cytidylyl-(5'->3')-adenylyl-(5'->3')-adenosine | 2760-27-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 核苷和核苷酸类似物
• 英文名称: cytidylyl-(5'->3')-adenylyl-(5'->3')-adenosine
• 英文别名: Cytidylyl-(5'.3')-adenylyl-(5'.3')-adenosine；[(2R,3S,4R,5R)-3-[[(2R,3S,4R,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxyoxolan-2-yl]methyl [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxy-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate
• CAS: 2760-27-2
• 化学式: C₂₉H₃₇N₁₃O₁₇P₂
• 分子量: 901.637
• InChiKey: KRKSSBZCVSQPAA-LFTIVBHHSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -8.3
• 重原子数：
  61
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  8.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.52
• 拓扑面积：
  438
• 氢给体数：
  10
• 氢受体数：
  25

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  在 ammonium hydroxide 作用下， 生成 cytidylyl-(5'->3')-adenylyl-(5'->3')-adenosine
  参考文献：
  名称：

  转移核糖核酸及其相关化合物的研究。XXXVIII。通过使用3'，5'-未取代的核苷合成核糖寡核苷酸的快速方法。含有大肠杆菌tRNA fMet反密码子三联体的六核苷酸的合成。

  摘要：

  N-保护的2'-O-(o-硝基苯基)核苷被用作保护核苷3'-磷酸的缩合单元。在形成3'-5'连接后，二核苷酸单磷酸的3'-羟基通过与醚p-氯苯基磷酸和DCC或p-氯苯基磷酸二三唑化物反应被磷酸化。该二核苷酸进一步通过与N和2'-O-保护核苷的缩合进行3'-方向的延伸，随后进行磷酸化。通过这一程序制备了保护的C-Gp和C-A-Up。该三聚体被用于合成六聚体C-A-U-A-A-C，方法是与含有3'-O-(o-硝基苯基)的三聚体区块缩合。该六聚体对应于大肠杆菌tRNAMetf的35到40号碱基，位于反密码子环中。还通过该方法合成了一个中间位置含有尿苷的三聚体，并结合了中间体的提取程序，以便快速分离。

  DOI：

  10.1248/cpb.29.759