1-(3-deoxy-3-fluoro-β-D-glucopyranosyl)cytosine | 1167430-57-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 1-(3-deoxy-3-fluoro-β-D-glucopyranosyl)cytosine
• 英文别名: 4-amino-1-(3-deoxy-3-fluoro-beta-D-glucopyranosyl)pyrimidin-2(1H)-one；4-amino-1-[(2R,3S,4S,5R,6R)-4-fluoro-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]pyrimidin-2-one
• CAS: 1167430-57-0
• 化学式: C₁₀H₁₄FN₃O₅
• 分子量: 275.237
• InChiKey: AGFREDUIXIMAKC-PMPOVCSBSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.7
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  129
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-(3-deoxy-3-fluoro-β-D-glucopyranosyl)cytosine 在 sodium dithionite 、 2,2,6,6-四甲基哌啶氧化物 、 碘苯二乙酸 、 S-腺苷-L-蛋氨酸 、 iron-sulfur reconstituted radical S‑adenosylmethionine enzyme BlsE 、 碳酸氢钠 、 sodium chloride 、 1,4-二巯基-2,3-丁二醇 作用下， 以 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 13.0h， 生成 脱氧腺嘌呤核苷
  参考文献：
  名称：

  自由基 S-腺苷甲硫氨酸酶 BlsE 在杀稻瘟菌素 S 生物合成过程中催化自由基介导的 1,2-二醇脱水

  摘要：

  由于自由基S-腺苷甲硫氨酸 (SAM) 酶 BlsE的参与，杀稻瘟菌素 S 的生物合成引起了人们的关注。最初将 BlsE 指定为自由基介导的氧化还原中性脱羧酶是不寻常的，因为该反应似乎没有生物合成目的，需要通过随后的羧化步骤来逆转。此外，除了 BlsE 之外，迄今为止报道的所有其他自由基 SAM 脱羧酶本质上都是氧化的。然而，对 BlsE 反应的仔细分析表明，BlsE 不是脱羧酶，而是一种裂解酶，它催化 cytosylglucuronic acid (CGA) 脱水形成 cytosyl-4'-keto-3'-deoxy- d -glucuronic acid，其可以在体外快速非酶脱羧. 对底物同位素、氟化类似物以及基于 BlsE·SAM (2.09 Å) 和 BlsE·SAM·CGA (2.62 Å) 配合物的 X 射线晶体结构的计算模型的分析表明，BlsE 催化可能通过直接消除来自 CGA

  DOI：

  10.1021/jacs.1c12010
• 作为产物：
  描述：

  1-(3-deoxy-3-fluoro-2,4,6-tri-O-acetyl-β-D-glucopyranosyl)-N⁴-benzoylcytosine 在 甲醇 、 氨 作用下， 反应 4.0h， 生成 1-(3-deoxy-3-fluoro-β-D-glucopyranosyl)cytosine
  参考文献：
  名称：

  合成 3-fluoro-6-S-(2-S-pyridyl) 核苷作为潜在的先导细胞抑制剂

  摘要：

  3-脱氧-3-氟-6-小号- （2-小号吡啶基）-6-硫代β - d吡喃葡萄糖基的核苷类似物7制备通过2条容易合成路线。它们的前体，3-氟-6-硫代-吡喃葡萄糖基核苷5a - e，是通过 3-脱氧-3-氟-β - d-吡喃葡萄糖基核苷2a - e的脱乙酰化序列，选择性甲苯磺酰化的初级 OH 获得的。3最后用硫代乙酸钾处理。所需的硫醇吡啶保护的类似物7a - c，˚F，克由脱乙酰的序列获得5A - Ç随后thiopyridinylation和/或与新合成的全乙酰-6-相应杂环碱缩合小号- （2-小号吡啶基）糖前体13，其中获得通过从糖基供体12的新合成路线。化合物6和7均不显示抗病毒活性，但5-氟尿嘧啶衍生物7c，尤其是尿嘧啶衍生物7b 被赋予了对多种鼠类和人肿瘤细胞培养物的有趣且选择性的细胞抑制作用。

  DOI：

  10.1016/j.bioorg.2010.08.001

文献信息

• Synthesis of 3-fluoro-6-S-(2-S-pyridyl) nucleosides as potential lead cytostatic agents
  作者：Evangelia Tsoukala、Niki Tzioumaki、Stella Manta、Alexandra Riga、Jan Balzarini、Dimitri Komiotis

  DOI：10.1016/j.bioorg.2010.08.001

  日期：2010.12

  were prepared via two facile synthetic routes. Their precursors, 3-fluoro-6-thio-glucopyranosyl nucleosides 5a-e, were obtained by the sequence of deacetylation of 3-deoxy-3-fluoro-β-d-glucopyranosyl nucleosides 2a-e, selective tosylation of the primary OH of 3 and finally treatment with potassium thioacetate. The desired thiolpyridine protected analogs 7a-c,f,g were obtained by the sequence of deacetylation

  3-脱氧-3-氟-6-小号- （2-小号吡啶基）-6-硫代β - d吡喃葡萄糖基的核苷类似物7制备通过2条容易合成路线。它们的前体，3-氟-6-硫代-吡喃葡萄糖基核苷5a - e，是通过 3-脱氧-3-氟-β - d-吡喃葡萄糖基核苷2a - e的脱乙酰化序列，选择性甲苯磺酰化的初级 OH 获得的。3最后用硫代乙酸钾处理。所需的硫醇吡啶保护的类似物7a - c，˚F，克由脱乙酰的序列获得5A - Ç随后thiopyridinylation和/或与新合成的全乙酰-6-相应杂环碱缩合小号- （2-小号吡啶基）糖前体13，其中获得通过从糖基供体12的新合成路线。化合物6和7均不显示抗病毒活性，但5-氟尿嘧啶衍生物7c，尤其是尿嘧啶衍生物7b 被赋予了对多种鼠类和人肿瘤细胞培养物的有趣且选择性的细胞抑制作用。
• Radical <i>S</i>-Adenosyl Methionine Enzyme BlsE Catalyzes a Radical-Mediated 1,2-Diol Dehydration during the Biosynthesis of Blasticidin S
  作者：Yu-Hsuan Lee、Xueli Hou、Ridao Chen、Jianqiang Feng、Xiao Liu、Mark W. Ruszczycky、Jin-Ming Gao、Binju Wang、Jiahai Zhou、Hung-wen Liu

  DOI：10.1021/jacs.1c12010

  日期：2022.3.16

  instead a lyase that catalyzes the dehydration of cytosylglucuronic acid (CGA) to form cytosyl-4′-keto-3′-deoxy-d-glucuronic acid, which can rapidly decarboxylate nonenzymatically in vitro. Analysis of substrate isotopologs, fluorinated analogues, as well as computational models based on X-ray crystal structures of the BlsE·SAM (2.09 Å) and BlsE·SAM·CGA (2.62 Å) complexes suggests that BlsE catalysis

  由于自由基S-腺苷甲硫氨酸 (SAM) 酶 BlsE的参与，杀稻瘟菌素 S 的生物合成引起了人们的关注。最初将 BlsE 指定为自由基介导的氧化还原中性脱羧酶是不寻常的，因为该反应似乎没有生物合成目的，需要通过随后的羧化步骤来逆转。此外，除了 BlsE 之外，迄今为止报道的所有其他自由基 SAM 脱羧酶本质上都是氧化的。然而，对 BlsE 反应的仔细分析表明，BlsE 不是脱羧酶，而是一种裂解酶，它催化 cytosylglucuronic acid (CGA) 脱水形成 cytosyl-4'-keto-3'-deoxy- d -glucuronic acid，其可以在体外快速非酶脱羧. 对底物同位素、氟化类似物以及基于 BlsE·SAM (2.09 Å) 和 BlsE·SAM·CGA (2.62 Å) 配合物的 X 射线晶体结构的计算模型的分析表明，BlsE 催化可能通过直接消除来自 CGA