N6-[(1S)-2-{[(1R)-1-Carboxy-2-methylpropyl]oxy}-1-(mercaptocarbonyl)-2-oxoethyl]-6-oxo-L-lysine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 肽模拟物
• 英文名称: N6-[(1S)-2-{[(1R)-1-Carboxy-2-methylpropyl]oxy}-1-(mercaptocarbonyl)-2-oxoethyl]-6-oxo-L-lysine
• 英文别名: (2S)-2-amino-6-[[(2R)-1-[(1R)-1-carboxy-2-methylpropoxy]-1,3-dioxo-3-sulfanylpropan-2-yl]amino]-6-oxohexanoic acid
• 化学式: C₁₄H₂₂N₂O₈S
• 分子量: 378.403
• InChiKey: INECXHJFYVKZHW-FXBDTBDDSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.2
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.64
• 拓扑面积：
  174
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  (L,L,D) δ-(α-aminoadipolyl)-Cys-Val 在 Isopenicillin N Synthase 、 铁粉 、 氧气 作用下， 生成 N6-[(1S)-2-{[(1R)-1-Carboxy-2-methylpropyl]oxy}-1-(mercaptocarbonyl)-2-oxoethyl]-6-oxo-L-lysine
  参考文献：
  名称：

  异青霉素 N 合酶介导缩酚酸底物类似物中硫醇盐氧化为磺酸盐：对氧结合的影响和与腈水合酶的联系？

  摘要：

  异青霉素 N 合酶 (IPNS) 是一种非血红素铁氧化酶，可催化 β-内酰胺抗生素生物合成的核心步骤：线性三肽 delta-L-α-氨基己二酰-L-半胱氨酰-D-缬氨酸 (ACV) 的氧化环化异青霉素 N (IPN)。ACV 类似物 delta-L-α-氨基己二酰-L-半胱氨酸（1-（S）-羧基-2-硫甲基）乙酯（ACOmC）已合成为 IPNS 催化的机械探针，并用酶结晶。厌氧 IPNS/Fe(II)/ACOmC 复合物的晶体结构确定为 1.80 A 分辨率，揭示了高度拥挤的活性位点区域。通过将这些厌氧生长的晶体暴露在高压氧气中，观察到了意想不到的次磺酸盐产物，在 IPNS 活性位点内与铁络合。提出了形成次磺酸盐-铁络合物的机制，并且似乎 ACOmC 在其与 IPNS 反应的最早阶段遵循不同的反应途径。因此，似乎氧（共底物）在与之前 IPNS 研究中观察到的不同的位点结合，在此过程中从铁中置换了水配体。以前在

  DOI：

  10.1021/ja8005397

文献信息

• Isopenicillin N Synthase Mediates Thiolate Oxidation to Sulfenate in a Depsipeptide Substrate Analogue: Implications for Oxygen Binding and a Link to Nitrile Hydratase?
  作者：Wei Ge、Ian J. Clifton、Jeanette E. Stok、Robert M. Adlington、Jack E. Baldwin、Peter J. Rutledge

  DOI：10.1021/ja8005397

  日期：2008.8.1

  Isopenicillin N synthase (IPNS) is a nonheme iron oxidase that catalyzes the central step in the biosynthesis of beta-lactam antibiotics: oxidative cyclization of the linear tripeptide delta-L-alpha-aminoadipoyl-L-cysteinyl-D-valine (ACV) to isopenicillin N (IPN). The ACV analogue delta-L-alpha-aminoadipoyl-L-cysteine (1-(S)-carboxy-2-thiomethyl)ethyl ester (ACOmC) has been synthesized as a mechanistic

  异青霉素 N 合酶 (IPNS) 是一种非血红素铁氧化酶，可催化 β-内酰胺抗生素生物合成的核心步骤：线性三肽 delta-L-α-氨基己二酰-L-半胱氨酰-D-缬氨酸 (ACV) 的氧化环化异青霉素 N (IPN)。ACV 类似物 delta-L-α-氨基己二酰-L-半胱氨酸（1-（S）-羧基-2-硫甲基）乙酯（ACOmC）已合成为 IPNS 催化的机械探针，并用酶结晶。厌氧 IPNS/Fe(II)/ACOmC 复合物的晶体结构确定为 1.80 A 分辨率，揭示了高度拥挤的活性位点区域。通过将这些厌氧生长的晶体暴露在高压氧气中，观察到了意想不到的次磺酸盐产物，在 IPNS 活性位点内与铁络合。提出了形成次磺酸盐-铁络合物的机制，并且似乎 ACOmC 在其与 IPNS 反应的最早阶段遵循不同的反应途径。因此，似乎氧（共底物）在与之前 IPNS 研究中观察到的不同的位点结合，在此过程中从铁中置换了水配体。以前在