ambiguine H | 929706-01-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: ambiguine H
• 英文别名: (6aS,9R,10R,10aS)-9-ethenyl-10-isocyano-6,6,9-trimethyl-1-(2-methylbut-3-en-2-yl)-2,6,6a,7,8,9,10,10a-octahydronaphtho[1,2,3-cd]indole；(2S,3R,4R,7S)-4-ethenyl-3-isocyano-4,8,8-trimethyl-15-(2-methylbut-3-en-2-yl)-14-azatetracyclo[7.6.1.02,7.013,16]hexadeca-1(15),9(16),10,12-tetraene
• CAS: 929706-01-4
• 化学式: C₂₆H₃₂N₂
• 分子量: 372.553
• InChiKey: DBOXZAYTFKDLHJ-CSOFANMDSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.1
• 重原子数：
  28
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  20.2
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  1

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  ambiguine H 在 ferrous ammonium sulphate 、 recombinant AmbO₅ halogenase 、 2-氧代-戊二酸离子(2-) 作用下， 以 aq. buffer 为溶剂， 反应 0.5h， 生成 ambiguine A isonitrile
  参考文献：
  名称：

  Ambiguine生物碱生物中混杂的非血红素铁卤化酶的发现：对小分子脂肪族碳后期卤化的可进化酶家族的影响。

  摘要：

  阐明歧义吲哚生物碱生物发生中的酶促氯化氯化时机，导致了AmbO5蛋白作为混杂的非血红素铁脂族卤化酶的发现和表征。研究表明，AmbO5能够通过后期脂肪族CH基团官能化作用，用氯选择性地修饰七个结构上不同的歧义碱，菲舍尔吲哚和卤代吲哚生物碱。AmbO5与先前表征的脂族卤化酶同源物WelO5的交叉比较具有受限的底物范围，导致鉴定了对底物耐受性和特异性很重要的C端序列基序。在鉴定的序列基序内对WelO5的18个残基进行诱变导致功能性突变体具有与AmbO5相同的扩展底物范围，但是野生型酶的底物特异性却发生了变化。这些观察结果共同证明了在Hapalindole型生物碱生物发生的背景下AmbO5 / WelO5酶二重体的可进化性质，并暗示了它们对设计者生物催化的未来发展的希望，以选择性地修饰小分子中未活化的脂肪碳中心。与卤素。

  DOI：

  10.1002/anie.201601447
• 作为产物：
  描述：

  (2R,5S,6S)-6-(4-bromo-1H-indol-3-yl)-2-ethenyl-2-methyl-5-prop-1-en-2-ylcyclohexan-1-one 在 光气 、 trans-di(μ-acetato)bis[o-(di-o-tolylphosphino)benzyl]dipalladium(II) 、 次氯酸叔丁酯 、 ammonium acetate 、 四丁基溴化铵 、 sodium formate 、 sodium cyanoborohydride 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 、 苯 为溶剂， 反应 10.71h， 生成 ambiguine H
  参考文献：
  名称：

  （-）-Hapalindole U和（+）-Ambiguine H的可扩展总合成。

  摘要：

  蓝细菌的Stigonemataceae家族生产一类与生物遗传相关的吲哚天然产物，其中包括ha吲哚和双歧杆菌。在此全文中，通过八步，无对映体特异性，无保护基团的（-）-四氢吲哚U的全合成，提出了通往四环cyclic吲哚家族的实用途径，其特征在于氧化吲哚-烯醇酸酯偶联。以克级获得哈达吲哚U，通过异腈辅助的吲哚的异戊烯基化再进行光致碎裂级联反应，完成了含糊生物碱的第一个全合成（+）-含糊精H。

  DOI：

  10.1016/j.tet.2014.11.010

文献信息

• Discovery of a Calcium-Dependent Enzymatic Cascade for the Selective Assembly of Hapalindole-Type Alkaloids: On the Biosynthetic Origin of Hapalindole U
  作者：Qin Zhu、Xinyu Liu

  DOI：10.1002/anie.201703932

  日期：2017.7.24

  to the discovery of an unprecedented calcium-dependent AmbU1-AmbU4 enzymatic complex for the selective formation of 4. This discovery refuted the intermediacy of 3 and bridged the missing links in the early-stage biosynthesis of ambiguines. This work further established the isomerocyclases involved in the biogenesis of hapalindole-type alkaloids as a new family of calcium-dependent enzymes, where the

  Hapalindole U（4）是经过验证的生物合成前体ambiguine生物碱（Angew。化学式诠释。埃德。2016，55，5780），它的生物遗传起源仍然不明。最近AmbU4（或FamC1）蛋白在ambiguine生物合成途径编码的发现（J.化学会会志。2015，137，15366），即可以重新排列和环化geranylated假吲哚（一个isomerocyclase 2），以先前未知的12- epi -hapalindole U（3）提出了一个问题，即3是否是4的直接前体或有限的体外实验产生的伪影。在这里，我们报告一种系统的方法，导致发现了史无前例的钙依赖性AmbU1-AmbU4酶促复合物，以选择性形成4。这一发现驳斥了3的中间性，并在歧义的早期生物合成中弥补了缺失的联系。这项工作进一步确立了与哈达吲哚型生物碱的生物发生有关的异构环化酶，这是一个新的钙依赖性酶家族，其中金属离子对它们的酶促活性和选择性至关重要。
• Scalable total syntheses of (−)-hapalindole U and (+)-ambiguine H
  作者：Thomas J. Maimone、Yoshihiro Ishihara、Phil S. Baran

  DOI：10.1016/j.tet.2014.11.010

  日期：2015.6

  produces a class of biogenetically related indole natural products that include hapalindoles and ambiguines. In this full account, a practical route to the tetracyclic hapalindole family is presented by way of an eight-step, enantiospecific, protecting-group-free total synthesis of (-)-hapalindole U that features an oxidative indole-enolate coupling. With gram-scale access to hapalindole U, the first total

  蓝细菌的Stigonemataceae家族生产一类与生物遗传相关的吲哚天然产物，其中包括ha吲哚和双歧杆菌。在此全文中，通过八步，无对映体特异性，无保护基团的（-）-四氢吲哚U的全合成，提出了通往四环cyclic吲哚家族的实用途径，其特征在于氧化吲哚-烯醇酸酯偶联。以克级获得哈达吲哚U，通过异腈辅助的吲哚的异戊烯基化再进行光致碎裂级联反应，完成了含糊生物碱的第一个全合成（+）-含糊精H。
• Discovery of a Promiscuous Non-Heme Iron Halogenase in Ambiguine Alkaloid Biogenesis: Implication for an Evolvable Enzyme Family for Late-Stage Halogenation of Aliphatic Carbons in Small Molecules
  作者：Matthew L. Hillwig、Qin Zhu、Kuljira Ittiamornkul、Xinyu Liu

  DOI：10.1002/anie.201601447

  日期：2016.5.4

  sequence motif important for substrate tolerance and specificity. Mutagenesis of 18 residues of WelO5 within the identified sequence motif led to a functional mutant with an expanded substrate scope identical to AmbO5, but an altered substrate specificity from the wild‐type enzymes. These observations collectively provide evidence on the evolvable nature of AmbO5/WelO5 enzyme duo in the context of hapalindole‐type

  阐明歧义吲哚生物碱生物发生中的酶促氯化氯化时机，导致了AmbO5蛋白作为混杂的非血红素铁脂族卤化酶的发现和表征。研究表明，AmbO5能够通过后期脂肪族CH基团官能化作用，用氯选择性地修饰七个结构上不同的歧义碱，菲舍尔吲哚和卤代吲哚生物碱。AmbO5与先前表征的脂族卤化酶同源物WelO5的交叉比较具有受限的底物范围，导致鉴定了对底物耐受性和特异性很重要的C端序列基序。在鉴定的序列基序内对WelO5的18个残基进行诱变导致功能性突变体具有与AmbO5相同的扩展底物范围，但是野生型酶的底物特异性却发生了变化。这些观察结果共同证明了在Hapalindole型生物碱生物发生的背景下AmbO5 / WelO5酶二重体的可进化性质，并暗示了它们对设计者生物催化的未来发展的希望，以选择性地修饰小分子中未活化的脂肪碳中心。与卤素。