palmitoyl-D-N(Me)Ser(Bn)-D-Ala-Gly-OH | 1305317-54-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: palmitoyl-D-N(Me)Ser(Bn)-D-Ala-Gly-OH
• 英文别名: 2-[[(2R)-2-[[(2R)-2-[hexadecanoyl(methyl)amino]-3-phenylmethoxypropanoyl]amino]propanoyl]amino]acetic acid
• CAS: 1305317-54-7
• 化学式: C₃₂H₅₃N₃O₆
• 分子量: 575.789
• InChiKey: QZVUGIRWULGAKP-IXCJQBJRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.1
• 重原子数：
  41
• 可旋转键数：
  24
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.69
• 拓扑面积：
  125
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  palmitoyl-D-N(Me)Ser(Bn)-D-Ala-Gly-OH 、 在 碳酸氢钠 、 3-(二乙氧基邻酰氧基)-1,2,3-苯并三嗪-4-酮 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 24.0h， 以40 mg的产率得到methyl 2-((4S,7S,10S)-10-(2-((R)-2-((R)-3-(benzyloxy)-2-(N-methylpalmitamido)propanamido)propanamido)-N-methylacetamido)-16,26-dimethoxy-7-methyl-6,9-dioxo-5,8-diaza-1,2(1,3)-dibenzenacyclodecaphane-4-yl)acetate
  参考文献：
  名称：

  Efforts toward broadening the spectrum of arylomycin antibiotic activity

  摘要：

  New antibiotics are needed, and one source may be 'latent' antibiotics, natural products whose once broad-spectrum activity is currently limited by the evolution of resistance in nature. We have identified a potential class of latent antibiotics, the arylomycins, which are lipopeptides with a C-terminal macrocycle that target signal peptidase and whose spectrum is limited by a resistance-conferring mutation in many bacteria. Herein, we report the synthesis and evaluation of several arylomycin derivatives, and demonstrate that both C-terminal homologation with a glycyl aldehyde and addition of a positive charge to the macrocycle increase the activity and spectrum of the arylomycin scaffold. (C) 2013 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2013.08.026
• 作为产物：
  描述：

  Fmoc-甘氨酸 、 Fmoc-D-丙氨酸 、 棕榈酸 、 (2R)-2-(N-((9H-fluoren-9-ylmethoxy)carbonyl)-N-methylamino)-3-benzyloxypropionic acid 在 N,N-二异丙基乙胺 、 6-chloro-3-((dimethylamino)(dimethyliminio)methyl)-1H-benzo[d][1,2,3]triazol-3-ium-1-olatehexafluorophosphate(V) 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以30%的产率得到palmitoyl-D-N(Me)Ser(Bn)-D-Ala-Gly-OH
  参考文献：
  名称：

  Arylomycin B 抗生素的合成和生物学表征

  摘要：

  抗生素实际上总是作为相关化合物的家族被分离出来，但观察到的多样性背后的进化力量通常知之甚少，甚至不清楚它们是否都具有生物活性。芳霉素类抗生素由三个相关家族组成，它们通过保守核心支架的硝化、糖基化和羟基化来区分。以前，我们报道了 A 系列成员 arylomycin A 2以及 A 系列衍生物 arylomycin C 16的全合成，并表明两者都对比以前认识的更广谱的细菌具有活性。我们现在报告 B 系列类似物 arylomycin BC 16的全合成，及其芳香胺衍生物。虽然芳香胺对所有测试的细菌都失去活性，但 B 系列化合物显示出与 A 系列化合物相似的活性，不同之处在于它还获得了对重要病原体无乳链球菌的活性。

  DOI：

  10.1021/np200163g

文献信息

• Initial Analysis of the Arylomycin D Antibiotics
  作者：Yun Xuan Tan、David S. Peters、Shawn I. Walsh、Matthew Holcomb、Diogo Santos-Martins、Stefano Forli、Floyd E. Romesberg

  DOI：10.1021/acs.jnatprod.9b01174

  日期：2020.7.24

  The arylomycins are a class of natural product antibiotics that inhibit bacterial type I signal peptidase and are under development as therapeutics. Four classes of arylomycins are known, arylomycins A–D. Previously, we reported the synthesis and analysis of representatives of the A, B, and C classes and showed that their spectrum of activity has the potential to be much broader than originally assumed

  芳霉素是一类天然产物抗生素，可抑制细菌 I 型信号肽酶，正在开发作为治疗剂。已知四类芳霉素，芳霉素 A-D。之前，我们报告了 A、B 和 C 类代表的综合和分析，并表明它们的活动范围可能比最初假设的要广泛得多。连同获得性和先天性耐药机制的比较，这使我们认为 arylomycins 是潜在的抗生素，曾经具有广谱活性的抗生素，但在今天的检查中，由于先前的选择而只有窄谱活性在与其他首先推动它们进化的微生物竞争的过程中产生抗药性。有趣的是，放线菌素，据报道，芳霉素 D 类中唯一确定的成员具有抗 MRSA 的活性。为了证实和理解这种活性，合成了几种放线菌素衍生物。我们证明先前报告的放线菌素结构不正确，确定可能是正确的支架，确认支架具有抗 MRSA 的活性，并确定此活动的起源。
• [EN] BROAD SPECTRUM ANTIBIOTICS<br/>[FR] ANTIBIOTIQUES À LARGE SPECTRE
  申请人：RQX PHARMACEUTICALS INC

  公开号：WO2012166665A3

  公开（公告）日：2013-03-07
• Efforts toward broadening the spectrum of arylomycin antibiotic activity
  作者：Jian Liu、Peter A. Smith、Danielle Barrios Steed、Floyd Romesberg

  DOI：10.1016/j.bmcl.2013.08.026

  日期：2013.10

  New antibiotics are needed, and one source may be 'latent' antibiotics, natural products whose once broad-spectrum activity is currently limited by the evolution of resistance in nature. We have identified a potential class of latent antibiotics, the arylomycins, which are lipopeptides with a C-terminal macrocycle that target signal peptidase and whose spectrum is limited by a resistance-conferring mutation in many bacteria. Herein, we report the synthesis and evaluation of several arylomycin derivatives, and demonstrate that both C-terminal homologation with a glycyl aldehyde and addition of a positive charge to the macrocycle increase the activity and spectrum of the arylomycin scaffold. (C) 2013 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• Synthesis and Biological Characterization of Arylomycin B Antibiotics
  作者：Tucker C. Roberts、Peter A. Smith、Floyd E. Romesberg

  DOI：10.1021/np200163g

  日期：2011.5.27

  the total synthesis of an A series member, arylomycin A2, as well as the A series derivative arylomycin C16 and showed that both are active against a broader spectrum of bacteria than previously appreciated. We now report the total synthesis of a B series analogue, arylomycin B-C16, and its aromatic amine derivative. While the aromatic amine loses activity against all bacteria tested, the B series compound

  抗生素实际上总是作为相关化合物的家族被分离出来，但观察到的多样性背后的进化力量通常知之甚少，甚至不清楚它们是否都具有生物活性。芳霉素类抗生素由三个相关家族组成，它们通过保守核心支架的硝化、糖基化和羟基化来区分。以前，我们报道了 A 系列成员 arylomycin A 2以及 A 系列衍生物 arylomycin C 16的全合成，并表明两者都对比以前认识的更广谱的细菌具有活性。我们现在报告 B 系列类似物 arylomycin BC 16的全合成，及其芳香胺衍生物。虽然芳香胺对所有测试的细菌都失去活性，但 B 系列化合物显示出与 A 系列化合物相似的活性，不同之处在于它还获得了对重要病原体无乳链球菌的活性。