Exploring the Influence of the Protein Environment on Metal-Binding Pharmacophores
作者:David P. Martin、Patrick G. Blachly、J. Andrew McCammon、Seth M. Cohen
DOI:10.1021/jm500984b
日期:2014.8.28
stabilized by the formation of a hydrogen bond and favorable hydrophobic contacts. The affinity of MBPs is dependent on a large number of factors including donor atom identity, orientation, electrostatics, and van der Waals interactions. These results suggest that metal coordination by metalloenzyme inhibitors is a malleable interaction and that it is thus more appropriate to consider the metal-binding
一系列与配体 1-羟基吡啶-2-(1 H)-硫酮 (1,2-HOPTO) 在人碳酸酐酶 II (hCAII) 的活性位点中进行了研究。单个甲基取代基的存在和/或位置极大地改变了抑制剂的效力,并可能导致小分子模型复合物中未观察到的配位模式。结果表明,这种意想不到的结合模式是甲基与活性位点中高度有序的水网络之间空间冲突的结果,通过形成氢键和有利的疏水接触进一步稳定了活性位点。MBP 的亲和力取决于大量因素,包括供体原子身份、取向、静电和范德华相互作用。这些结果表明金属酶抑制剂的金属配位是一种可延展的相互作用,因此将这些抑制剂的金属结合基序视为药效团而不是“螯合剂”更合适。对金属酶抑制剂的合理设计将极大地受益于对控制 MBP 与活性位点金属离子结合的各种力之间相互作用的更深入理解。