高多样性
基因编码组合文库(10 8 -10 13 个成员)是基于肽的结合分子的丰富来源,通过亲和力选择进行鉴定。合成文库可以访问更广泛的
化学空间,但通常通过筛选仅检查约 10 6种化合物。在这里,我们展示了溶液内亲和选择可以与纳米
液相色谱-串联质谱肽测序相结合,从 10 8 个成员的完全随机合成文库中识别结合物——多样性比标准实践增加了 100 倍。为了验证这种方法,我们证明单克隆
抗体的结合物的鉴定与文库多样性成比例,因为多样性从 10 6 –10 8增加。然后将这些结果应用于 M
DM2 的 p53 样结合物的发现,以及 3-19 nM 亲和力、基于 α/β-肽的 14-3-3 结合物家族。确定了与 14-3-3σ 复合的这些结合物之一的 X 射线结构,说明了 β-
氨基酸在促进关键结合接触中的作用。