3'-S-(2-N-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)aminoethylthio)-3'-deoxythymidine-5'-triphosphate | 261960-05-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷酸
• 英文名称: 3'-S-(2-N-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)aminoethylthio)-3'-deoxythymidine-5'-triphosphate
• 英文别名: 9H-fluoren-9-ylmethyl N-[2-[(2R,3S,5R)-2-[[hydroxy-[hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxyphosphoryl]oxymethyl]-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]sulfanylethyl]carbamate
• CAS: 261960-05-8
• 化学式: C₂₇H₃₂N₃O₁₅P₃S
• 分子量: 763.549
• InChiKey: QJTPVZKBBZRHDC-TZRRMPRUSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.6
• 重原子数：
  49
• 可旋转键数：
  15
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.37
• 拓扑面积：
  282
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  16

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3'-S-(2-N-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)aminoethylthio)-3'-deoxythymidine-5'-triphosphate 在 哌啶 、 吡啶 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 1.0h， 以77%的产率得到3'-S-(2-aminoethylthio)-3'-deoxythymidine-5'-triphosphate
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of 3′-S-(2-Aminoethylthio)-3′-deoxythymidine-5′-triphosphates

  摘要：

  通过处理 5'-O-( 4,4'-二甲氧基三苯甲基)-2,3'-脱水胸苷 (2) 与 N-(2-巯基乙基)氨基甲酸叔丁酯 (1) 和 DBU。化合物3进一步转化为3'-S-(2-N-(叔丁氧基羰基)氨基乙硫基)-3'-脱氧胸苷-5'-三磷酸(5)和3'-S-(2-氨基乙硫基)-3' -脱氧胸苷-5'-三磷酸 (9)。后一种化合物用近红外荧光染料标记。

  DOI：

  10.1055/s-2000-6224
• 作为产物：
  描述：

  2,3'-anhydro-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)thymidine 在 三正丁胺 、 (Bu₃NH)P₂O₇ 、 碳酸氢钠 、 溶剂黄146 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 、 三氟乙酸 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 吡啶 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 丙酮 为溶剂， 反应 29.19h， 生成 3'-S-(2-N-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)aminoethylthio)-3'-deoxythymidine-5'-triphosphate
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of 3′-S-(2-Aminoethylthio)-3′-deoxythymidine-5′-triphosphates

  摘要：

  通过处理 5'-O-( 4,4'-二甲氧基三苯甲基)-2,3'-脱水胸苷 (2) 与 N-(2-巯基乙基)氨基甲酸叔丁酯 (1) 和 DBU。化合物3进一步转化为3'-S-(2-N-(叔丁氧基羰基)氨基乙硫基)-3'-脱氧胸苷-5'-三磷酸(5)和3'-S-(2-氨基乙硫基)-3' -脱氧胸苷-5'-三磷酸 (9)。后一种化合物用近红外荧光染料标记。

  DOI：

  10.1055/s-2000-6224

文献信息

• Synthesis of 3′-S-(2-Aminoethylthio)-3′-deoxythymidine-5′-triphosphates
  作者：Christian Wojczewski、Joachim W. Engels

  DOI：10.1055/s-2000-6224

  日期：——

  3′-S-(2-N-(t-Butyloxycarbonyl)aminoethylthio)-3′-deoxy-5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)thymidine (3) was synthesized by treating 5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)-2,3′-anhydrothymidine (2) with t-butyl N-(2-mercaptoethyl)carbamate (1) and DBU. Compound 3 was further converted to 3′-S-(2-N-(t-butyloxycarbonyl)aminoethylthio)-3′-deoxythymidine-5′-triphosphate (5) and 3′-S-(2-aminoethylthio)-3′-deoxythymidine-5′-triphosphate (9). The latter compound was labeled with a near-IR fluorescent dye.

  通过处理 5'-O-( 4,4'-二甲氧基三苯甲基)-2,3'-脱水胸苷 (2) 与 N-(2-巯基乙基)氨基甲酸叔丁酯 (1) 和 DBU。化合物3进一步转化为3'-S-(2-N-(叔丁氧基羰基)氨基乙硫基)-3'-脱氧胸苷-5'-三磷酸(5)和3'-S-(2-氨基乙硫基)-3' -脱氧胸苷-5'-三磷酸 (9)。后一种化合物用近红外荧光染料标记。