7-Deaza-7-propargylamino-ddGTP | 114748-61-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡咯并嘧啶类
• 英文名称: 7-Deaza-7-propargylamino-ddGTP
• 英文别名: [[(2S,5R)-5-[2-amino-5-(3-aminoprop-1-ynyl)-4-oxo-3H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl]oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl] phosphono hydrogen phosphate
• CAS: 114748-61-7
• 化学式: C₁₄H₂₀N₅O₁₂P₃
• 分子量: 543.26
• InChiKey: LJJGDWYGTRBWBZ-VHSXEESVSA-N

物化性质

• 密度：
  2.16±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -7.3
• 重原子数：
  34
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.43
• 拓扑面积：
  268
• 氢给体数：
  7
• 氢受体数：
  14

制备方法与用途

生物活性方面，7-Deaza-7-propargylamino-ddGTP 是双氧鸟苷三磷酸（ddGTP）的一种类似物，适用于基因测序。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  ferrocene carboxylic acid N-hydroxysuccinimide ester 、 7-Deaza-7-propargylamino-ddGTP 在 碳酸氢钠 、 sodium carbonate 作用下， 以 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 6.17h， 生成
  参考文献：
  名称：

  Electrochemical primer extension for the detection of single nucleotide polymorphisms in the cardiomyopathy associated MYH7 gene

  摘要：

  我们报道了二氧基核苷酸（ddNTPs）的标记，用于基于电化学阵列的引物延伸，用于检测单核苷酸多态性（SNPs）。

  DOI：

  10.1039/c5cc07762a
• 作为产物：
  描述：

  4-甲氧基-2-甲基磺酰基-7h-吡咯并(2,3-d)嘧啶 在 copper(l) iodide 、 四(三苯基膦)钯 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 ammonium hydroxide 、 N-碘代丁二酰亚胺 、 甲酸 、 三正丁基氢锡 、 三乙胺 、 间氯过氧苯甲酸 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 六甲基磷酰三胺 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 6.0h， 生成 7-Deaza-7-propargylamino-ddGTP
  参考文献：
  名称：

  Confalone, Pat. N., Journal of Heterocyclic Chemistry, 1990, vol. 27, # 1, p. 31 - 46

  摘要：

  DOI：

文献信息

• NUCLEOTIDE ANALOGUES
  申请人：Intelligent Biosystems, Inc.

  公开号：US20170130051A1

  公开（公告）日：2017-05-11

  The present invention provides methods, compositions, mixtures and kits utilizing deoxynucleoside triphosphates comprising a 3′-O position capped by a group comprising methylenedisulfide as a cleavable protecting group and a detectable label reversibly connected to the nucleobase of said deoxynucleoside. Such compounds provide new possibilities for future sequencing technologies, including but not limited to Sequencing by Synthesis.

  本发明提供了利用包含由甲亚砜二硫醚作为可裂解保护基团的3'-O位置封端的脱氧核苷三磷酸的方法、组合物、混合物和试剂盒，以及可逆地连接到所述脱氧核苷的核碱基的可检测标签。这些化合物为未来的测序技术提供了新的可能性，包括但不限于合成测序。
• 化合物、其制备方法与用途
  申请人：湖北华大基因研究院

  公开号：CN114621306A

  公开（公告）日：2022-06-14

  本发明提出了化合物、其制备方法与用途。所述化合物具有式(Ⅰ)所示结构，该化合物作为Linker，通过两步反应即可完成拼接，所得拼接化合物具有很好的化学稳定性和光学性质，用于基因测序，该合成路线快速、直接、高效，且原子经济性高、操作简便、低成本，易于大规模生产，具有广泛的应用前景。
• Nucleotide analogues
  申请人：QIAGEN WALTHAM, INC.

  公开号：US10301346B2

  公开（公告）日：2019-05-28

  The present invention provides methods, compositions, mixtures and kits utilizing deoxynucleoside triphosphates comprising a 3′-O position capped by a group comprising methylenedisulfide as a cleavable protecting group and a detectable label reversibly connected to the nucleobase of said deoxynucleoside. Such compounds provide new possibilities for future sequencing technologies, including but not limited to Sequencing by Synthesis.

  本发明提供了利用脱氧核苷三磷酸酯的方法、组合物、混合物和试剂盒，该脱氧核苷三磷酸酯包含一个 3′-O 位点，该位点被一个包含亚甲基二硫化物的基团封盖，该基团是一个可裂解的保护基团，以及一个与所述脱氧核苷的核碱基可逆连接的可检测标签。这种化合物为未来的测序技术提供了新的可能性，包括但不限于合成测序技术。
• Methods of using nucleotide analogues
  申请人：Intelligent BioSystems, Inc.

  公开号：US10273539B2

  公开（公告）日：2019-04-30

  The present invention provides methods, compositions, mixtures and kits utilizing deoxynucleoside triphosphates comprising a 3′-O position capped by a group comprising methylenedisulfide as a cleavable protecting group and a detectable label reversibly connected to the nucleobase of said deoxynucleoside. Such compounds provide new possibilities for future sequencing technologies, including but not limited to Sequencing by Synthesis.

  本发明提供了利用脱氧核苷三磷酸酯的方法、组合物、混合物和试剂盒，该脱氧核苷三磷酸酯包含一个 3′-O 位点，该位点被一个包含亚甲基二硫化物的基团封盖，该基团是一个可裂解的保护基团，以及一个与所述脱氧核苷的核碱基可逆连接的可检测标签。这种化合物为未来的测序技术提供了新的可能性，包括但不限于合成测序技术。
• [EN] NUCLEOTIDE ANALOGUES AND USE THEREOF FOR NUCLEIC ACID SEQUENCING AND ANALYSIS<br/>[FR] ANALOGUES NUCLÉOTIDIQUES ET LEUR UTILISATION POUR LE SÉQUENÇAGE ET L'ANALYSE D'ACIDES NUCLÉIQUES
  申请人：UNIV COLUMBIA

  公开号：WO2019178393A9

  公开（公告）日：2019-10-24