(9H-fluoren-9-yl)methyl (3-fluoro-2-oxopropyl)carbamate | 1356333-41-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 英文名称: (9H-fluoren-9-yl)methyl (3-fluoro-2-oxopropyl)carbamate
• 英文别名: 9H-fluoren-9-ylmethyl N-(3-fluoro-2-oxopropyl)carbamate
• CAS: 1356333-41-9
• 化学式: C₁₈H₁₆FNO₃
• 分子量: 313.328
• InChiKey: FSQXXDRQHNYSJZ-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.2
• 重原子数：
  23
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.22
• 拓扑面积：
  55.4
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (9H-fluoren-9-yl)methyl (3-fluoro-2-oxopropyl)carbamate 、 8-((trimethylsilyl)oxy)-7-(1-((trimethylsilyl)oxy)ethyl)nonanoic acid 在 三氟甲磺酸三甲基硅酯 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 26.0h， 以44%的产率得到6-(2-(((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)methyl)-2-(fluoromethyl)-4,6-dimethyl-1,3-dioxan-5-yl)hexanoic acid
  参考文献：
  名称：

  合成不依赖序列的肽基-氟甲基酮的通用固相方法†

  摘要：

  我们在这里提出了一种新的，通用的，固相策略，用于使用标准的Fmoc肽化学方法合成与序列无关的肽基-氟甲基酮。我们的方法是基于双功能接头的合成，其允许在肽序列的C-末端掺入氨基酸氟甲基酮单元。还描述了该方法在针对SENP的基于活性的探针的合成中的应用。

  DOI：

  10.1039/c2ob25096a
• 作为产物：
  描述：

  Fmoc-glycyl(diazo)methane 在 四丁基氟化铵 、 氢溴酸 、 对甲苯磺酸 、 溶剂黄146 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 为溶剂， 反应 4.25h， 生成 (9H-fluoren-9-yl)methyl (3-fluoro-2-oxopropyl)carbamate
  参考文献：
  名称：

  合成不依赖序列的肽基-氟甲基酮的通用固相方法†

  摘要：

  我们在这里提出了一种新的，通用的，固相策略，用于使用标准的Fmoc肽化学方法合成与序列无关的肽基-氟甲基酮。我们的方法是基于双功能接头的合成，其允许在肽序列的C-末端掺入氨基酸氟甲基酮单元。还描述了该方法在针对SENP的基于活性的探针的合成中的应用。

  DOI：

  10.1039/c2ob25096a

文献信息

• Design, synthesis, and in vitro evaluation of a fluorescently labeled irreversible inhibitor of the catalytic subunit of cAMP-dependent protein kinase (PKACα)
  作者：Robert A. Coover、Nicole M. Luzi、Sudha Korwar、Maria E. Casile、Charles E. Lyons、Darrell L. Peterson、Keith C. Ellis

  DOI：10.1039/c6ob00529b

  日期：——

  we report a complementary approach to developing irreversible kinase inhibitors that utilizes the substrate-binding site. Using the catalytic subunit of cAMP-dependent protein kinase (PKACα) as a model system, we have designed and synthesized an irreversible inhibitor based on the substrate-competitive inhibitor scaffold PKI(14-22) that covalently modifies non-catalytic Cys199 in the PKACα substrate-binding

  不可逆激酶抑制剂的设计和开发是激酶药物发现的一个扩展领域。开发这些抑制剂的当前方法是利用ATP竞争性抑制剂支架在激酶ATP结合位点靶向非催化性半胱氨酸。但是，该方法受到限制，因为并非所有激酶在可被靶向的ATP结合位点均具有半胱氨酸。在这项工作中，我们报告了开发利用底物结合位点的不可逆激酶抑制剂的补充方法。使用cAMP依赖性蛋白激酶（PKACα）的催化亚基作为模型系统，我们基于底物竞争性抑制剂支架PKI（14-22）设计并合成了一种不可逆抑制剂，该抑制剂共价修饰PK​​ACα中的非催化Cys199。底物结合位点。新化合物抑制PKACα（IC50 = 11.8±1.1 nM），是激酶面板中PKACα的约100倍选择性，并通过荧光，质谱和动力学实验证明了该激酶的共价标记。这项研究证明了利用这种新方法开发不可逆抑制剂的可行性，这些抑制剂在其底物结合位点具有相似的非催化半胱氨酸的任何89个激酶。
• Glycine Fluoromethylketones as SENP-Specific Activity Based Probes
  作者：Cristian Dobrotă、Domenico Fasci、Niculina D. Hădade、Gheorghe-Doru Roiban、Cristina Pop、Veronika M. Meier、Ioana Dumitru、Mihaela Matache、Guy S. Salvesen、Daniel P. Funeriu

  DOI：10.1002/cbic.201100645

  日期：2012.1.2

  SUMO1 competition: We report a new activity‐based probe for SENP proteases with a C‐terminal glycine‐derived fluoromethylketone moiety that proved to target selectively the active site of SENPs at low micromolar to high nanomolar concentrations. The probe out‐competes endogenous SUMO1 from the reversible SUMO1–SENP1 complex, thus suggesting that they share a common binding site on SENP1.

  SUMO1 竞争：我们报告了一种新的基于活性的 SENP 蛋白酶探针，其 C 端甘氨酸衍生的氟甲基酮部分被证明可以选择性地靶向低微摩尔至高纳摩尔浓度的 SENP 的活性位点。该探针与可逆 SUMO1-SENP1 复合物中的内源性 SUMO1 竞争，因此表明它们在 SENP1 上共享一个共同的结合位点。