5-benzyl-piperazinocyclam | 929200-52-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: 5-benzyl-piperazinocyclam
• 英文别名: 5-benzyl-1,5,8,12-tetraazabicyclo[10.2.2]hexadecane；5-(4-phenylmethyl)-1,5,8,12-tetraaza-bicyclo[10.2.2]hexadecane；5-Benzyl-1,5,8,12-tetrazabicyclo[10.2.2]hexadecane；5-benzyl-1,5,8,12-tetrazabicyclo[10.2.2]hexadecane
• CAS: 929200-52-2
• 化学式: C₁₉H₃₂N₄
• 分子量: 316.49
• InChiKey: AAXIBPDLIYNTNR-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.7
• 重原子数：
  23
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.68
• 拓扑面积：
  21.8
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-benzyl-piperazinocyclam 在 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醇 为溶剂， 反应 171.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  正交N保护的C功能侧桥Cyclam的合成以提供对不对称约束BCA的访问

  摘要：

  提出了获得带有苄基或Boc基团的正交N保护的侧桥基环的环酰胺的一般方法。这种方法特别适用于C功能化的大循环。尽管这些化合物缺乏对称性，但该策略仍可对一种或另一种剩余的仲胺功能进行特定保护。

  DOI：

  10.1002/ejoc.201901013
• 作为产物：
  描述：

  cis-Decahydro-1H,6H-3a,5a,8a,10a-tetraazapyrene 在 sodium tetrahydroborate 作用下， 以 乙醇 、 丙酮 为溶剂， 反应 120.0h， 生成 5-benzyl-piperazinocyclam
  参考文献：
  名称：

  Kolinski, Ryszard A., Polish Journal of Chemistry, 1995, vol. 69, # 7, p. 1039 - 1045

  摘要：

  DOI：

文献信息

• Probing key coordination interactions: configurationally restricted metal activated CXCR4 antagonists
  作者：Graeme McRobbie、Gina C. Valks、Christopher J. Empson、Abid Khan、Jon D. Silversides、Christophe Pannecouque、Erik De Clercq、Steven G. Fiddy、Adam J. Bridgeman、Nigel A. Young、Stephen J. Archibald

  DOI：10.1039/b705800d

  日期：——

  The syntheses of configurationally restricted mono- and bis-macrocyclic copper(II) perchlorate complexes (copper(II) 5-benzyl-1,5,8,12-tetraazabicyclo[10.2.2]hexadecane and dicopper(II) 5,5′-[1,4-phenylenebis(methylene)]-bis(1,5,8,12-tetraazabicyclo[10.2.2]hexadecane)) are reported and the X-ray structure of the copper(II) mono-macrocyclic complex has been determined. EXAFS studies on the bis-macrocyclic species in aqueous solution show that the copper coordination spheres are essentially identical to the solid state structure, and do not vary in the presence of 20 equivalents of sodium acetate per metal centre. DFT calculations were carried out at the BP86/TZP level to determine the nature of potential binding interactions with CXCR4 aspartate residues. The alkylated single macrocyclic compound was modelled with an acetate included to represent the aspartate residue, demonstrating that the predicted macrocycle configuration has the lowest energy and the acetate interaction is effectively monodentate giving a distorted trigonal bipyramidal geometry at the copper centre. In vitro anti-HIV infection assays show that the configurationally restricted dicopper(II) complex is more active (average EC50 = 0.026 μM against HIV-1) than the non-constrained dicopper(II) 1,1′-[1,4-phenylenebis(methylene)]-bis(1,4,8,11-tetraazacyclotetradecane) (average EC50 = 0.047 μM against HIV-1) although it is an order of magnitude less active than the configurationally restricted dizinc(II) complex.

  合成了构型受限的单高氯酸铜(II)和双高氯酸铜(II)高环配合物（5-苄基-1,5,8,12-四氮杂双环[10.2.2]十六烷和 5,5′-[1,4-亚苯基双(亚甲基)]-双(1,5,8,12-四氮杂双环[10.2.2]十六烷)二氯化铜(II)，并确定了铜(II)单高环配合物的 X 射线结构。对水溶液中的双大环物种进行的 EXAFS 研究表明，铜配位球与固态结构基本相同，并且在每个金属中心存在 20 个等量的醋酸钠时也不会发生变化。我们在 BP86/TZP 水平上进行了 DFT 计算，以确定与 CXCR4 天门冬氨酸残基的潜在结合相互作用的性质。对烷基化的单一大环化合物进行了建模，并加入了代表天冬氨酸残基的醋酸盐，结果表明预测的大环构型具有最低的能量，醋酸盐的相互作用实际上是单价的，从而在铜中心形成了扭曲的三叉双锥几何形状。体外抗艾滋病毒感染试验表明，构型受限的二氯化铜（II）复合物活性更高（平均 EC50 = 0.0.047 μM），但其活性比构型受限的二锌(II)复合物低一个数量级。
• <i>trans</i>-IV restriction: a new configuration for metal bis-cyclam complexes as potent CXCR4 inhibitors
  作者：Seraj O. Alzahrani、Graeme McRobbie、Abid Khan、Thomas D'huys、Tom Van Loy、Ashlie N. Walker、Isaline Renard、Timothy J. Hubin、Dominique Schols、Benjamin P. Burke、Stephen J. Archibald

  DOI：10.1039/d3dt01729j

  日期：2024.3.19

  been shown to be effective in cancer treatment as an individual agent. Configurational restriction and transition metal complex formation increases receptor binding affinity and residence time. In the present study, we have synthesized novel trans-IV locked cyclam-based CXCR4 inhibitors, a previously unexploited configuration, and demonstrated their higher affinity for CXCR4 binding and CXCL12-mediated

  趋化因子受体 CXCR4 与多种疾病有关，包括炎症性疾病、癌症生长和转移以及 HIV/AIDS。 CXCR4 靶向治疗已在治疗癌症转移和治疗耐药方面进行了评估。仙客来衍生物，尤其是 AMD3100 (Plerixafor™)，是小分子 CXCR4 拮抗剂中的常见基序。然而，AMD3100 尚未被证明作为单独药物在癌症治疗中有效。构型限制和过渡金属络合物的形成增加了受体结合亲和力和停留时间。在本研究中，我们合成了新型反式IV锁定的cyclam基CXCR4抑制剂，这是一种以前未开发的配置，并证明了与AMD3100相比，它们对CXCR4结合和CXCL12介导的信号抑制具有更高的亲和力。这些结果为更有效的 CXCR4 抑制剂铺平了道路，这些抑制剂可能在癌症治疗中提供显着的疗效。
• Kolinski, Ryszard A., Polish Journal of Chemistry, 1995, vol. 69, # 7, p. 1039 - 1045
  作者：Kolinski, Ryszard A.

  DOI：——

  日期：——
• Synthesis of Orthogonal <i>N</i> -Protected <i>C</i> -Functional Side-Bridged Cyclams to Give Access to Unsymmetrical Constrained BCAs
  作者：Thomas Le Bihan、Nathalie Le Bris、Hélène Bernard、Carlos Platas-Iglesias、Raphaël Tripier

  DOI：10.1002/ejoc.201901013

  日期：2019.9.15

  A general procedure to obtain orthogonally N‐protected side‐bridged cyclams with a benzyl or a Boc group was developed. Such methodology is especially applicable on C‐functionalized macrocycles. Despite the lack of symmetry of these compounds, this strategy allows the specific protection of one or the other remaining secondary amine function.

  提出了获得带有苄基或Boc基团的正交N保护的侧桥基环的环酰胺的一般方法。这种方法特别适用于C功能化的大循环。尽管这些化合物缺乏对称性，但该策略仍可对一种或另一种剩余的仲胺功能进行特定保护。