2-(5-溴嘧啶-2-基)乙酸叔丁酯 | 1114830-16-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 中文名称: 2-(5-溴嘧啶-2-基)乙酸叔丁酯
• 英文名称: tert-butyl 2-(5-bromopyrimidin-2-yl)acetate
• CAS: 1114830-16-8
• 化学式: C₁₀H₁₃BrN₂O₂
• 分子量: 273.129
• InChiKey: XSBAGLHOIWJHJW-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.7
• 重原子数：
  15
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  52.1
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-(5-溴嘧啶-2-基)乙酸叔丁酯 在 tris-(dibenzylideneacetone)dipalladium(0) 、 水 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 、 sodium hydroxide 、 zinc dibromide 、 2-二环己基磷-2,4,6-三异丙基联苯 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 26.0h， 生成 2-(2-(2-oxo-2-(pyridin-2-ylamino)ethyl)pyrimidin-5-yl)acetic acid
  参考文献：
  名称：

  延伸核糖核酸酶的合成及其对三链形成肽核酸的RNA结合特性。

  摘要：

  使用三链形成寡核苷酸的Hoogsteen氢键形成三螺旋，代表了一种有吸引力的方法，用于对双链核酸进行序列特异性识别。然而，使用形成三螺旋的寡核苷酸及其类似物的实际应用限于长的高嘌呤序列。识别嘧啶的关键问题是，它们在大沟中仅存在一个氢键受体或供体基团。本文中，我们报告了我们的首次尝试，通过使用经扩展核碱基修饰的肽核酸（PNA）来解决此问题，该核碱基沿Watson-Crick碱基对的整个Hoogsteen边缘形成三个氢键。设计了新的核碱基三元组（五个），并通过从头算来证实了它们的氢键可行性。合成携带修饰的核碱基的PNA单体，并将其掺入短模型PNA序列中。等温滴定量热法显示这些核碱基对其双链RNA（dsRNA）靶标具有适度的结合亲和力。最后，在PNA-dsRNA螺旋中修饰的三元组的分子模型表明适度的结合亲和力是由与理想氢键排列的细微结构偏差或延伸的核碱基支架的π堆积破坏引起的。

  DOI：

  10.1021/acs.joc.9b01133
• 作为产物：
  描述：

  丙二酸叔丁基乙酯 在 水 、 sodium hydride 、 sodium hydroxide 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 mineral oil 为溶剂， 反应 26.58h， 生成 2-(5-溴嘧啶-2-基)乙酸叔丁酯
  参考文献：
  名称：

  延伸核糖核酸酶的合成及其对三链形成肽核酸的RNA结合特性。

  摘要：

  使用三链形成寡核苷酸的Hoogsteen氢键形成三螺旋，代表了一种有吸引力的方法，用于对双链核酸进行序列特异性识别。然而，使用形成三螺旋的寡核苷酸及其类似物的实际应用限于长的高嘌呤序列。识别嘧啶的关键问题是，它们在大沟中仅存在一个氢键受体或供体基团。本文中，我们报告了我们的首次尝试，通过使用经扩展核碱基修饰的肽核酸（PNA）来解决此问题，该核碱基沿Watson-Crick碱基对的整个Hoogsteen边缘形成三个氢键。设计了新的核碱基三元组（五个），并通过从头算来证实了它们的氢键可行性。合成携带修饰的核碱基的PNA单体，并将其掺入短模型PNA序列中。等温滴定量热法显示这些核碱基对其双链RNA（dsRNA）靶标具有适度的结合亲和力。最后，在PNA-dsRNA螺旋中修饰的三元组的分子模型表明适度的结合亲和力是由与理想氢键排列的细微结构偏差或延伸的核碱基支架的π堆积破坏引起的。

  DOI：

  10.1021/acs.joc.9b01133

文献信息

• An efficient large-scale synthesis of alkyl 5-hydroxy-pyridin- and pyrimidin-2-yl acetate
  作者：Rémy Morgentin、Frédéric Jung、Maryannick Lamorlette、Mickaël Maudet、Morgan Ménard、Patrick Plé、Georges Pasquet、Fabrice Renaud

  DOI：10.1016/j.tet.2008.11.064

  日期：2009.1

  of methyl 2-(5-hydroxy-3-methoxypyridin-2-yl)acetate and alkyl 2-(5-hydroxypyrimidin-2-yl)acetate is described. Methodology for an efficient access to 5-hydroxy-pyridin- and pyrimidin-2-yl acetate cores has been developed. Based on the difference in halogen reactivity, 5-bromo-2-chloropyridine and its pyrimidine analogue were functionalized judiciously by SNAr and palladium-catalyzed reactions. The

  描述了2-（5-羟基-3-甲氧基吡啶-2-基）乙酸甲酯和2-（5-羟基嘧啶-2-基）乙酸烷基酯的合成。已经开发出有效获得5-羟基吡啶和乙酸嘧啶-2-基乙酸盐核心的方法。根据卤素反应性的差异，通过S N Ar和钯催化的反应将5-溴-2-氯吡啶及其嘧啶类似物适当地官能化。概述的策略提供了适用于这些化合物大规模合成的高产途径，并为潜在快速获得其他杂环类似物铺平了道路。