ethyl 2-(N-(2-(4-((N-(2-(tert-Butyldimethylsilyloxy)ethyl)-uracil-1-yl-acetamido)methyl)-1H-1,2,3-triazol-1-yl)ethyl)-uracil-1-yl-acetamido)acetate | 1313022-57-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: ethyl 2-(N-(2-(4-((N-(2-(tert-Butyldimethylsilyloxy)ethyl)-uracil-1-yl-acetamido)methyl)-1H-1,2,3-triazol-1-yl)ethyl)-uracil-1-yl-acetamido)acetate
• 英文别名: Ethyl 2-[2-[4-[[2-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxyethyl-[2-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)acetyl]amino]methyl]triazol-1-yl]ethyl-[2-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)acetyl]amino]acetate
• CAS: 1313022-57-9
• 化学式: C₂₉H₄₃N₉O₉Si
• 分子量: 689.801
• InChiKey: VQQOHCFKLZQIMV-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.88
• 重原子数：
  48
• 可旋转键数：
  18
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.55
• 拓扑面积：
  206
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  ethyl 2-(N-(2-(4-((N-(2-(tert-Butyldimethylsilyloxy)ethyl)-uracil-1-yl-acetamido)methyl)-1H-1,2,3-triazol-1-yl)ethyl)-uracil-1-yl-acetamido)acetate 在 锂硼氢 作用下， 以 四氢呋喃 、 吡啶 、 甲醇 为溶剂， 反应 1.5h， 生成 N-(2-(bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)ethyl)-2-(uracil-1-yl)-N-(2-(4-((2-(uracil-1-yl)-N-(2-((2,3,3-trimethylbutan-2-yl)oxy)ethyl)acetamido)methyl)-1H-1,2,3-triazol-1-yl)ethyl)acetamide
  参考文献：
  名称：

  含有三唑连接的核酸二聚体的寡核苷酸的合成和性质

  摘要：

  在主链位点需要新的经化学修饰的寡核苷酸以改善寡核苷酸的性质。已经开发出了一种实用的合成方法，该方法是基于PNA样结构的三唑连接的核苷二聚体。这涉及到合成两个含有叠氮化物或炔烃官能团的基于尿嘧啶的单体，然后合成铜催化的1,3-偶极环加成反应。该二聚体通过亚磷酰胺化学作用被掺入寡核苷酸中，紫外线监测的热变性数据表明，相对于其靶互补序列而言，其轻微不稳定。这种经过化学修饰的二聚体可用于将来在基于DNA和RNA的应用中对其性质的研究。J.杂环化​​学。（2011）。

  DOI：

  10.1002/jhet.532
• 作为产物：
  描述：

  2-(叔丁基二甲基硅氧基)乙胺 在 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 copper(II) sulfate 、 sodium ascorbate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 叔丁醇 为溶剂， 反应 51.5h， 生成 ethyl 2-(N-(2-(4-((N-(2-(tert-Butyldimethylsilyloxy)ethyl)-uracil-1-yl-acetamido)methyl)-1H-1,2,3-triazol-1-yl)ethyl)-uracil-1-yl-acetamido)acetate
  参考文献：
  名称：

  含有三唑连接的核酸二聚体的寡核苷酸的合成和性质

  摘要：

  在主链位点需要新的经化学修饰的寡核苷酸以改善寡核苷酸的性质。已经开发出了一种实用的合成方法，该方法是基于PNA样结构的三唑连接的核苷二聚体。这涉及到合成两个含有叠氮化物或炔烃官能团的基于尿嘧啶的单体，然后合成铜催化的1,3-偶极环加成反应。该二聚体通过亚磷酰胺化学作用被掺入寡核苷酸中，紫外线监测的热变性数据表明，相对于其靶互补序列而言，其轻微不稳定。这种经过化学修饰的二聚体可用于将来在基于DNA和RNA的应用中对其性质的研究。J.杂环化​​学。（2011）。

  DOI：

  10.1002/jhet.532