1-(3'-deoxy-3'-fluoro-β-D-glucopyranosyl)thymine | 1198771-68-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 1-(3'-deoxy-3'-fluoro-β-D-glucopyranosyl)thymine
• 英文别名: 1-[(2R,3S,4S,5R,6R)-4-fluoro-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 1198771-68-4
• 化学式: C₁₁H₁₅FN₂O₆
• 分子量: 290.248
• InChiKey: GQSOYHMDBXEVCB-MGPZHUSASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.2
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.64
• 拓扑面积：
  119
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-(3'-deoxy-3'-fluoro-β-D-glucopyranosyl)thymine 在 吡啶 、 甲醇 、 氨 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 9.0h， 生成 1,1'-((2R,2'R,3S,3'S,4S,4'S,5R,5'R,6S,6'S)-(disulfanediylbis(methylene))bis(4-fluoro-3,5-dihydroxytetrahydro-2H-pyran-6,2-diyl))bis(5-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione)
  参考文献：
  名称：

  合成 3-fluoro-6-S-(2-S-pyridyl) 核苷作为潜在的先导细胞抑制剂

  摘要：

  3-脱氧-3-氟-6-小号- （2-小号吡啶基）-6-硫代β - d吡喃葡萄糖基的核苷类似物7制备通过2条容易合成路线。它们的前体，3-氟-6-硫代-吡喃葡萄糖基核苷5a - e，是通过 3-脱氧-3-氟-β - d-吡喃葡萄糖基核苷2a - e的脱乙酰化序列，选择性甲苯磺酰化的初级 OH 获得的。3最后用硫代乙酸钾处理。所需的硫醇吡啶保护的类似物7a - c，˚F，克由脱乙酰的序列获得5A - Ç随后thiopyridinylation和/或与新合成的全乙酰-6-相应杂环碱缩合小号- （2-小号吡啶基）糖前体13，其中获得通过从糖基供体12的新合成路线。化合物6和7均不显示抗病毒活性，但5-氟尿嘧啶衍生物7c，尤其是尿嘧啶衍生物7b 被赋予了对多种鼠类和人肿瘤细胞培养物的有趣且选择性的细胞抑制作用。

  DOI：

  10.1016/j.bioorg.2010.08.001
• 作为产物：
  描述：

  1-(2,4,6-tri-O-acetyl-3-deoxy-3-fluoro-β-D-glucopyranosyl)thymine 在 氨 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 4.0h， 以90%的产率得到1-(3'-deoxy-3'-fluoro-β-D-glucopyranosyl)thymine
  参考文献：
  名称：

  不饱和双脱氧氟-酮吡喃糖基核苷作为新的细胞抑制剂：尿嘧啶，5-氟尿嘧啶，胸腺嘧啶，N 4-苯甲酰胞嘧啶和N 6-苯甲酰腺嘌呤

  摘要：

  通过过乙酰化的3-脱氧的缩合反应合成了尿嘧啶（2a），5-氟尿嘧啶（2b），胸腺嘧啶（2c），N 4-苯甲酰基胞嘧啶（2d）和N 6-苯甲酰基腺嘌呤（2e）的β-保护核苷。-3-氟- d -glucopyranose（1）与相应的甲硅烷基化碱基。核苷被脱乙酰基化，随后的几个保护和脱保护步骤提供了部分乙酰化的类似物6a - e。选择性碘化然后氢化得到尿嘧啶的乙酰化双脱氧类似物（8a），5-氟尿嘧啶（8b），胸腺嘧啶（8c），N 4-苯甲酰基胞嘧啶（8d）和N 6-苯甲酰基腺嘌呤（8e）。最后，在8a - e的4'位置上直接氧化游离羟基，同时消除β-乙酰氧基的反应，得到所需的不饱和2,6-二脱氧-3-氟-4-酮-β - d吡喃葡萄糖基衍生物9A - ë。评价了新的类似物的抗病毒和细胞抑制活性。化合物9a – e在亚毒性浓度下对广泛的DNA和RNA病毒没有活性。然而，它们对多种肿瘤细胞系具有明显

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2009.06.013

文献信息

• Unsaturated dideoxy fluoro-ketopyranosyl nucleosides as new cytostatic agents: A convenient synthesis of 2,6-dideoxy-3-fluoro-4-keto-β-d-glucopyranosyl analogues of uracil, 5-fluorouracil, thymine, N4-benzoyl cytosine and N6-benzoyl adenine
  作者：Stella Manta、Niki Tzioumaki、Evangelia Tsoukala、Aggeliki Panagiotopoulou、Maria Pelecanou、Jan Balzarini、Dimitri Komiotis

  DOI：10.1016/j.ejmech.2009.06.013

  日期：2009.11

  acetylated dideoxy analogues of uracil (8a), 5-fluorouracil (8b), thymine (8c), N4-benzoyl cytosine (8d) and N6-benzoyl adenine (8e), respectively. Finally, direct oxidation of the free hydroxyl group at the 4′-position of 8a–e, and simultaneous elimination reaction of the β-acetoxyl group, afforded the desired unsaturated 2,6-dideoxy-3-fluoro-4-keto-β-d-glucopyranosyl derivatives 9a–e. The new analogues were

  通过过乙酰化的3-脱氧的缩合反应合成了尿嘧啶（2a），5-氟尿嘧啶（2b），胸腺嘧啶（2c），N 4-苯甲酰基胞嘧啶（2d）和N 6-苯甲酰基腺嘌呤（2e）的β-保护核苷。-3-氟- d -glucopyranose（1）与相应的甲硅烷基化碱基。核苷被脱乙酰基化，随后的几个保护和脱保护步骤提供了部分乙酰化的类似物6a - e。选择性碘化然后氢化得到尿嘧啶的乙酰化双脱氧类似物（8a），5-氟尿嘧啶（8b），胸腺嘧啶（8c），N 4-苯甲酰基胞嘧啶（8d）和N 6-苯甲酰基腺嘌呤（8e）。最后，在8a - e的4'位置上直接氧化游离羟基，同时消除β-乙酰氧基的反应，得到所需的不饱和2,6-二脱氧-3-氟-4-酮-β - d吡喃葡萄糖基衍生物9A - ë。评价了新的类似物的抗病毒和细胞抑制活性。化合物9a – e在亚毒性浓度下对广泛的DNA和RNA病毒没有活性。然而，它们对多种肿瘤细胞系具有明显
• Synthesis of 4,6-dideoxy-3-fluoro-2-keto-β-d-glucopyranosyl analogues of 5-fluorouracil, N6-benzoyl adenine, uracil, thymine, N4-benzoyl cytosine and evaluation of their antitumor activities
  作者：Stella Manta、Evangelia Tsoukala、Niki Tzioumaki、Christos Kiritsis、Jan Balzarini、Dimitri Komiotis

  DOI：10.1016/j.bioorg.2009.11.001

  日期：2010.4

  desired unsaturated 4,6-dideoxy-3-fluoro-2-keto-β-d-glucopyranosyl derivatives 6a,b. Compounds 1c–e were used as starting materials for the synthesis of the dideoxy unsaturated carbonyl nucleosides of uracil (6c), thymine (6d) and N4-benzoyl cytosine (6e). Similarly a protection-selective deprotection sequence followed by oxidation of the free hydroxyl group at the 2′-position of the dideoxy benzoylated

  5-氟尿嘧啶（6a），N 6-苯甲酰腺嘌呤（6b），尿嘧啶（6c），胸腺嘧啶（6d）的不饱和4,6-二脱氧-3-氟-2-酮-β- d-吡喃葡萄糖基核苷的合成）和N 4-苯甲酰基胞嘧啶（6e）。化合物1a，b的单碘化，然后进行乙酰化，催化氢化，最后进行区域选择性2'- O-去酰化，得到5-氟尿嘧啶（5a）和N 6-苯甲酰腺嘌呤（5b）的部分乙酰化双脱氧核苷类似物）， 分别。在5a，b的2'-位上的游离羟基直接氧化，同时消除β-乙酰氧基，得到所需的不饱和4,6-二脱氧-3-氟-2-酮-β- d -吡喃葡萄糖基衍生物6a，b。化合物1c – e被用作合成尿嘧啶（6c），胸腺嘧啶（6d）和N 4-苯甲酰基胞嘧啶（6e）的双脱氧不饱和羰基核苷的原料。）。同样，通过选择保护性脱保护序列，然后在双脱氧苯甲酰化类似物9c - e的2'-位上的游离羟基被氧化，同时消除β-苯甲酰基的反应，得到了所需的核苷6c
• Synthesis of 3-fluoro-6-S-(2-S-pyridyl) nucleosides as potential lead cytostatic agents
  作者：Evangelia Tsoukala、Niki Tzioumaki、Stella Manta、Alexandra Riga、Jan Balzarini、Dimitri Komiotis

  DOI：10.1016/j.bioorg.2010.08.001

  日期：2010.12

  were prepared via two facile synthetic routes. Their precursors, 3-fluoro-6-thio-glucopyranosyl nucleosides 5a-e, were obtained by the sequence of deacetylation of 3-deoxy-3-fluoro-β-d-glucopyranosyl nucleosides 2a-e, selective tosylation of the primary OH of 3 and finally treatment with potassium thioacetate. The desired thiolpyridine protected analogs 7a-c,f,g were obtained by the sequence of deacetylation

  3-脱氧-3-氟-6-小号- （2-小号吡啶基）-6-硫代β - d吡喃葡萄糖基的核苷类似物7制备通过2条容易合成路线。它们的前体，3-氟-6-硫代-吡喃葡萄糖基核苷5a - e，是通过 3-脱氧-3-氟-β - d-吡喃葡萄糖基核苷2a - e的脱乙酰化序列，选择性甲苯磺酰化的初级 OH 获得的。3最后用硫代乙酸钾处理。所需的硫醇吡啶保护的类似物7a - c，˚F，克由脱乙酰的序列获得5A - Ç随后thiopyridinylation和/或与新合成的全乙酰-6-相应杂环碱缩合小号- （2-小号吡啶基）糖前体13，其中获得通过从糖基供体12的新合成路线。化合物6和7均不显示抗病毒活性，但5-氟尿嘧啶衍生物7c，尤其是尿嘧啶衍生物7b 被赋予了对多种鼠类和人肿瘤细胞培养物的有趣且选择性的细胞抑制作用。
• Kinetic and in silico analysis of the slow-binding inhibition of human poly(A)-specific ribonuclease (PARN) by novel nucleoside analogues
  作者：Nikolaos Balatsos、Dimitrios Vlachakis、Vassiliki Chatzigeorgiou、Stella Manta、Dimitri Komiotis、Metaxia Vlassi、Constantinos Stathopoulos

  DOI：10.1016/j.biochi.2011.10.011

  日期：2012.1

  efficiently degrades poly(A) tails and regulates, in part, mRNA turnover rates. We have previously reported that adenosine- and cytosine-based glucopyranosyl nucleoside analogues with adequate tumour-inhibitory effect could effectively inhibit PARN. In the present study we dissect the mechanism of a more drastic inhibition of PARN by novel glucopyranosyl analogues bearing uracil, 5-fluorouracil or thymine as

  聚（A）特异性核糖核酸酶（PARN）是一种3'-外切核糖核酸酶，可有效降解聚（A）尾巴并部分调节mRNA周转率。我们以前曾报道过，基于腺苷和胞嘧啶的吡喃葡萄糖基核苷类似物具有足够的肿瘤抑制作用，可以有效抑制PARN。在本研究中，我们剖析了以尿嘧啶，5-氟尿嘧啶或胸腺嘧啶为基础部分的新型吡喃葡萄糖基类似物对PARN的更强烈抑制的机制。动力学分析表明，其中三种化合物是PARN的竞争性抑制剂，在低μM浓度下具有K（i）值，与我们以前的研究相比，显着更低（11至33倍）。对最有效的抑制剂，基于尿嘧啶的核苷类似物（命名为U1）进行的详细动力学分析显示，其结合缓慢。随后的分子对接实验表明，所有抑制PARN的化合物都可以通过特异性相互作用有效地结合到酶的活性位点。本研究剖析了这种新颖的基于尿嘧啶的化合物的抑制机理，该化合物通过在PARN的活性位点通过缓慢结合和缓慢释放模式来延长其抑制作用，从而有助于更有