N-[(1S)-1-甲基-2-(6-硝基-1H-苯并三唑-1-基)-2-硫酮乙基]氨基甲酸叔丁酯 | 184951-86-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并三唑类
• 中文名称: N-[(1S)-1-甲基-2-(6-硝基-1H-苯并三唑-1-基)-2-硫酮乙基]氨基甲酸叔丁酯
• 英文名称: (S)-tert-butyl (1-(6-nitro-1H-benzo[d][1,2,3]triazol-1-yl)-1-thioxopropan-2-yl)carbamate
• 英文别名: Boc-L-thionoalanine-1-(6-nitro)benzotriazolide；Boc-thionoala-1-(6-nitro)benzotriazolide；tert-butyl N-[(2S)-1-(6-nitrobenzotriazol-1-yl)-1-sulfanylidenepropan-2-yl]carbamate
• CAS: 184951-86-8
• 化学式: C₁₄H₁₇N₅O₄S
• 分子量: 351.386
• InChiKey: HTCDBMHTHFGBCZ-QMMMGPOBSA-N

物化性质

• 密度：
  1.43

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.6
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.43
• 拓扑面积：
  147
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Boc-Gly-Phe-OMe 、 N-[(1S)-1-甲基-2-(6-硝基-1H-苯并三唑-1-基)-2-硫酮乙基]氨基甲酸叔丁酯 在 盐酸 、 三乙胺 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 四氢呋喃 为溶剂， 反应 1.33h， 以92%的产率得到Boc-thionoAla-Gly-Phe-OMe
  参考文献：
  名称：

  A cis Amide Bond Surrogate Incorporating 1,2,4-Triazole

  摘要：

  A novel cis amide bond surrogate incorporating 1,2,4-triazole was designed and synthesized by the reaction of a thionotripeptide, formic hydrazide, and mercury(II) acetate. This method of surrogate formation was also applicable to a cyclic thionopeptide.

  DOI：

  10.1021/jo010904i
• 作为产物：
  描述：

  4-硝基邻苯二胺 在 劳森试剂 、 溶剂黄146 、 N,N-二异丙基乙胺 、 sodium nitrite 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 3.58h， 生成 N-[(1S)-1-甲基-2-(6-硝基-1H-苯并三唑-1-基)-2-硫酮乙基]氨基甲酸叔丁酯
  参考文献：
  名称：

  硫代酰胺取代探测 VHL 配体的羟脯氨酸识别。

  摘要：

  硫代酰胺取代影响氢键和 n → π∗ 相互作用，这些相互作用涉及蛋白质二级结构和寡肽的构象稳定性。羟脯氨酸是靶向 von Hippel-Lindau (VHL) E3 连接酶的小分子的关键识别元件，作为低氧信号探针和 PROTAC 缀合的配体是令人感兴趣的。我们假设 VHL 配体可能是一个特权模型系统，用于评估这些相互作用对蛋白质：配体复合物形成的贡献。在这里，我们报告了在中心羟基脯氨酸部分带有硫代酰胺取代的 VHL 配体的合成，并通过荧光偏振、等温滴定量热法、X 射线晶体学和分子建模来表征它们的结合。尽管存在保守的结合模式，取代模式对配体亲和力有显着影响。这些结果共同强调了氢键和 n → π∗ 相互作用在 VHL 微调羟脯氨酸识别中的作用。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2018.03.034

文献信息

• pH‐Regulated Selectivity in Supramolecular Polymerizations: Switching between Co‐ and Homopolymers
  作者：Hendrik Frisch、Yan Nie、Stefan Raunser、Pol Besenius

  DOI：10.1002/chem.201406281

  日期：2015.2.16

  A strategy is presented to regulate the selectivity in aqueous supramolecular polymerizations by changes in pH. In neutral buffered conditions, oppositely charged phenylalanine‐based dendritic peptide amphiphiles self‐assemble into (AB)n alternating copolymers of low polydispersity when mixed in a 1:1 comonomer feed ratio. Via pH switch of the glutamic acid and lysine side chains, attractive Coulomb

  提出了通过改变pH来调节水性超分子聚合中的选择性的策略。在中性缓冲条件下，以1：1共聚单体进料比混合时，带相反电荷的基于苯丙氨酸的树状肽两亲物会自组装成（A polyB）n多分散性低的交替共聚物。通过谷氨酸和赖氨酸侧链的pH值开关，在coassembled材料吸引力库仑相互作用被筛选和选择性发生聚合以形成（A）ñ在低pH和（B）的酸性共聚单体的均聚物Ñ碱性共聚单体在高pH下的均聚物，而互补的共聚单体在过渡过程中释放。使用基于肽的简约荧光团/猝灭剂对和透射电子显微镜对这三种不同的聚合态之间的可逆转换进行了证明，这些形态通过CD和荧光光谱表征。
• Asymmetric Total Syntheses of Marine Cyclic Depsipeptide Halipeptins A–D
  作者：Shouyun Yu、Xianhua Pan、Dawei Ma

  DOI：10.1002/chem.200600383

  日期：2006.8.25

  Halipeptins A-D (1 a-d) are a family of natural cyclic depsipeptides isolated from marine sponges. Total syntheses of these four compounds are detailed in this report. The key elements in this synthesis include the elaboration of the polysubstituted decanoic acid parts by two asymmetric aldol reactions, assembly of the N-methyl-delta-hydroxyisoleucine residue by using either aza-Claisen rearrangement

  Halipeptins AD（1 ad）是从海洋海绵中分离出来的一类天然环状二肽。该报告详细介绍了这四种化合物的总合成。该合成中的关键元素包括通过两个不对称的羟醛缩合反应精制多取代的癸酸部分，使用aza-Claisen重排或天冬氨酸的甲基化作为关键步骤组装N-甲基-δ-羟基异亮氨酸残基以及进行大环化在多取代的癸酸丙氨酸位点。
• Thioamide Quenching of Fluorescent Probes through Photoinduced Electron Transfer: Mechanistic Studies and Applications
  作者：Jacob M. Goldberg、Solongo Batjargal、Benson S. Chen、E. James Petersson

  DOI：10.1021/ja409709x

  日期：2013.12.11

  expand the scope of fluorophores quenched by thioamides to include dyes suitable for microscopy and single-molecule studies, including fluorescein, Alexa Fluor 488, BODIPY FL, and rhodamine 6G. We describe the photochemistry of these systems and explore applications that demonstrate the utility of thioamide quenching of fluorescein to studying protein folding and proteolysis.

  以前我们已经表明，硫代酰胺可以作为干扰最小的荧光淬灭探针掺入蛋白质中，以研究蛋白质动力学、折叠和聚集。在这里，我们表明，根据 Rehm-Weller 型模型，硫代酰胺和激发荧光团之间光致电子转移的自发性受每个部分的氧化还原电位控制。我们已经使用这个模型来预测各种常见荧光团的硫代酰胺猝灭，并且我们严格测试了十多个例子。在每种情况下，我们都发现我们的理论预测和实验观察结果非常吻合。通过这种方式，我们能够扩大硫代酰胺淬灭的荧光团的范围，包括适用于显微镜和单分子研究的染料，包括荧光素、Alexa Fluor 488、BODIPY FL、和罗丹明6G。我们描述了这些系统的光化学，并探索了证明硫代酰胺淬灭荧光素在研究蛋白质折叠和蛋白水解中的效用的应用。
• Ribosomal Formation of Thioamide Bonds in Polypeptide Synthesis
  作者：Rumit Maini、Hiroyuki Kimura、Ryo Takatsuji、Takayuki Katoh、Yuki Goto、Hiroaki Suga

  DOI：10.1021/jacs.9b11097

  日期：2019.12.26

  electrophile in P site other than the carboxyl group during elongation. Here we report ribosomal formation of thioamide bond in the mRNA-dependent polypeptide synthesis. In this study, amino(carbothio)acyl-tRNA was prepared by flexizyme and used for the expression of peptides containing a thioamide bond in the nascent peptide chain. We have given strong evidence that the thioamide-peptide was formed but

  已经很好地确定，在延伸过程中，核糖体可以在 A 位点的 Xacyl-tRNA 上接受各种亲核试剂，其中 X 可以是氨基、N-烷基-氨基、羟基和硫醇基团。然而，在延伸过程中，核糖体是否能够接受除羧基以外的 P 位点的亲电子试剂，这一点仍然难以捉摸。在这里，我们报告了 mRNA 依赖性多肽合成中硫代酰胺键的核糖体形成。在本研究中，氨基（碳硫基）酰基-tRNA 是通过 flexizyme 制备的，用于表达在新生肽链中含有硫代酰胺键的肽。我们已经提供了强有力的证据表明硫代酰胺肽是形成的，但由于在氨基（硫代）酰基-tRNA 的制备过程中快速的碳（S-to-O）交换而伴随着酰胺对应物。
• Total Synthesis of Halipeptin A: A Potent Antiinflammatory Cyclic Depsipeptide
  作者：Shouyun Yu、Xianhua Pan、Xianfeng Lin、Dawei Ma

  DOI：10.1002/anie.200461239

  日期：2005.1