| 1192494-14-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• CAS: 1192494-14-6
• 化学式: C₂HF₃O₂*C₁₆H₂₂N₄O₅
• 分子量: 464.398
• InChiKey: VJQKJWNOPCRHTI-FXMYHANSSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.68
• 重原子数：
  32.0
• 可旋转键数：
  10.0
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.39
• 拓扑面积：
  204.9
• 氢给体数：
  5.0
• 氢受体数：
  7.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  、 (2R)-2-[4-(bis-benzyloxy-phosphoryloxy)-benzyl]-N-methyl-succinamic acid 在 N-甲基吗啉 、 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 17.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  蛋白质-配体相互作用中构象约束的热力学和结构效应。与配体预组织相关的熵悖论

  摘要：

  琥珀酸和环丙烷衍生的磷酸酪氨酸 (pY) 置换被纳入一系列 Grb2 SH2 结合配体，其中 pY+1 残基发生变化，以确定配体预组织的变化如何影响结合能量学和结构。这些配体与 Grb2 SH2 结构域的配合物在一系列热力学和结构研究中使用等温滴定量热法和 X 射线晶体学进行了检查。所有配体的结合焓都是有利的，尽管在 pY+1 位点具有疏水残基的所有配体的结合熵是有利的，但在该位点具有亲水残基的那些的结合熵是不利的。与灵活的控制相比，预组织的配体通常与更有利的吉布斯能量结合，但这种增加的亲和力是相对更有利的结合焓的结果。出乎意料的是，相对于它们的灵活控制，受限配体的结合熵一致不受欢迎，这表明普遍认为配体预组织应该导致熵优势的观点不一定正确。对在 pY+1 位置具有相同氨基酸的几种柔性和受限配体的复合物的晶体学研究揭示了广泛的相似性，但存在一些显着的差异。在受限配体的复合物中有更多的直接极性

  DOI：

  10.1021/ja904698q
• 作为产物：
  描述：

  Boc-Glu(OBzl)-Asn-NH2 、 三氟乙酸 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 4.0h， 以92%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  蛋白质-配体相互作用中构象约束的热力学和结构效应。与配体预组织相关的熵悖论

  摘要：

  琥珀酸和环丙烷衍生的磷酸酪氨酸 (pY) 置换被纳入一系列 Grb2 SH2 结合配体，其中 pY+1 残基发生变化，以确定配体预组织的变化如何影响结合能量学和结构。这些配体与 Grb2 SH2 结构域的配合物在一系列热力学和结构研究中使用等温滴定量热法和 X 射线晶体学进行了检查。所有配体的结合焓都是有利的，尽管在 pY+1 位点具有疏水残基的所有配体的结合熵是有利的，但在该位点具有亲水残基的那些的结合熵是不利的。与灵活的控制相比，预组织的配体通常与更有利的吉布斯能量结合，但这种增加的亲和力是相对更有利的结合焓的结果。出乎意料的是，相对于它们的灵活控制，受限配体的结合熵一致不受欢迎，这表明普遍认为配体预组织应该导致熵优势的观点不一定正确。对在 pY+1 位置具有相同氨基酸的几种柔性和受限配体的复合物的晶体学研究揭示了广泛的相似性，但存在一些显着的差异。在受限配体的复合物中有更多的直接极性

  DOI：

  10.1021/ja904698q