Gal(b1-4)GlcNAc(b1-3)Gal(b1-4)GlcNAc(b1-3)Gal(b1-4)GlcNAc(b1-3)Gal(b1-4)GlcNAc

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: Gal(b1-4)GlcNAc(b1-3)Gal(b1-4)GlcNAc(b1-3)Gal(b1-4)GlcNAc(b1-3)Gal(b1-4)GlcNAc
• 英文别名: N-[(3R,4R,5S,6R)-5-[(2S,3R,4S,5S,6R)-4-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-5-[(2S,3R,4S,5S,6R)-4-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-5-[(2S,3R,4S,5S,6R)-4-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-4-hydroxy-6-(hydroxymethyl)-5-[(2S,3R,4S,5R,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxyoxan-2-yl]oxy-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-4-hydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-4-hydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-2,4-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-3-yl]acetamide
• 化学式: C₅₆H₉₄N₄O₄₁
• 分子量: 1479.3
• InChiKey: GJLBQGWWBHFZQG-ZHHCNZFGSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -16
• 重原子数：
  101
• 可旋转键数：
  26
• 环数：
  8.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.93
• 拓扑面积：
  700
• 氢给体数：
  26
• 氢受体数：
  41

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  uridine 5'-diphospho-N-acetylglucosamine 、 Gal(b1-4)GlcNAc(b1-3)Gal(b1-4)GlcNAc(b1-3)Gal(b1-4)GlcNAc(b1-3)Gal(b1-4)GlcNAc 在 β-1,3-Nacetylglucosaminyltransferase from Helicobacter pylori 作用下， 生成 GlcNAcβ1,3Galβ1,4GlcNAcβ1,3Galβ1,4GlcNAcβ1,3Galβ1,4GlcNAcβ1,3Galβ1,4GlcNAc
  参考文献：
  名称：

  通过高度灵敏的工程纳米孔直接识别复杂聚糖

  摘要：

  聚糖在生物系统中发挥的关键作用是由其结构决定的。然而，由于其固有的复杂性，聚糖结构的分析仍然存在许多瓶颈。纳米孔技术已成为 DNA 测序和肽检测的强大传感器。这对相关研究领域的发展产生了重大影响。目前，纳米孔开始应用于简单聚糖的检测，但利用该技术分析复杂聚糖仍然具有挑战性。在这里，我们设计了工程α-溶血素纳米孔M113R/T115A，以实现微摩尔浓度和无标记条件下复杂聚糖的传感。通过提取特征特征来描绘三维 (3D) 散点图，可以区分具有不同数量的官能团、从二糖到十糖的各种链长度以及不同的糖苷键的聚糖。分子动力学 (MD) 模拟显示纳米孔中具有 β1,3- 或 β1,4- 糖苷键的聚糖的不同行为。更重要的是，设计的纳米孔系统可以以超过0.9的分离比区分混合物中不同长度的每种聚糖异构体。这项工作代表了一个概念验证，证明可以使用纳米孔测序技术来分析复杂的聚糖。

  DOI：

  10.1021/jacs.4c02081
• 作为产物：
  描述：

  UDP-Gal 、 GlcNAc(b1-3)Gal(b1-4)GlcNAc(b1-3)Gal(b1-4)GlcNAc(b1-3)Gal(b1-4)GlcNAc 在 β-1,4-galactosyltransferase from Neisseria meningitides 作用下， 生成 Gal(b1-4)GlcNAc(b1-3)Gal(b1-4)GlcNAc(b1-3)Gal(b1-4)GlcNAc(b1-3)Gal(b1-4)GlcNAc
  参考文献：
  名称：

  通过高度灵敏的工程纳米孔直接识别复杂聚糖

  摘要：

  聚糖在生物系统中发挥的关键作用是由其结构决定的。然而，由于其固有的复杂性，聚糖结构的分析仍然存在许多瓶颈。纳米孔技术已成为 DNA 测序和肽检测的强大传感器。这对相关研究领域的发展产生了重大影响。目前，纳米孔开始应用于简单聚糖的检测，但利用该技术分析复杂聚糖仍然具有挑战性。在这里，我们设计了工程α-溶血素纳米孔M113R/T115A，以实现微摩尔浓度和无标记条件下复杂聚糖的传感。通过提取特征特征来描绘三维 (3D) 散点图，可以区分具有不同数量的官能团、从二糖到十糖的各种链长度以及不同的糖苷键的聚糖。分子动力学 (MD) 模拟显示纳米孔中具有 β1,3- 或 β1,4- 糖苷键的聚糖的不同行为。更重要的是，设计的纳米孔系统可以以超过0.9的分离比区分混合物中不同长度的每种聚糖异构体。这项工作代表了一个概念验证，证明可以使用纳米孔测序技术来分析复杂的聚糖。

  DOI：

  10.1021/jacs.4c02081

文献信息

• Direct Identification of Complex Glycans via a Highly Sensitive Engineered Nanopore
  作者：Guangda Yao、Yinping Tian、Wenjun Ke、Jie Fang、Shengzhou Ma、Tiehai Li、Xi Cheng、Bingqing Xia、Liuqing Wen、Zhaobing Gao

  DOI：10.1021/jacs.4c02081

  日期：——

  for the detection of simple glycans, but the analysis of complex glycans by this technology is still challenging. Here, we designed an engineered α-hemolysin nanopore M113R/T115A to achieve the sensing of complex glycans at micromolar concentrations and under label-free conditions. By extracting characteristic features to depict a three-dimensional (3D) scatter plot, glycans with different numbers of

  聚糖在生物系统中发挥的关键作用是由其结构决定的。然而，由于其固有的复杂性，聚糖结构的分析仍然存在许多瓶颈。纳米孔技术已成为 DNA 测序和肽检测的强大传感器。这对相关研究领域的发展产生了重大影响。目前，纳米孔开始应用于简单聚糖的检测，但利用该技术分析复杂聚糖仍然具有挑战性。在这里，我们设计了工程α-溶血素纳米孔M113R/T115A，以实现微摩尔浓度和无标记条件下复杂聚糖的传感。通过提取特征特征来描绘三维 (3D) 散点图，可以区分具有不同数量的官能团、从二糖到十糖的各种链长度以及不同的糖苷键的聚糖。分子动力学 (MD) 模拟显示纳米孔中具有 β1,3- 或 β1,4- 糖苷键的聚糖的不同行为。更重要的是，设计的纳米孔系统可以以超过0.9的分离比区分混合物中不同长度的每种聚糖异构体。这项工作代表了一个概念验证，证明可以使用纳米孔测序技术来分析复杂的聚糖。