3-[(5-hydroxy-6-methoxyindol-2-yl)carbonyl]-(1S)-(chloromethyl)-5-benzyloxy-1,2-dihydro-3H-pyrrolo[3,2-e]indole-7-carboxylic acid | 736138-13-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: 3-[(5-hydroxy-6-methoxyindol-2-yl)carbonyl]-(1S)-(chloromethyl)-5-benzyloxy-1,2-dihydro-3H-pyrrolo[3,2-e]indole-7-carboxylic acid
• 英文别名: 3-[(5-hydroxy-6-methoxyindol-2-yl)carbonyl]-1-(chloromethyl)-5-benzyloxy-1,2-dihydro-3H-pyrrolo[3,2-e]indole-7-carboxylic acid；(8S)-8-(chloromethyl)-6-(5-hydroxy-6-methoxy-1H-indole-2-carbonyl)-4-phenylmethoxy-7,8-dihydro-3H-pyrrolo[3,2-e]indole-2-carboxylic acid
• CAS: 736138-13-9
• 化学式: C₂₉H₂₄ClN₃O₆
• 分子量: 545.979
• InChiKey: XOTLUJPUMHSKAE-QGZVFWFLSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.9
• 重原子数：
  39
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.17
• 拓扑面积：
  128
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-[(5-hydroxy-6-methoxyindol-2-yl)carbonyl]-(1S)-(chloromethyl)-5-benzyloxy-1,2-dihydro-3H-pyrrolo[3,2-e]indole-7-carboxylic acid 在 palladium on activated charcoal 氢气 、 碳酸氢钠 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 25.0 ℃ 、101.33 kPa 条件下， 反应 20.0h， 生成 (+)-yatakemycin
  参考文献：
  名称：

  (+)-Yatakemycin 的全合成、结构修正和绝对构型

  摘要：

  yatakemycin 是 2003 年公开的一种异常有效的天然抗肿瘤剂，其报告的结构 2 的全合成及其与天然产物缺乏相关性进行了详细说明。根据 2 和 yatakemycin 之间的光谱区别，天然产物结构被重新表述为 3，现在在左侧亚基中带有硫代甲酯与硫代乙酸酯。3 的全合成提供了一种与天然产物几乎相同但仍略有不同的化合物。yatakemycin 结构的第二次重组为 1，纳入了替代取代的右手亚基以及最初的硫代甲酯重组，在研究中通过 (+)- 和 ent-(-)-1 的全合成得到证实明确地确定了天然产物的绝对构型。

  DOI：

  10.1021/ja0472735
• 作为产物：
  描述：

  methyl (S)-5-benzyloxy-3,6-bis(tert-butoxycarbonyl)-1-(chloromethyl)-1,2-dihydro-3H-pyrrolo[3,2-e]indole-7-carboxylate 在 盐酸 、 lithium hydroxide 、 碳酸氢钠 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 乙酸乙酯 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 25.0h， 生成 3-[(5-hydroxy-6-methoxyindol-2-yl)carbonyl]-(1S)-(chloromethyl)-5-benzyloxy-1,2-dihydro-3H-pyrrolo[3,2-e]indole-7-carboxylic acid
  参考文献：
  名称：

  (+)-Yatakemycin 的全合成、结构修正和绝对构型

  摘要：

  yatakemycin 是 2003 年公开的一种异常有效的天然抗肿瘤剂，其报告的结构 2 的全合成及其与天然产物缺乏相关性进行了详细说明。根据 2 和 yatakemycin 之间的光谱区别，天然产物结构被重新表述为 3，现在在左侧亚基中带有硫代甲酯与硫代乙酸酯。3 的全合成提供了一种与天然产物几乎相同但仍略有不同的化合物。yatakemycin 结构的第二次重组为 1，纳入了替代取代的右手亚基以及最初的硫代甲酯重组，在研究中通过 (+)- 和 ent-(-)-1 的全合成得到证实明确地确定了天然产物的绝对构型。

  DOI：

  10.1021/ja0472735

文献信息

• Systematic Exploration of the Structural Features of Yatakemycin Impacting DNA Alkylation and Biological Activity
  作者：Mark S. Tichenor、Karen S. MacMillan、John D. Trzupek、Thomas J. Rayl、Inkyu Hwang、Dale L. Boger

  DOI：10.1021/ja072777z

  日期：2007.9.1

  of the alkylation subunit within the three subunit arrangement (sandwiched vs extended and reversed analogues) indicates that it not only has a profound impact on the rate and efficiency of DNA alkylation but also controls and establishes the DNA alkylation selectivity as well, where both enantiomers of such sandwiched agents alkylate the same adenine sites exhibiting the same DNA alkylation selectivity

  对 yatakemycin 左右亚基及其取代基的影响进行了系统检查，并对其独特的三个亚基排列（夹心与扩展和反向类似物）进行了研究。约的检查。制备的 50 个类似物表明，在矢车霉素三亚基结构中，亚基取代基相对不重要，独特的夹心排列显着提高了其 DNA 烷基化反应的速率和效率。这增强了 yatakemycin 及其类似物的细胞毒活性，克服了该系列中更传统的化合物（CC-1065，duocarmycins）通常观察到的局限性。而且，
• Total Synthesis, Structure Revision, and Absolute Configuration of (+)-Yatakemycin
  作者：Mark S. Tichenor、David B. Kastrinsky、Dale L. Boger

  DOI：10.1021/ja0472735

  日期：2004.7.14

  substituted right-hand subunit as well as the initial thiomethyl ester reformulation, was confirmed by total synthesis of both (+)- and ent-(-)-1 in studies that also unambiguously established the absolute configuration of the natural product.

  yatakemycin 是 2003 年公开的一种异常有效的天然抗肿瘤剂，其报告的结构 2 的全合成及其与天然产物缺乏相关性进行了详细说明。根据 2 和 yatakemycin 之间的光谱区别，天然产物结构被重新表述为 3，现在在左侧亚基中带有硫代甲酯与硫代乙酸酯。3 的全合成提供了一种与天然产物几乎相同但仍略有不同的化合物。yatakemycin 结构的第二次重组为 1，纳入了替代取代的右手亚基以及最初的硫代甲酯重组，在研究中通过 (+)- 和 ent-(-)-1 的全合成得到证实明确地确定了天然产物的绝对构型。