N-(8-aminooctyl)-3-[4-[2-[2-(3,3-dimethyl-1-propylindol-1-ium-2-yl)ethenyl]-6-[2-(3,3-dimethyl-1-propylindol-2-ylidene)ethylidene]cyclohexen-1-yl]oxyphenyl]propanamide;iodide | 1262963-08-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: N-(8-aminooctyl)-3-[4-[2-[2-(3,3-dimethyl-1-propylindol-1-ium-2-yl)ethenyl]-6-[2-(3,3-dimethyl-1-propylindol-2-ylidene)ethylidene]cyclohexen-1-yl]oxyphenyl]propanamide;iodide
• CAS: 1262963-08-5
• 化学式: C₅₃H₇₁N₄O₂*I
• 分子量: 923.077
• InChiKey: XJQNTHKARKSICI-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  8.92
• 重原子数：
  60
• 可旋转键数：
  20
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.47
• 拓扑面积：
  70.6
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-(8-aminooctyl)-3-[4-[2-[2-(3,3-dimethyl-1-propylindol-1-ium-2-yl)ethenyl]-6-[2-(3,3-dimethyl-1-propylindol-2-ylidene)ethylidene]cyclohexen-1-yl]oxyphenyl]propanamide;iodide 、 4-[4-(二甲基氨基)苯偶氮]苯甲酸 N-丁二酰亚胺酯 在 吡啶 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以77%的产率得到4-[[4-(dimethylamino)phenyl]diazenyl]-N-[8-[3-[4-[2-[2-(3,3-dimethyl-1-propylindol-1-ium-2-yl)ethenyl]-6-[2-(3,3-dimethyl-1-propylindol-2-ylidene)ethylidene]cyclohexen-1-yl]oxyphenyl]propanoylamino]octyl]benzamide;iodide
  参考文献：
  名称：

  Modulation of intramolecular heterodimer-induced fluorescence quenching of tricarbocyanine dye for the development of fluorescent sensor

  摘要：

  各种方法被用来调节传感器在目标分析物存在时的荧光变化，包括荧光团之间或荧光团与其他分子物种之间的分子内作用力，例如共振能量转移（RET）。在这里，我们重点关注通过分子内异源二聚体复合物形成的荧光淬灭，这种方式的调节距离范围比RET更短。我们合成了几种三氰基钙调素的共轭物，这是一种近红外荧光团，与几种淬灭剂候选物通过灵活的短链结构结合，并检查了它们的荧光性质。在我们合成的化合物中，dabcyl基团通过异源二聚体复合物形成被证明是最佳淬灭剂。在水相介质中，三氰基钙调素–dabcyl共轭物的荧光几乎完全被淬灭，当异源二聚体形成被阻断时，荧光显著增强。这些结果暗示了一种设计方法，以开发用于探测近距离关系和结构转变的荧光传感器。

  DOI：

  10.1039/c0ob00207k
• 作为产物：
  描述：

  tert-butyl N-[8-[3-[4-[2-[2-(3,3-dimethyl-1-propylindol-1-ium-2-yl)ethenyl]-6-[2-(3,3-dimethyl-1-propylindol-2-ylidene)ethylidene]cyclohexen-1-yl]oxyphenyl]propanoylamino]octyl]carbamate;iodide 在 三氟乙酸 作用下， 反应 1.0h， 以100%的产率得到N-(8-aminooctyl)-3-[4-[2-[2-(3,3-dimethyl-1-propylindol-1-ium-2-yl)ethenyl]-6-[2-(3,3-dimethyl-1-propylindol-2-ylidene)ethylidene]cyclohexen-1-yl]oxyphenyl]propanamide;iodide
  参考文献：
  名称：

  Modulation of intramolecular heterodimer-induced fluorescence quenching of tricarbocyanine dye for the development of fluorescent sensor

  摘要：

  各种方法被用来调节传感器在目标分析物存在时的荧光变化，包括荧光团之间或荧光团与其他分子物种之间的分子内作用力，例如共振能量转移（RET）。在这里，我们重点关注通过分子内异源二聚体复合物形成的荧光淬灭，这种方式的调节距离范围比RET更短。我们合成了几种三氰基钙调素的共轭物，这是一种近红外荧光团，与几种淬灭剂候选物通过灵活的短链结构结合，并检查了它们的荧光性质。在我们合成的化合物中，dabcyl基团通过异源二聚体复合物形成被证明是最佳淬灭剂。在水相介质中，三氰基钙调素–dabcyl共轭物的荧光几乎完全被淬灭，当异源二聚体形成被阻断时，荧光显著增强。这些结果暗示了一种设计方法，以开发用于探测近距离关系和结构转变的荧光传感器。

  DOI：

  10.1039/c0ob00207k