  A simple and efficient synthesis of N-linked glycoamino acids and glycopeptides from deprotected sugars using the Staudinger reaction.

  使用施陶丁格反应从脱保护的糖中简单高效地合成 N-连接糖氨基酸和糖肽。