(R)-2-amino-N-benzyl-3-(1H-indol-3-yl)propanamide

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: (R)-2-amino-N-benzyl-3-(1H-indol-3-yl)propanamide
• 英文别名: (2R)-2-amino-N-benzyl-3-(1H-indol-3-yl)propanamide
• 化学式: C₁₈H₁₉N₃O
• 分子量: 293.368
• InChiKey: LTLVOJXXQDFIPW-MRXNPFEDSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.1
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.17
• 拓扑面积：
  70.9
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  2

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (R)-2-amino-N-benzyl-3-(1H-indol-3-yl)propanamide 在 三异丙基硅烷 、 1-羟基苯并三唑 、 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 (S)-2-amino-N-((R)-1-(benzylamino)-3-(1H-indol-3-yl)-1-oxopropan-2-yl)-4-methylpentanamide
  参考文献：
  名称：

  肽模拟物作为有效的双重 SARS-CoV-2 组织蛋白酶-L 和主要蛋白酶抑制剂：计算机设计、合成和药理学表征

  摘要：

  在本文中，我们介绍了一系列新的拟肽作为有效的 SARS-CoV-2 药物的设计、合成和生物学评价。从我们之前描述的主蛋白酶 (M) 和木瓜蛋白酶样蛋白酶 (PL) 双重抑制剂开始，我们在此公开了其对 SARS-CoV 的新兴靶点组织蛋白酶 L (CTSL) 的高抑制活性 (IC = 19.80 ± 4.44 nM) -2感染机器。受 结构启发的一项设计导致了肽模拟物库的开发，该库显示出针对 CTSL 和 M 的有趣活性，使我们能够追踪与这两种酶结合的化学要求。对感染 5 种不同 SARS-CoV-2 变体的 Vero 细胞进行的筛选突出显示了大多数合成化合物 (、、、和) 的亚微摩尔活性，与酶抑制测定结果一致。这些化合物对几种不同的 RNA 病毒缺乏活性，除了 229E 和 OC43 人类冠状病毒株外，其特征还在于组织蛋白酶-L 依赖性释放到宿主细胞中。还评估了最有前途的衍生物的化学和代谢

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2024.116128
• 作为产物：
  描述：

  (R)-<1-(1H-indol-3-ylmethyl)-2-oxo-2-<(phenylmethyl)amino>ethyl>carbamic acid, 1,1-dimethylethyl ester 在 三异丙基硅烷 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 生成 (R)-2-amino-N-benzyl-3-(1H-indol-3-yl)propanamide
  参考文献：
  名称：

  肽模拟物作为有效的双重 SARS-CoV-2 组织蛋白酶-L 和主要蛋白酶抑制剂：计算机设计、合成和药理学表征

  摘要：

  在本文中，我们介绍了一系列新的拟肽作为有效的 SARS-CoV-2 药物的设计、合成和生物学评价。从我们之前描述的主蛋白酶 (M) 和木瓜蛋白酶样蛋白酶 (PL) 双重抑制剂开始，我们在此公开了其对 SARS-CoV 的新兴靶点组织蛋白酶 L (CTSL) 的高抑制活性 (IC = 19.80 ± 4.44 nM) -2感染机器。受 结构启发的一项设计导致了肽模拟物库的开发，该库显示出针对 CTSL 和 M 的有趣活性，使我们能够追踪与这两种酶结合的化学要求。对感染 5 种不同 SARS-CoV-2 变体的 Vero 细胞进行的筛选突出显示了大多数合成化合物 (、、、和) 的亚微摩尔活性，与酶抑制测定结果一致。这些化合物对几种不同的 RNA 病毒缺乏活性，除了 229E 和 OC43 人类冠状病毒株外，其特征还在于组织蛋白酶-L 依赖性释放到宿主细胞中。还评估了最有前途的衍生物的化学和代谢

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2024.116128

文献信息

• Peptidomimetics as potent dual SARS-CoV-2 cathepsin-L and main protease inhibitors: In silico design, synthesis and pharmacological characterization
  作者：Tania Ciaglia、Vincenzo Vestuto、Veronica Di Sarno、Simona Musella、Gerardina Smaldone、Francesca Di Matteo、Valeria Napolitano、Maria Rosaria Miranda、Giacomo Pepe、Manuela Giovanna Basilicata、Sara Novi、Ilaria Capolupo、Giuseppe Bifulco、Pietro Campiglia、Isabel Gomez-Monterrey、Robert Snoeck、Graciela Andrei、Michele Manfra、Carmine Ostacolo、Gianluigi Lauro、Alessia Bertamino

  DOI：10.1016/j.ejmech.2024.116128

  日期：2024.2

  highlighted sub-micromolar activities for most of the synthesized compounds (, , , and ) in agreement with the enzymatic inhibition assays results. The compounds showed lack of activity against several different RNA viruses except for the 229E and OC43 human coronavirus strains, also characterized by a cathepsin-L dependent release into the host cells. The most promising derivatives were also evaluated

  在本文中，我们介绍了一系列新的拟肽作为有效的 SARS-CoV-2 药物的设计、合成和生物学评价。从我们之前描述的主蛋白酶 (M) 和木瓜蛋白酶样蛋白酶 (PL) 双重抑制剂开始，我们在此公开了其对 SARS-CoV 的新兴靶点组织蛋白酶 L (CTSL) 的高抑制活性 (IC = 19.80 ± 4.44 nM) -2感染机器。受 结构启发的一项设计导致了肽模拟物库的开发，该库显示出针对 CTSL 和 M 的有趣活性，使我们能够追踪与这两种酶结合的化学要求。对感染 5 种不同 SARS-CoV-2 变体的 Vero 细胞进行的筛选突出显示了大多数合成化合物 (、、、和) 的亚微摩尔活性，与酶抑制测定结果一致。这些化合物对几种不同的 RNA 病毒缺乏活性，除了 229E 和 OC43 人类冠状病毒株外，其特征还在于组织蛋白酶-L 依赖性释放到宿主细胞中。还评估了最有前途的衍生物的化学和代谢