(2-(naphthalen-1-yl)acetyl)-L-proline | 32667-98-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: (2-(naphthalen-1-yl)acetyl)-L-proline
• 英文别名: (2S)-1-(2-naphthalen-1-ylacetyl)pyrrolidine-2-carboxylic acid
• CAS: 32667-98-4
• 化学式: C₁₇H₁₇NO₃
• 分子量: 283.327
• InChiKey: KIAFPOIHXUTYGB-HNNXBMFYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.7
• 重原子数：
  21
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.29
• 拓扑面积：
  57.6
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2-(naphthalen-1-yl)acetyl)-L-proline 在 N-甲基吗啉 、 盐酸 、 4-二甲氨基吡啶 、 N-羟基-7-氮杂苯并三氮唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 0.5h， 生成 (2S,4S)–N-(2-(2-(2-((S)-6-amino-2-((S)-1-(2-(naphthalen-1-yl)acetyl)pyrrolidine-2-carboxamido)hexanamido)benzamido)ethoxy)-4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)-4-hydroxy-1-((S)-3-methyl-2-(1-oxoisoindolin-2-yl)butanoyl)-pyrrolidine-2-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  Design and characterization of PROTAC degraders specific to protein N-terminal methyltransferase 1

  摘要：

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2022.114830
• 作为产物：
  描述：

  methyl (2S)-1-(2-naphthalen-1-ylacetyl)pyrrolidine-2-carboxylate 在 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 为溶剂， 以1.71 g的产率得到(2-(naphthalen-1-yl)acetyl)-L-proline
  参考文献：
  名称：

  Design and characterization of PROTAC degraders specific to protein N-terminal methyltransferase 1

  摘要：

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2022.114830

文献信息

• Simple and Effective Synthetic Approach to Chiral 2-Amino-4-piperidinyl Pyridine Derivatives
  作者：Hua Tian、Qing-Wen Liu、Hao Xu、Wen-Bo Huang、Jian Lin、Suo-Qin Zhang

  DOI：10.1080/00397911.2011.565453

  日期：2012.9.15

  N-(4-(piperidin-1-yl)pyridin-2-yl)amide derivatives as potential stereoselective catalysts. The key intermediate, 2-amino-4-piperidinyl pyridine, was obtained by nucleophilic substitution of 2-amino-4-chloropyridine with piperidine in good yields (up to 96%). The total control of enantioselectivity was obtained for the synthesis of L-proline and (R)-1,1′-bi(2-naphthol) derivatives. GRAPHICAL ABSTRACT

  摘要 已开发出一种简便的方法来提供一系列新型手性 N-(4-(哌啶-1-基)吡啶-2-基)酰胺衍生物作为潜在的立体选择性催化剂。关键中间体2-氨基-4-哌啶基吡啶是通过2-氨基-4-氯吡啶与哌啶的亲核取代获得的，产率高达96%。L-脯氨酸和(R)-1,1'-双(2-萘酚)衍生物的合成获得了对映选择性的完全控制。图形概要
• Improved Cell-Potent and Selective Peptidomimetic Inhibitors of Protein N-Terminal Methyltransferase 1
  作者：Guangping Dong、Iredia D. Iyamu、Jonah Z. Vilseck、Dongxing Chen、Rong Huang

  DOI：10.3390/molecules27041381

  日期：——

  Protein N-terminal methyltransferase 1 (NTMT1) recognizes a unique N-terminal X-P-K/R motif (X represents any amino acid other than D/E) and transfers 1–3 methyl groups to the N-terminal region of its substrates. Guided by the co-crystal structures of NTMT1 in complex with the previously reported peptidomimetic inhibitor DC113, we designed and synthesized a series of new peptidomimetic inhibitors. Through a focused optimization of DC113, we discovered a new cell-potent peptidomimetic inhibitor GD562 (IC50 = 0.93 ± 0.04 µM). GD562 exhibited improved inhibition of the cellular N-terminal methylation levels of both the regulator of chromosome condensation 1 and the oncoprotein SET with an IC50 value of ~50 µM in human colorectal cancer HCT116 cells. Notably, the inhibitory activity of GD562 for the SET protein increased over 6-fold compared with the previously reported cell-potent inhibitor DC541. Furthermore, GD562 also exhibited over 100-fold selectivity for NTMT1 against several other methyltransferases. Thus, this study provides a valuable probe to investigate the biological functions of NTMT1.

  蛋白N-端甲基转移酶1（NTMT1）识别一种独特的N-端X-P-K/R基序（X代表除D/E外的任何氨基酸），并向其底物的N-端区域转移1-3个甲基基团。在NTMT1与先前报道的肽类类似物抑制剂DC113的共晶结构的指导下，我们设计并合成了一系列新的肽类类似物抑制剂。通过对DC113的重点优化，我们发现了一种新的细胞有效的肽类类似物抑制剂GD562（IC50 = 0.93±0.04 µM）。GD562在人类结肠癌HCT116细胞中表现出改善的调节染色体凝聚1和致癌蛋白SET的细胞N-端甲基化水平抑制作用，其IC50值约为50 µM。值得注意的是，与先前报道的细胞有效抑制剂DC541相比，GD562对SET蛋白的抑制活性增加了6倍以上。此外，GD562还表现出对几种其他甲基转移酶超过100倍的NTMT1选择性。因此，本研究提供了一种有价值的探针，用于研究NTMT1的生物学功能。
• Structure-based Discovery of Cell-Potent Peptidomimetic Inhibitors for Protein N-Terminal Methyltransferase 1
  作者：Dongxing Chen、Guangping Dong、Youchao Deng、Nicholas Noinaj、Rong Huang

  DOI：10.1021/acsmedchemlett.1c00012

  日期：2021.3.11
• Design and characterization of PROTAC degraders specific to protein N-terminal methyltransferase 1
  作者：Qilong Zhou、Wei Wu、Kaimin Jia、Guangyan Qi、Xiuzhi Susan Sun、Ping Li

  DOI：10.1016/j.ejmech.2022.114830

  日期：2022.12