N-[5-[[(2R)-2-amino-4-[[1-methyl-5-[[(2R,3R,4S,5R)-3,4,5-trihydroxyoxan-2-yl]carbamoyl]pyrrol-3-yl]amino]-4-oxobutyl]carbamoyl]-1-methylpyrrol-3-yl]-1H-indole-2-carboxamide | 1603922-24-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: N-[5-[[(2R)-2-amino-4-[[1-methyl-5-[[(2R,3R,4S,5R)-3,4,5-trihydroxyoxan-2-yl]carbamoyl]pyrrol-3-yl]amino]-4-oxobutyl]carbamoyl]-1-methylpyrrol-3-yl]-1H-indole-2-carboxamide
• CAS: 1603922-24-2
• 化学式: C₃₀H₃₆N₈O₈
• 分子量: 636.665
• InChiKey: IIVANBVEXZFGOY-WDFJAKRCSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.7
• 重原子数：
  46
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  238
• 氢给体数：
  9
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-[5-[[(2R)-2-amino-4-[[1-methyl-5-[[(2R,3R,4S,5R)-3,4,5-trihydroxyoxan-2-yl]carbamoyl]pyrrol-3-yl]amino]-4-oxobutyl]carbamoyl]-1-methylpyrrol-3-yl]-1H-indole-2-carboxamide 在 盐酸 作用下， 以 水 为溶剂， 以32 mg的产率得到
  参考文献：
  名称：

  用于 DNA-碳水化合物相互作用研究的阳离子糖基寡酰胺的合成

  摘要：

  我们正在使用基于碳水化合物的配体，糖基寡酰胺，作为获得碳水化合物-小沟 DNA 结合的结构和热力学信息的策略。为了提高第一代中性配体 1 型在水溶液中的溶解度和与 DNA 形成的复合物的稳定性以及它们对 AT/TA 碱基对的序列选择性，一种新的阳离子载体 β-d-Xyl- Py-γ[3(R)NH3+]-Py-Ind 2 已被设计。在这里，我们提出了木糖阳离子糖寡酰胺 2 的高效收敛液相合成，与木糖中性配体 1 相比，水溶性和与 DNA 聚合物的结合得到改善的证据。

  DOI：

  10.1080/10610278.2013.814776
• 作为产物：
  描述：

  4-硝基-1-甲基吡咯-2-羧酸甲酯 在 甲醇 、 sodium tetrahydroborate 、 palladium 10% on activated carbon 、 benzotriazol-1-yloxyl-tris-(pyrrolidino)-phosphonium hexafluorophosphate 、 氢气 、 sodium 、 N,N-二异丙基乙胺 、 sodium hydroxide 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 、 乙酸乙酯 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 20.0 ℃ 、275.8 kPa 条件下， 反应 13.0h， 生成 N-[5-[[(2R)-2-amino-4-[[1-methyl-5-[[(2R,3R,4S,5R)-3,4,5-trihydroxyoxan-2-yl]carbamoyl]pyrrol-3-yl]amino]-4-oxobutyl]carbamoyl]-1-methylpyrrol-3-yl]-1H-indole-2-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  用于 DNA-碳水化合物相互作用研究的阳离子糖基寡酰胺的合成

  摘要：

  我们正在使用基于碳水化合物的配体，糖基寡酰胺，作为获得碳水化合物-小沟 DNA 结合的结构和热力学信息的策略。为了提高第一代中性配体 1 型在水溶液中的溶解度和与 DNA 形成的复合物的稳定性以及它们对 AT/TA 碱基对的序列选择性，一种新的阳离子载体 β-d-Xyl- Py-γ[3(R)NH3+]-Py-Ind 2 已被设计。在这里，我们提出了木糖阳离子糖寡酰胺 2 的高效收敛液相合成，与木糖中性配体 1 相比，水溶性和与 DNA 聚合物的结合得到改善的证据。

  DOI：

  10.1080/10610278.2013.814776

文献信息

• Synthesis of cationic glyco-oligoamide for DNA–carbohydrate interaction studies
  作者：Andrea Taladriz-Sender、Cristina Vicent

  DOI：10.1080/10610278.2013.814776

  日期：2013.9.18

  groove DNA binding. In order to improve the solubility of the first generation of neutral ligands type 1 in aqueous solution and the stability of the complexes formed with DNA as well as their sequence selectivity towards AT/TA base pairs, a new cationic vector β-d-Xyl-Py-γ[3(R)NH3+]-Py-Ind 2 has been designed. Here, we present an efficient convergent solution-phase synthesis of the xylose cationic glyco-oligoamide

  我们正在使用基于碳水化合物的配体，糖基寡酰胺，作为获得碳水化合物-小沟 DNA 结合的结构和热力学信息的策略。为了提高第一代中性配体 1 型在水溶液中的溶解度和与 DNA 形成的复合物的稳定性以及它们对 AT/TA 碱基对的序列选择性，一种新的阳离子载体 β-d-Xyl- Py-γ[3(R)NH3+]-Py-Ind 2 已被设计。在这里，我们提出了木糖阳离子糖寡酰胺 2 的高效收敛液相合成，与木糖中性配体 1 相比，水溶性和与 DNA 聚合物的结合得到改善的证据。