9-[(2R,4S,5R)-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]oxolan-2-yl]-6-[2-(4-nitrophenyl)ethoxy]-N-(3-pyren-1-ylpropyl)purin-2-amine | 886525-59-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 9-[(2R,4S,5R)-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]oxolan-2-yl]-6-[2-(4-nitrophenyl)ethoxy]-N-(3-pyren-1-ylpropyl)purin-2-amine
• CAS: 886525-59-3
• 化学式: C₄₉H₆₂N₆O₆Si₂
• 分子量: 887.239
• InChiKey: DZQVRJDCKGJBSB-NJZAESGASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  12.0
• 重原子数：
  63
• 可旋转键数：
  17
• 环数：
  8.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  138
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  9-[(2R,4S,5R)-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]oxolan-2-yl]-6-[2-(4-nitrophenyl)ethoxy]-N-(3-pyren-1-ylpropyl)purin-2-amine 在 triethylamine trihydrofluoride 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 24.0h， 以72%的产率得到2-hydroxymethyl-5-[6-[2-(4-nitro-phenyl)-ethoxy]-2-(3-pyren-1-yl-propylamino)-purin-9-yl]-tetrahydro-furan-3-ol
  参考文献：
  名称：

  DNA 小沟芘二聚体自由基阳离子的形成

  摘要：

  为了将芘排列在 DNA 的小沟中，我们合成了一种在鸟嘌呤 N2 上具有芘基团的核苷衍生物。合成了双芘修饰的双链 DNA，并在脉冲辐解过程中通过单电子氧化测量芘二聚体自由基阳离子的形成速率。对于这里研究的所有 DNA，芘二聚体自由基阳离子的形成是在脉冲辐射分解期间 8 ns 电子脉冲后 20 微秒内快速完成的。结果表明，DNA的小沟为芘二聚体自由基阳离子的形成提供了良好的空间。

  DOI：

  10.1246/bcsj.79.312
• 作为产物：
  描述：

  3′,5′-O-bis(tert-butyldimethylsilyl)-O⁶-(p-nitrophenylethyl)-2′-deoxy-2-fluoroguanosine 、 3-(pyren-1-yl)propylamine 在 吡啶 作用下， 反应 72.0h， 以17%的产率得到9-[(2R,4S,5R)-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]oxolan-2-yl]-6-[2-(4-nitrophenyl)ethoxy]-N-(3-pyren-1-ylpropyl)purin-2-amine
  参考文献：
  名称：

  DNA 小沟芘二聚体自由基阳离子的形成

  摘要：

  为了将芘排列在 DNA 的小沟中，我们合成了一种在鸟嘌呤 N2 上具有芘基团的核苷衍生物。合成了双芘修饰的双链 DNA，并在脉冲辐解过程中通过单电子氧化测量芘二聚体自由基阳离子的形成速率。对于这里研究的所有 DNA，芘二聚体自由基阳离子的形成是在脉冲辐射分解期间 8 ns 电子脉冲后 20 微秒内快速完成的。结果表明，DNA的小沟为芘二聚体自由基阳离子的形成提供了良好的空间。

  DOI：

  10.1246/bcsj.79.312

文献信息

• Formation of Pyrene Dimer Radical Cation at the Minor Groove of DNA
  作者：Kiyohiko Kawai、Takumi Kimura、Hiroko Yoshida、Akira Sugimoto、Sachiko Tojo、Mamoru Fujitsuka、Tetsuro Majima

  DOI：10.1246/bcsj.79.312

  日期：2006.2

  and the formation rates of the pyrene dimer radical cation were measured upon one-electron oxidation during pulse radiolysis. For all of the DNA studied here, the formation of a pyrene dimer radical cation was accomplished quickly, within 20 micro seconds after a 8-ns electron pulse during pulse radiolysis. The results show that the minor groove of DNA offers a good space for the formation of pyrene

  为了将芘排列在 DNA 的小沟中，我们合成了一种在鸟嘌呤 N2 上具有芘基团的核苷衍生物。合成了双芘修饰的双链 DNA，并在脉冲辐解过程中通过单电子氧化测量芘二聚体自由基阳离子的形成速率。对于这里研究的所有 DNA，芘二聚体自由基阳离子的形成是在脉冲辐射分解期间 8 ns 电子脉冲后 20 微秒内快速完成的。结果表明，DNA的小沟为芘二聚体自由基阳离子的形成提供了良好的空间。