1-[(1S,3R,4R,5S)-4-hydroxy-1-(hydroxymethyl)-2-oxabicyclo[3.1.0]hex-3-yl]-2,4(1H,3H)-pyrimidinedione | 864858-43-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 1-[(1S,3R,4R,5S)-4-hydroxy-1-(hydroxymethyl)-2-oxabicyclo[3.1.0]hex-3-yl]-2,4(1H,3H)-pyrimidinedione
• 英文别名: 1-[(1S,3R,4R,5S)-4-hydroxy-1-(hydroxymethyl)-2-oxabicyclo[3.1.0]hexan-3-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 864858-43-5
• 化学式: C₁₀H₁₂N₂O₅
• 分子量: 240.216
• InChiKey: QIFNVFJRLNNTKO-LJHRJBCISA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2
• 重原子数：
  17
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  99.1
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-[(1S,3R,4R,5S)-4-hydroxy-1-(hydroxymethyl)-2-oxabicyclo[3.1.0]hex-3-yl]-2,4(1H,3H)-pyrimidinedione 在 戴斯-马丁氧化剂 作用下， 以 吡啶 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 18.0h， 生成 1-[(1S,3R,5S)-1-(hydroxymethyl)-4-methylene-2-oxabicyclo[3.1.0]hex-3-yl]-2,4(1H,3H)-pyrimidinedione
  参考文献：
  名称：

  C-4'-修饰的（2-氧杂双环[3.1.0]己基）嘧啶核苷的合成与构象分析

  摘要：

  我们报告了迄今为止未知的带有 2-氧杂双环 [3.1.0] 己烷支架（5、6、8、13-17 和 19）的嘧啶核苷类似物的合成，在 C-4' 位置进行了各种修饰，包括亚甲基、叠氮基, 和类似阿拉伯的配置。核苷类似物 6、14 和 17 的构象分析表明，这种 C-4' 修饰的核苷类似物的构象被限制在伪旋转循环的东南半球（在 0T1 和 2E 构象之间）。(© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2006)

  DOI：

  10.1002/ejoc.200600550
• 作为产物：
  描述：

  [(1S,3R,4R,5S)-4-(acetyloxy)-3-(2,4-dioxo-3,4-dihydro-1(2H)-pyrimidinyl)-2-oxabicyclo[3.1.0]hex-1-yl]methyl acetate 在 氨 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 以90%的产率得到1-[(1S,3R,4R,5S)-4-hydroxy-1-(hydroxymethyl)-2-oxabicyclo[3.1.0]hex-3-yl]-2,4(1H,3H)-pyrimidinedione
  参考文献：
  名称：

  构象受限的3'-脱氧-3',4'-外亚甲基核苷类似物的合成与研究

  摘要：

  迄今未知的带有核酸天然存在的嘧啶碱基的限制性 3'-脱氧-3',4'-外亚甲基核苷衍生物已被合成。测试了这些化合物对 HIV、HBV 和几种 RNA 病毒的活性，但它们没有显示出显着的抗病毒作用。

  DOI：

  10.1081/ncn-200059796

文献信息

• Structure−Activity Relationships of Uridine 5‘-Diphosphate Analogues at the Human P2Y₆ Receptor
  作者：Pedro Besada、Dae Hong Shin、Stefano Costanzi、Hyojin Ko、Christophe Mathé、Julien Gagneron、Gilles Gosselin、Savitri Maddileti、T. Kendall Harden、Kenneth A. Jacobson

  DOI：10.1021/jm060485n

  日期：2006.9.1

  been studied. Uridine 5'-diphosphate (UDP) analogues bearing substitutions of the ribose moiety, the uracil ring, and the diphosphate group were synthesized and assayed for activity at the human P2Y6 receptor. The uracil ring was modified at the 4 position, with the synthesis of 4-substituted-thiouridine 5'-diphosphate analogues, as well as at positions 2, 3, and 5. The effect of modifications at the

  研究了尿嘧啶核苷酸激活的 P2Y6 受体的结构-活性关系和分子模型。合成了带有核糖部分、尿嘧啶环和二磷酸基团取代的尿苷 5'-二磷酸 (UDP) 类似物，并测定了其对人 P2Y6 受体的活性。尿嘧啶环在 4 位上进行修饰，合成 4-取代的硫尿苷 5'-二磷酸类似物，以及在 2、3 和 5 位进行修饰。研究了磷酸链水平修饰的影响通过制备环状3',5'-二磷酸类似物、3'-二磷酸类似物和几种二核苷酸二磷酸。 5-Iodo-UDP 32 (EC50 = 0.15 microM) 与 UDP 等价，而 2'-羟基（氨基、叠氮基）的取代会大大降低效力。与 UDP 相比，2- 和 4- 硫代类似物分别为 20 和 21 也相对有效。然而，大多数其他修改大大降低了效力。分子模型表明，5'-UDP 和类似物的 β-磷酸对于与受体的三个保守阳离子残基中的两个建立静电相互作用至关重要。在4-硫醚衍生物中，4-乙硫基类似物23显示出0
• Synthesis of Nucleoside Analogues Bearing the Five Naturally Occurring Nucleic Acid Bases Built on a 2-Oxabicylo[3.1.0]hexane Scaffold
  作者：Julien Gagneron、Gilles Gosselin、Christophe Mathé

  DOI：10.1021/jo051047b

  日期：2005.8.1

  Hitherto unknown nucleoside analogues incorporating the five naturally occurring nucleic acid bases built on a 2-oxabicyclo[3.1.0]hexane template were synthesized. The synthesis of these new conformationally restricted nucleoside analogues involved the preparation of a suitable sugar precursor bearing the 2-oxabicyclo[3.1.0]hexane scaffold. This sugar was readily obtained from [(3aS,6aS)-2,2-dimethyl-3a

  合成了迄今为止的未知核苷类似物，所述类似物结合了在2-氧杂双环[3.1.0]己烷模板上构建的五个天然存在的核酸碱基。这些新的构象受限的核苷类似物的合成涉及制备带有2-氧杂双环[3.1.0]己烷骨架的合适的糖前体。这种糖很容易从[（3a S，6a S）-2,2-二甲基-3a，6a-二氢呋喃[2,3- d ] [1,3]二氧戊-5-基]甲基苄基醚（4）中获得。继Simons-Smith型环丙烷化反应之后。最后，糖基化反应和脱保护提供了核苷类似物。使用核苷14以胸腺嘧啶碱基为模型，我们发现这种核苷类似物的构象被限制为0 T 1构象。
• Synthesis and Conformational Analysis of C-4′-Modified (2-Oxabicyclo[3.1.0]hexyl)pyrimidine Nucleosides
  作者：Julien Gagneron、Gilles Gosselin、Christophe Mathé

  DOI：10.1002/ejoc.200600550

  日期：2006.11

  We report on the synthesis of hitherto unknown pyrimidine nucleoside analogues bearing the 2-oxabicyclo[3.1.0]hexane scaffold (5, 6, 8, 13–17 and 19) with various modifications at the C-4′ position including methylene, azido, and arabino-like configuration. Conformational analysis on the nucleoside analogues 6, 14 and 17 indicates that the conformation of such C-4′-modified nucleoside analogues was restricted

  我们报告了迄今为止未知的带有 2-氧杂双环 [3.1.0] 己烷支架（5、6、8、13-17 和 19）的嘧啶核苷类似物的合成，在 C-4' 位置进行了各种修饰，包括亚甲基、叠氮基, 和类似阿拉伯的配置。核苷类似物 6、14 和 17 的构象分析表明，这种 C-4' 修饰的核苷类似物的构象被限制在伪旋转循环的东南半球（在 0T1 和 2E 构象之间）。(© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2006)
• SYNTHESIS AND STUDY OF CONFORMATIONALLY RESTRICTED 3′-DEOXY-3′,4′-EXO-METHYLENE NUCLEOSIDE ANALOGUES
  作者：Julien Gagneron、Gilles Gosselin、Christophe Mathé

  DOI：10.1081/ncn-200059796

  日期：2005.4.1

  Hitherto unknown restricted 3′-deoxy-3′,4′-exo-methylene nucleoside derivatives bearing the nucleic acid naturally occurring pyrimidine bases have been synthesized. The compounds were tested for their activity against HIV, HBV, and several RNA viruses, but they did not show significant antiviral effect.

  迄今未知的带有核酸天然存在的嘧啶碱基的限制性 3'-脱氧-3',4'-外亚甲基核苷衍生物已被合成。测试了这些化合物对 HIV、HBV 和几种 RNA 病毒的活性，但它们没有显示出显着的抗病毒作用。