A structure-based design approach to advance the allyltyrosine-based series of HIV integrase inhibitors
作者:Christopher P. Gordon、Neal Dalton、Nicholas Vandegraaff、John Deadman、David I. Rhodes、Jonathan A. Coates、Stephen G. Pyne、Renate Griffith、John B. Bremner、Paul A. Keller
DOI:10.1016/j.tet.2017.11.052
日期:2018.3
of mid-2017, only one structure of the human immunodeficiency virus (HIV) integrase core domain co-crystallised with an active site inhibitor was reported. In this structure (1QS4), integrase is complexed with a diketo-acid based strand-transfer inhibitor (INSTI). This structure has been a preferred platform for the structure-based design of INSTIs despite concerns relating to structural irregularities
截至2017年中,仅报道了与活性位点抑制剂共结晶的人类免疫缺陷病毒(HIV)整合酶核心结构域的一种结构。在此结构(1QS4)中,整合酶与基于二酮酸的链转移抑制剂(INSTI)复合。尽管担心因晶体堆积效应引起的结构不规则,但该结构已成为INSTI基于结构设计的首选平台。对目前所报告的297个整合酶催化核心结构库的一项调查表明,复杂结构1QS4中活性位点的解剖结构相对于所检查的所有其他结构表现出细微的变化。因此,将1QS4结构用于对接研究。从27个烯丙基酪氨酸类似物的对接中HIV感染的人类T细胞中50 ±10±5μM的值。在3'-加工和链转移试验的结合中,“内部”化合物库的另外对接发现了基于甲基酯的腈衍生物,其IC 50值为0.5μM。