2,3-difluorosialic acid

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 2,3-difluorosialic acid
• 英文别名: DFSA；(2r,3r,4r,5r,6r)-5-(Acetylamino)-2,3-Difluoro-4-Hydroxy-6-[(1r,2r)-1,2,3-Trihydroxypropyl]tetrahydro-2h-Pyran-2-Carboxylic Acid；(2R,3R,4R,5R,6R)-5-acetamido-2,3-difluoro-4-hydroxy-6-[(1R,2R)-1,2,3-trihydroxypropyl]oxane-2-carboxylic acid
• 化学式: C₁₁H₁₇F₂NO₈
• 分子量: 329.255
• InChiKey: HMALKZAXODOYOP-DAXAGCIGSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.4
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.82
• 拓扑面积：
  157
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  methyl 5-acetamido-4,7,8,9-tetra-O-acetyl-3,5-dideoxy-3-fluoro-D-erythro-β-L-manno-2-nonulopyranosyl fluoride 在 sodium 、 sodium hydroxide 作用下， 以 甲醇 、 水 为溶剂， 反应 2.0h， 以120 mg的产率得到2,3-difluorosialic acid
  参考文献：
  名称：

  The synthesis of some mechanistic probes for sialic acid processing enzymes and the labeling of a sialidase from Trypanosoma rangeli

  摘要：

  唾液酸水解酶、转唾液酶和唾液酸转移酶是生物学上重要的酶，负责将唾液酸残基纳入或去除许多细胞表面糖蛋白中。已合成两种氟代唾液酸衍生物作为机理基础失活剂，以探究唾液酸水解酶和转唾液酶的催化机制。这两种化合物已知是Trypanosoma cruzi的一种转唾液酶的共价失活剂。在这里，发现3-氟唾液酸氟化物能共价标记T. rangeli的一种唾液酸水解酶的催化亲核物，涉及的残基为DENSGYSSVL序列中的Tyr346。这是首次证明唾液酸水解酶通过共价糖基-酶中间体进行催化，强烈暗示唾液酸水解酶超家族的所有成员之间存在共同的催化机制。CMP-3-氟唾液酸是一种唾液酸转移酶的竞争性抑制剂，通过从商业可得的N-乙酰甘露胺、3-氟丙酮酸和胞嘧啶三磷酸的两步酶法过程中合成，产率约为84%。关键词：唾液酸水解酶、机制、标记、亲核物、抑制剂。

  DOI：

  10.1139/v04-125

文献信息

• Tuning Mechanism-Based Inactivators of Neuraminidases: Mechanistic and Structural Insights
  作者：Sabrina Buchini、François-Xavier Gallat、Ian R. Greig、Jin-Hyo Kim、Soichi Wakatsuki、Leonard M. G. Chavas、Stephen G. Withers

  DOI：10.1002/anie.201309675

  日期：2014.3.24

  with an equatorial fluorine at C3 than by its axial epimer, with reactivation following the same pattern. To explore a possible stereoelectronic basis for this, rate constants for spontaneous hydrolysis of the full series of four 3‐fluorosialosyl fluorides were measured, and ground‐state energies for each computed. The alpha (equatorial) anomeric fluorides hydrolyze more rapidly than their beta anomers

  3-氟唾液酸氟是唾液酸酶的抑制剂，可通过形成长寿命的共价活性位点加合物而发挥作用，并且如果针对病原体唾液酸酶具有特异性，则具有治疗潜力。令人惊讶的是，人类Neu2和克氏锥虫唾液酸唾液酸酶在C3处具有赤道氟离子的失活比其轴向差向异构体更快地失活，并按照相同的模式进行重新激活。为了探索可能的立体电子基础，测量了四个3-氟唾液酰氟的全系列的自发水解的速率常数，并计算了每个的基态能量。α（赤道）异头氟化物的水解速度比其β端基异构体快，这与它们较高的基态能量一致。但是，基态能量不能解释3氟表观分子的相对自发反应性。人类Neu2的两个3-氟-唾液酸酶中间体的三维结构得到了解决，揭示了Arg21和赤道的但轴向氟之间没有关键的稳定作用。