N²-(isobutanoyl)-9-(methoxycarbonylmethyl)guanine | 172405-19-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N²-(isobutanoyl)-9-(methoxycarbonylmethyl)guanine
• 英文别名: N2-(Isobutanoyl)-N9-methyloxycarbonylmethylguanine；methyl 2-[2-(2-methylpropanoylamino)-6-oxo-1H-purin-9-yl]acetate
• CAS: 172405-19-5
• 化学式: C₁₂H₁₅N₅O₄
• 分子量: 293.282
• InChiKey: UNIYEIUPJYEKCJ-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 密度：
  1.51±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.1
• 重原子数：
  21
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.42
• 拓扑面积：
  115
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N²-(isobutanoyl)-9-(methoxycarbonylmethyl)guanine 在 sodium hydroxide 作用下， 以 水 为溶剂， 以62%的产率得到2-(2-异丁酰胺-6-氧代-1H-嘌呤-9(6h)-基)乙酸
  参考文献：
  名称：

  使用新型单甲氧基三苯甲基保护基策略合成聚酰胺核酸

  摘要：

  描述了用于合成聚酰胺核酸（PNA）的新型单甲氧基三苯甲基（Mmt）保护的单体的制备。碱不稳定的酰基型核碱基保护基和琥珀酰连接的固相支持物的使用提供了类似于标准寡核苷酸合成条件的合成策略。该策略已成功应用于合成混合碱基序列的PNA。

  DOI：

  10.1016/0040-4020(95)00766-2
• 作为产物：
  描述：

  鸟嘌呤 在 sodium hydride 、 三乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 N²-(isobutanoyl)-9-(methoxycarbonylmethyl)guanine
  参考文献：
  名称：

  使用新型单甲氧基三苯甲基保护基策略合成聚酰胺核酸

  摘要：

  描述了用于合成聚酰胺核酸（PNA）的新型单甲氧基三苯甲基（Mmt）保护的单体的制备。碱不稳定的酰基型核碱基保护基和琥珀酰连接的固相支持物的使用提供了类似于标准寡核苷酸合成条件的合成策略。该策略已成功应用于合成混合碱基序列的PNA。

  DOI：

  10.1016/0040-4020(95)00766-2

文献信息

• Substituted N-ethylglycine derivatives for preparing PNA and PNA/DNA
  申请人：Hoechst Aktiengesellschaft

  公开号：US06075143A1

  公开（公告）日：2000-06-13

  There are described N-ethylglycine derivatives of the formula I ##STR1## in which PG is a urethane-type or trityl-type amino protective group which is labile to weak acids, X is NH, O or S, Y is CH.sub.2, NH or O, and B' are bases customary in nucleotide chemistry, the exocyclic amino or hydroxyl groups of which being protected by suitable, known protective groups, or are base substitute compounds, and their salts with tert-organic bases, as well as a process for their preparation. The N-ethylglycine derivatives of the formula I are used in the preparation of PNA and PNA/DNA hybrids.

  描述了公式I的N-乙基甘氨酸衍生物，其中PG是对弱酸敏感的脲型或三甲基基氨基保护基，X为NH、O或S，Y为CH.sub.2、NH或O，B'为核苷酸化学中常见的碱，其外环氨基或羟基团被适当的已知保护基保护，或者是基替代化合物，以及它们与叔有机碱的盐，以及它们的制备方法。公式I的N-乙基甘氨酸衍生物被用于PNA和PNA/DNA杂交物的制备。
• A Regioselective Synthesis of Alkyl 2-(Guanin-9-yl)acetates as PNA Building Blocks from 7-(4-Nitrobenzyl)guanine Derivatives
  作者：Györgyi Ferenc、Péter Forgó、Zoltán Kele、Lajos Kovács

  DOI：10.1135/cccc20050085

  日期：——

  Guanine derivatives substituted at N⁷ with 4-R-benzyl groups (R = H, MeO, NO₂) have been evaluated in the regioselective N⁹-alkylation of guanine. Given the capricious removal of (substituted) benzyl groups from guanine derivatives and pent-4-enoylation of guaninium hydrochloride, an improved alternative approach has been elaborated consisting in the pent-4-enoylation and per-O-acetylation of guanosine (8), 4-nitrobenzylation at N⁷ followed by N-glycoside hydrolysis (10), N⁹-alkylation (13) and deprotection with sodium dithionite to afford the peptide nucleic acid building block tert-butyl [N²-(pent-4-enoyl)guanin-9-yl]- acetate (15) in 36% overall yield. This avoids N⁷ regioisomer formation, solubility problems and any chromatographic purification. A remarkable influence of the O- and/or N²-acyl groups on the stability of N-glycosidic bond and reactivity of 2-amino group was observed. The structure of a pyrimidine by-product 12 arising from the imidazole ring-opening of guaninium salt 4d in alkaline medium has been elucidated by 2D NMR.

  鸟嘌呤衍生物在N7位置被4-R-苄基基团（R = H，MeO，NO2）取代，已在鸟嘌呤的N9-烷基化中进行评估。鉴于从鸟嘌呤衍生物中（取代的）苄基基团的善变去除和鸟嘌呤盐酸盐的pent-4-烯酰化，已制定了一种改进的替代方法，包括pent-4-烯酰化和guanosine的per-O-乙酰化（8），N7位置的4-硝基苄基化，后接N-糖苷水解（10），N9-烷基化（13）和用亚硫酸钠去保护以得到肽核酸构建块tert-丁基[N2-(pent-4-烯酰)鸟嘌呤-9-基]-乙酸酯（15），总收率为36%。这避免了N7位置异构体的形成，溶解度问题和任何色谱纯化。观察到O-和/或N2-酰基对N-糖苷键的稳定性和2-氨基基团的反应性具有显著影响。通过2D NMR阐明了在碱性介质中由鸟嘌呤盐4d的咪唑环开环产生的嘧啶副产物12的结构。
• The synthesis of polyamide nucleic acids using a novel monomethoxytrityl protecting-group strategy
  作者：David W. Will、Gerhard Breipohl、Dietrich Langner、Jochen Knolle、Eugen Uhlmann

  DOI：10.1016/0040-4020(95)00766-2

  日期：1995.10

  The preparation of novel monomethoxytrityl (Mmt) protected monomers for the synthesis of polyamide nucleic acids (PNAs) is described. The use of base-labile acyl-type nucleobase protecting groups and of a succinyl-linked solid-support offers a synthetic strategy similar to standard oligonucleotide synthesis conditions. This strategy has been successfully applied for the synthesis of PNAs of mixed base

  描述了用于合成聚酰胺核酸（PNA）的新型单甲氧基三苯甲基（Mmt）保护的单体的制备。碱不稳定的酰基型核碱基保护基和琥珀酰连接的固相支持物的使用提供了类似于标准寡核苷酸合成条件的合成策略。该策略已成功应用于合成混合碱基序列的PNA。