Potent and selective covalent inhibition of the papain-like protease from SARS-CoV-2
作者:Brian C. Sanders、Suman Pokhrel、Audrey D. Labbe、Irimpan I. Mathews、Connor J. Cooper、Russell B. Davidson、Gwyndalyn Phillips、Kevin L. Weiss、Qiu Zhang、Hugh O’Neill、Manat Kaur、Jurgen G. Schmidt、Walter Reichard、Surekha Surendranathan、Jyothi Parvathareddy、Lexi Phillips、Christopher Rainville、David E. Sterner、Desigan Kumaran、Babak Andi、Gyorgy Babnigg、Nigel W. Moriarty、Paul D. Adams、Andrzej Joachimiak、Brett L. Hurst、Suresh Kumar、Tauseef R. Butt、Colleen B. Jonsson、Lori Ferrins、Soichi Wakatsuki、Stephanie Galanie、Martha S. Head、Jerry M. Parks
DOI:10.1038/s41467-023-37254-w
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interferon-stimulated gene 15 protein from host proteins. As a result, PLpro is a promising target for inhibition by small-molecule therapeutics. Here we design a series of covalent inhibitors by introducing a peptidomimetic linker and reactive electrophile onto analogs of the noncovalent PLpro inhibitor GRL0617. The most potent compound inhibits PLpro with kinact/KI = 9,600 M−1 s−1, achieves sub-μM EC50 values against
需要直接作用的抗病毒药物来对抗 2019 年冠状病毒病 (COVID-19),该疾病是由严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 引起的。SARS-CoV-2 的 Nsp3 的类木瓜蛋白酶 (PLpro) 结构域对于病毒复制至关重要。此外,PLpro 通过从宿主蛋白中裂解泛素和干扰素刺激的基因 15 蛋白来调节宿主免疫反应。因此,PLpro 是小分子治疗抑制的一个有前途的靶点。在这里,我们通过将拟肽接头和反应性亲电子试剂引入到非共价 PLpro 抑制剂 GRL0617 的类似物上,设计了一系列共价抑制剂。最有效的化合物可抑制 PLpro,k inact /K I = 9,600 M −1 s −1 ,针对哺乳动物细胞系中的三种 SARS-CoV-2 变体达到亚μM EC 50值,并且不抑制一组人类去泛素酶(DUB)抑制剂浓度 >30 μM。与 PLpro 结合的化合物的 X