Analysis of the in vitro antitumor activity of novel purine-6-sulfenamide, -sulfinamide, and -sulfonamide nucleosides and certain related compounds using a computer-aided receptor modeling procedure
作者:Vellarkad N. Viswanadhan、Arup K. Ghose、Naeem B. Hanna、Steven S. Matsumoto、Thomas L. Avery、Ganapathi R. Revankar、Roland K. Robins
DOI:10.1021/jm00106a007
日期:1991.2
minimum energy conformation of (R,S)-2-amino-9-beta-D-ribofuranosylpurine-6-sulfinamide (sulfinosine, 5), an effective antileukemic agent in vivo, in the data set. The model fit the biological data with a standard deviation of 0.363, a correlation coefficient of 0.933 and a explained variance of 0.815. The method targeted a syn conformation as the probable active form and the 2'-OH, 5'-OH as well as
最近使用培养的L1210细胞确定了21种新核苷的相对抗白血病活性,并通过计算机辅助受体建模方法(REMOTEDISC)分析了与结构相关的功效(Ghose,AK; et al.J.Med。 Chem.1989,32,746)。该算法可以归类为3D-QSAR方法,包括以下步骤:从活性化合物的低能构象中选择参考结构;自动叠加其他化合物的低能构象,从而使基于原子的物理化学性质具有最大的匹配(或重叠);从重叠分子的原子位置构造结合位点腔;反向逐步回归分析确定部位腔不同区域各种理化性质的相对重要性。该模型基于数据集中的有效体内抗白血病药物(R,S)-2-氨基-9-β-D-呋喃呋喃糖基嘌呤-6-亚磺酰胺(亚磺酰胺,5)的最小能量构象。该模型拟合的生物学数据的标准偏差为0.363,相关系数为0.933,解释方差为0.815。该方法以顺式构象为可能的活性形式为目标,嘌呤环的2'-OH,5'-OH以及C2-N