cyclo-(AcIIPP-γ-IPPP-(S)-Cys)-β-Dp | 1346132-60-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: cyclo-(AcIIPP-γ-IPPP-(S)-Cys)-β-Dp
• 英文别名: (54S)-N-[3-[3-(dimethylamino)propylamino]-3-oxopropyl]-5,11,17,28,34,40,46,58-octamethyl-3,9,15,21,26,32,38,44,50,56-decaoxo-52-thia-2,5,8,11,14,17,20,25,28,31,34,37,40,43,46,49,55,58,61,62,65-henicosazanonacyclo[55.2.1.14,7.110,13.116,19.127,30.133,36.139,42.145,48]heptahexaconta-1(59),4(67),6,10(66),12,16(65),18,27(64),29,33(63),35,39(62),41,45(61),47,57(60)-hexadecaene-54-carboxamide
• CAS: 1346132-60-2
• 化学式: C₆₂H₇₆N₂₄O₁₂S
• 分子量: 1381.51
• InChiKey: RYESZSMNYOBGHI-LDLOPFEMSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3
• 重原子数：
  99
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  9.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.34
• 拓扑面积：
  456
• 氢给体数：
  12
• 氢受体数：
  17

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  、 N,N-二甲基-1,3-二氨基丙烷 在 benzotriazol-1-yloxyl-tris-(pyrrolidino)-phosphonium hexafluorophosphate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 0.67h， 生成 cyclo-(AcIIPP-γ-IPPP-(S)-Cys)-β-Dp
  参考文献：
  名称：

  半胱氨酸环吡咯-咪唑聚酰胺用于 DNA 小凹槽中的序列特异性识别

  摘要：

  吡咯-咪唑 (PI) 聚酰胺是小的 DNA 结合分子，可以以高亲和力和特异性识别预定的 DNA 序列。发夹 PI 聚酰胺已被深入研究；然而，环状 PI 聚酰胺受到的关注较少，主要是因为它们的合成困难。在这里，我们描述了一种使用半胱氨酸和氯乙酰残基生产 PI 聚酰胺的新型环化方法。环化反应在1小时内完成，转化效率高。该方法可用于生产可识别 7 bp DNA 序列的长环状 PI 聚酰胺。含有两个β-丙氨酸分子的环状PI聚酰胺比相应的发夹PI聚酰胺具有更高的亲和力和特异性，表明环状PI聚酰胺可以作为一种新型的DNA结合分子。

  DOI：

  10.1021/ja207440p