methyl (S)-9-[(tert-butoxycarbonyl)amino]-5,8-dioxo-(S)-4,7-diazabicyclo[9.3.1]pentadeca-1(15),11,13-triene-3-carboxylate | 196861-00-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: methyl (S)-9-[(tert-butoxycarbonyl)amino]-5,8-dioxo-(S)-4,7-diazabicyclo[9.3.1]pentadeca-1(15),11,13-triene-3-carboxylate
• 英文别名: Methyl (S)-9-(tert-butoxycarbonylamino)-5,8-dioxo-(S)-4,7-diazabicyclo[9.3.1]pentadeca-1(15), 11,13-triene-3-carboxylate；methyl (3S,9S)-9-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]-5,8-dioxo-4,7-diazabicyclo[9.3.1]pentadeca-1(14),11(15),12-triene-3-carboxylate
• CAS: 196861-00-4
• 化学式: C₂₀H₂₇N₃O₆
• 分子量: 405.451
• InChiKey: IVWANLOWTUWXKE-GJZGRUSLSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.6
• 重原子数：
  29
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  123
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl (S)-9-[(tert-butoxycarbonyl)amino]-5,8-dioxo-(S)-4,7-diazabicyclo[9.3.1]pentadeca-1(15),11,13-triene-3-carboxylate 在 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 为溶剂， 反应 1.0h， 以74%的产率得到(S)-9-[(tert-butoxycarbonyl)amino]-5,8-dioxo-(S)-4,7-diazabicyclo[9.3.1]pentadeca-1(15),11,13-triene-3-carboxylic acid
  参考文献：
  名称：

  螺旋-螺旋-螺旋DNA结合蛋白基序中的转肽模拟物的设计和对映选择性合成。

  摘要：

  设计并合成了DNA结合蛋白的螺旋-螺旋-螺旋（HTH）基序中的肽模拟物。通过两个氨基酸与侧链碳-碳键的不寻常连接来实现构象约束。苯环为与HTH基序的疏水核进行新的疏水性接触提供了可能。在模拟物中，肽主链和中央残基以天然形式保留在12元环状三肽中。通过两个连续的Horner-Wittig偶联合成目标化合物1b，然后通过Rh（MeDuPHOS）在八个步骤中对映选择性氢化，总收率为35％。关键氢化的立体化学结果由RuO（2）/ NaIO（4）进行芳香环氧化确定，得到2当量的Boc-Asp-OMe。

  DOI：

  10.1021/jo971077h
• 作为产物：
  描述：

  trimethyl 2-(tert-butoxycarbonylamino)phosphonoacetate 在 palladium on activated charcoal 、 rhodium 2(S),5(S)-dimethyl-1,2-bisphospholanobenzene sodium hydroxide 、 1,1,2,3-四甲基胍 、 二苯基膦叠氮化物 、 四丁基氟化铵 、 水 、 氢气 、 1-羟基苯并三唑 、 三乙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 20.0 ℃ 、344.74 kPa 条件下， 反应 261.75h， 生成 methyl (S)-9-[(tert-butoxycarbonyl)amino]-5,8-dioxo-(S)-4,7-diazabicyclo[9.3.1]pentadeca-1(15),11,13-triene-3-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  螺旋-螺旋-螺旋DNA结合蛋白基序中的转肽模拟物的设计和对映选择性合成。

  摘要：

  设计并合成了DNA结合蛋白的螺旋-螺旋-螺旋（HTH）基序中的肽模拟物。通过两个氨基酸与侧链碳-碳键的不寻常连接来实现构象约束。苯环为与HTH基序的疏水核进行新的疏水性接触提供了可能。在模拟物中，肽主链和中央残基以天然形式保留在12元环状三肽中。通过两个连续的Horner-Wittig偶联合成目标化合物1b，然后通过Rh（MeDuPHOS）在八个步骤中对映选择性氢化，总收率为35％。关键氢化的立体化学结果由RuO（2）/ NaIO（4）进行芳香环氧化确定，得到2当量的Boc-Asp-OMe。

  DOI：

  10.1021/jo971077h

文献信息

• Peptidomimetic of helix-turn-helix or gamma-turn
  申请人：University of Virginia Patent Foundation

  公开号：US06080838A1

  公开（公告）日：2000-06-27

  A peptidomimetic of the turn in the helix-turn-helix (HTH) motif of DNA-binding proteins was designed and synthesized. Conformational constraint was achieved by an unusual linking of two amino acids with a side-chain carbon--carbon bond. A phenyl ring provides the potential for new hydrophobic contacts with the hydrophobic core of the HTH motif. In the mimic, the peptide backbone and the central residue were retained in native form within a 12-membered cyclic tripeptide. The target compound 1b was synthesized by two sequential Horner-Wittig couplings followed by enantioselective hydrogenation with Rh(MeDuPHOS) in 8 steps and 35% overall yield. The stereochemical outcome of the key hydrogenation was determined by aromatic ring oxidation with RuO.sub.2 /NalO.sub.4 to give two equivalents of Boc-Asp-OMe.

  一种仿肽设计并合成了DNA结合蛋白中螺旋-螺旋-螺旋（HTH）基序的仿生体。通过两个氨基酸的侧链碳-碳键连接实现构象限制。苯环提供了与HTH基序疏水核心形成新疏水接触的潜力。在仿生体中，肽骨架和中心残基在一个12元环三肽中以原生形式保留。目标化合物1b通过两个顺序的Horner-Wittig偶联反应，随后在Rh（MeDuPHOS）的选择性加氢下，经过8个步骤和35％的总产率合成。关键氢化的立体化学结果通过RuO.sub.2 / NalO.sub.4的芳香环氧化确定，生成两个Boc-Asp-OMe当量。
• Design and Enantioselective Synthesis of a Peptidomimetic of the Turn in the Helix−Turn−Helix DNA-Binding Protein Motif
  作者：Jeremy M. Travins、Felicia A. Etzkorn

  DOI：10.1021/jo971077h

  日期：1997.11.1

  A peptidomimetic of the turn in the helix-turn-helix (HTH) motif of DNA-binding proteins was designed and synthesized. Conformational constraint was achieved by an unusual linking of two amino acids with a side chain carbon-carbon bond. A phenyl ring provides the potential for new hydrophobic contacts with the hydrophobic core of the HTH motif. In the mimic, the peptide backbone and the central residue

  设计并合成了DNA结合蛋白的螺旋-螺旋-螺旋（HTH）基序中的肽模拟物。通过两个氨基酸与侧链碳-碳键的不寻常连接来实现构象约束。苯环为与HTH基序的疏水核进行新的疏水性接触提供了可能。在模拟物中，肽主链和中央残基以天然形式保留在12元环状三肽中。通过两个连续的Horner-Wittig偶联合成目标化合物1b，然后通过Rh（MeDuPHOS）在八个步骤中对映选择性氢化，总收率为35％。关键氢化的立体化学结果由RuO（2）/ NaIO（4）进行芳香环氧化确定，得到2当量的Boc-Asp-OMe。