N-[(1S)-1-[[(1S)-1-formyl-2-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]ethyl]carbamoyl]-3-methyl-butyl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide | 890648-76-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N-[(1S)-1-[[(1S)-1-formyl-2-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]ethyl]carbamoyl]-3-methyl-butyl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide
• 英文别名: 4-methoxy-N-((S)-4-methyl-1-oxo-1-(((S)-1-oxo-3-((S)-2-oxopyrrolidin-3-yl)propan-2-yl)amino)pentan-2-yl)-1H-indole-2-carboxamide；N-{(1S)-1-[({(1S)-1-formyl-2-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]ethyl}amino)carbonyl]-3-methylbutyl}-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide；4-methoxy-N-[(2S)-4-methyl-1-oxo-1-[[(2S)-1-oxo-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]pentan-2-yl]-1H-indole-2-carboxamide
• CAS: 890648-76-7
• 化学式: C₂₃H₃₀N₄O₅
• 分子量: 442.515
• InChiKey: QCRLRBSKQJIUTG-MPGHIAIKSA-N

物化性质

• 沸点：
  817.4±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.229±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2
• 重原子数：
  32
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.48
• 拓扑面积：
  129
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-[(1S)-1-[[(1S)-1-formyl-2-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]ethyl]carbamoyl]-3-methyl-butyl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide 在 sodium hydrogensulfite 作用下， 以 乙醇 、 水 、 乙酸乙酯 为溶剂， 反应 16.0h， 生成 [(2S)-1-hydroxy-2-[[(2S)-2-[(4-methoxy-1H-indole-2-carbonyl)amino]-4-methyl-pentanoyl] amino]-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propyl]sulfonyloxysodium
  参考文献：
  名称：

  Inhibitors of cysteine proteases and methods of use thereof

  摘要：

  该披露提供了具有战斗头的化合物及其在治疗医学疾病或紊乱，如病毒感染方面的用途。提供了制药组合物和制备各种带有战斗头的化合物的方法。这些化合物被认为能够抑制蛋白酶，如3C、CL-或3CL样蛋白酶。提供的示例化合物包括Formula II-I，其中R3、RB如下所示：

  公开号：

  US11124497B1
• 作为产物：
  描述：

  (alphaS,3S)-alpha-[(叔-丁基氧羰基)氨基]-2-氧代-3-吡咯烷丙酸甲酯 在 盐酸 、 4-二甲氨基吡啶 、 锂硼氢 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三氟乙酸 、 2-碘酰基苯甲酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 二甲基亚砜 、 乙酸乙酯 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 46.5h， 生成 N-[(1S)-1-[[(1S)-1-formyl-2-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]ethyl]carbamoyl]-3-methyl-butyl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  Inhibitors of cysteine proteases and methods of use thereof

  摘要：

  该披露提供了具有战斗头的化合物及其在治疗医学疾病或紊乱，如病毒感染方面的用途。提供了制药组合物和制备各种带有战斗头的化合物的方法。这些化合物被认为能够抑制蛋白酶，如3C、CL-或3CL样蛋白酶。提供的示例化合物包括Formula II-I，其中R3、RB如下所示：

  公开号：

  US11124497B1

文献信息

• [EN] PROTEASE INHIBITORS AS ANTIVIRALS<br/>[FR] INHIBITEURS DE PROTÉASE UTILISÉS COMME ANTIVIRAUX
  申请人：ACEA THERAPEUTICS INC

  公开号：WO2022256434A1

  公开（公告）日：2022-12-08

  Provided herein,inter alia, are compounds, pharmaceutical compositions and methods related to the treatment of viral infections caused by coronavirus or enterovirus. Provided herein are compounds of Formula (I), (II) and (III) and methods of using the compounds for therapy. These compounds are peptidomimetics that inhibit protease 3CL of a coronavirus, and are useful for treating conditions caused by viral infections, including COVID-19.

  本文提供了与治疗由冠状病毒或肠道病毒引起的病毒感染相关的化合物、药物组合物和治疗方法。本文提供了公式(I)、(II)和(III)化合物以及使用这些化合物进行治疗的方法。这些化合物是肽类模拟物，能够抑制冠状病毒的蛋白酶3CL，并且可用于治疗由病毒感染引起的疾病，包括COVID-19。
• Alkyne as a Latent Warhead to Covalently Target SARS-CoV-2 Main Protease
  作者：Chau Ngo、William Fried、Saba Aliyari、Joshua Feng、Chao Qin、Shilei Zhang、Hanjing Yang、Jean Shanaa、Pinghui Feng、Genhong Cheng、Xiaojiang S. Chen、Chao Zhang

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.3c00810

  日期：2023.9.14

  covalently modify Mpro as a latent warhead. Our biochemical and X-ray structural analyses revealed the irreversible formation of the vinyl-sulfide linkage between the alkyne and the catalytic cysteine of Mpro. Clickable probes based on the alkyne inhibitors were developed to measure target engagement, drug residence time, and off-target effects. The best alkyne-containing inhibitors potently inhibited SARS-CoV-2

  迫切需要改进治疗方法，以更好地控制持续的 COVID-19 大流行。主要蛋白酶 M pro在 SARS-CoV-2 复制中发挥着关键作用，因此成为抗病毒开发的一个有吸引力的靶点。我们寻求识别新型亲电子弹头，以有效、共价抑制 M pro 。通过比较安装在通用支架上的一组弹头与 M pro的功效，我们发现末端炔烃可以共价修饰 M pro作为潜在弹头。我们的生化和 X 射线结构分析揭示了炔烃和 M pro的催化半胱氨酸之间乙烯基硫键的不可逆形成。开发了基于炔烃抑制剂的可点击探针来测量靶标结合、药物停留时间和脱靶效应。最好的含炔抑制剂可有效抑制细胞感染模型中的 SARS-CoV-2 感染。我们的研究结果强调了炔烃作为潜在弹头针对病毒及其他物质中的胱氨酸蛋白酶的巨大潜力。
• WO2006/61714
  申请人：——

  公开号：——

  公开（公告）日：——
• INHIBITORS OF CYSTEINE PROTEASES AND METHODS OF USE THEREOF
  申请人：Pardes Biosciences, Inc.

  公开号：US20210355111A1

  公开（公告）日：2021-11-18

  The disclosure provides compounds with warheads and their use in treating medical diseases or disorders, such as viral infections. Pharmaceutical compositions and methods of making various compounds with warheads are provided. The compounds are contemplated to inhibit proteases, such as the 3C, CL- or 3CL-like protease.
• [EN] INHIBITORS OF CYSTEINE PROTEASES AND METHODS OF USE THEREOF<br/>[FR] INHIBITEURS DE CYSTÉINE PROTÉASES ET LEURS PROCÉDÉS D'UTILISATION
  申请人：PARDES BIOSCIENCES INC

  公开号：WO2021252644A1

  公开（公告）日：2021-12-16

  The disclosure provides compounds of formula II with warheads and their use in treating medical diseases or disorders, such as viral infections. Pharmaceutical compositions and methods of making various compounds with warheads are provided. The compounds are contemplated to inhibit proteases, such as the 3C, CL- or 3CL-like protease. Formula II