对新抗生素的迫切需求对靶向未开发的重要细胞过程提出了挑战。
胸苷酸的
生物合成就是这样一种过程,因为它在DNA复制和修复中起着至关重要的作用。
胸苷酸合酶(
TS)催化
生物合成5-
三磷酸胸苷(
TTP)的关键步骤,这是DNA合成和修复所需的基本组成部分。迄今为止,由于
TS抑制剂对人体酶和微
生物酶的特异性不足,因此仅被成功用于抗癌治疗。但是,在一系列致病细菌中发现了一个新的
TS酶家族(ThyX),该家族在结构和生化上与“经典”
TS(ThyA)不同,这为开发选择性ThyX
抑制剂作为有效的抗菌药物提供了可能。这里,1)用结核分枝杆菌从公开的晶体结构开始,使用分子模型探索ThyX酶,并通过NMR实验进一步证实。虽然化合物1的脱氧
尿酸(d
UMP)部分占据了ThyX中天然底物的腔,但其余的
配体(“ 5-炔基尾巴”)延伸至酶的四个亚基中的两个之间。通过置换Tyr 44.C,Tyr 108.A和Lys 165.A