通过支架杂交策略设计了五个新系列的
吡咯稠合杂环,作为众所周知的微管
抑制剂芬司他汀的类似物。使用环亚
铵N-叶立德与
丙炔酸乙酯的1,3-偶极环加成作为关键步骤合成了化合物。然后评估所选化合物的抗癌活性和体外抑制微管蛋白聚合的能力。值得注意的是,
吡咯并[1,2-a]喹啉 10a 对大多数测试的
细胞系都有活性,在某些情况下比对照芬司他汀表现更好,最显着的是对肾癌
细胞系 A498 (GI50 27 nM),同时在体外抑制微管蛋白聚合。此外,该化合物预计具有良好的 A
DMET 特性。通过计算机对接实验研究了化合物 10a 和微管蛋白之间相互作用的分子细节,其次是分子动力学模拟和构型熵计算。值得注意的是,我们发现,在分子动力学模拟过程中,对接实验最初预测的一些相互作用并不稳定,但构型熵损失在所有三种情况下都是相似的。我们的结果表明,对于化合物10a,仅靠对接实验不足以充分描述靶标结合方面的相互作用细节,