Corroboration of Zn(<scp>ii</scp>)–Mg(<scp>ii</scp>)-tertiary structure interplays essential for the optimal catalysis of a phosphorothiolate thiolesterase ribozyme
作者:Tzu-Pin Wang、Yu-Chih Su、Yi Chen、Scott Severance、Chi-Ching Hwang、Yi-Ming Liou、Chia-Hui Lu、Kun-Liang Lin、Rui Jing Zhu、Eng-Chi Wang
DOI:10.1039/c8ra05083j
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the TW17 ribozyme specifically catalyzes phosphorothiolate thiolester hydrolysis. Metal titration studies of TW17 ribozyme catalysis in the presence of Zn2+ alone, Zn2+ and Mg2+, and Zn2+ and [Co(NH3)6]3+ supported our findings that Zn2+ is absolutely required for ribozyme catalysis, and indicated that optimal ribozyme catalysis involves the presence of outer-sphere and one inner-sphere Mg2+. A survey
TW17 核酶是一种选自人工 RNA 库的催化 RNA,对硫代磷酸酯硫酯键的 Zn 2+依赖性水解具有特异性。在这里,我们描述了鸟苷 α-硫代单磷酸盐的有机合成以及选择和表征 TW17 核酶以及破译核酶催化机制所需的底物。通过用结构修饰的底物连续替换最初与 RNA 池结合的底物,我们证明了 TW17 核酶特异性地催化硫代磷酸酯水解。单独存在Zn 2+、Zn 2+和Mg 2+以及Zn 2+存在下TW17核酶催化的金属滴定研究和[Co(NH 3 ) 6 ] 3+支持我们的发现,核酶催化绝对需要Zn 2+,并表明最佳核酶催化涉及外球和一个内球Mg 2+的存在。对不同 pH 值下 TW17 核酶活性的调查表明,核酶的活性严重依赖于碱性条件。此外,用反式活性催化构建的含有GNRA四环的核酶提供催化和多底物周转效率,显着高于缺乏GNRA四环的核酶。该研究支持 Zn 2+、Mg 2+的重要作用和 GNRA