1-[2-(benzyloxycarbonyl)amino-2-deoxy-β-D-ribofuranosyl]uracil | 182626-48-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 1-[2-(benzyloxycarbonyl)amino-2-deoxy-β-D-ribofuranosyl]uracil
• 英文别名: benzyl N-[(2R,3R,4S,5R)-2-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl]carbamate
• CAS: 182626-48-8
• 化学式: C₁₇H₁₉N₃O₇
• 分子量: 377.354
• InChiKey: SDRWVINFZRXIFF-NMFUWQPSSA-N

物化性质

• 密度：
  1.52±0.1 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.1
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.35
• 拓扑面积：
  137
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-[2-(benzyloxycarbonyl)amino-2-deoxy-β-D-ribofuranosyl]uracil 在 palladium on activated charcoal 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 ammonium hydroxide 、 三氟甲磺酸三甲基硅酯 、 氢气 、 牛血清白蛋白 、 三乙胺 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 、 1,2-二氯乙烷 为溶剂， 反应 46.0h， 生成 9-[2-deoxy-2-methoxalylamino-5-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3-(2-cyanoethoxy-N,N-diisopropylaminophosphino)-β-D-ribofuranosyl]-N⁶-benzoyladenine
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of f luorescein-labeled oligonucleotides bearing a tag in position 2′ of modified adenosine and arabinoadenosine

  摘要：

  含有荧光素残基的寡核苷酸缀合物通过标准固相磷酰胺法合成，使用9-[2-脱氧-5-O-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)-2-甲氧羰基氨基-β-D-核糖呋喃糖基]-和9-[2-脱氧-5-O-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)-2-甲氧羰基氨基-β-D-阿拉伯糖呋喃糖基]-N6-苯甲酰腺苷的磷酰胺。估计了使用修饰磷酰胺的寡核苷酸合成的相对效率。

  DOI：

  10.1007/s11172-006-0473-y
• 作为产物：
  描述：

  氯甲酸苄酯 、 2’-氨基-D-尿苷 在 碳酸氢钠 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 1.0h， 以52%的产率得到1-[2-(benzyloxycarbonyl)amino-2-deoxy-β-D-ribofuranosyl]uracil
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of f luorescein-labeled oligonucleotides bearing a tag in position 2′ of modified adenosine and arabinoadenosine

  摘要：

  含有荧光素残基的寡核苷酸缀合物通过标准固相磷酰胺法合成，使用9-[2-脱氧-5-O-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)-2-甲氧羰基氨基-β-D-核糖呋喃糖基]-和9-[2-脱氧-5-O-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)-2-甲氧羰基氨基-β-D-阿拉伯糖呋喃糖基]-N6-苯甲酰腺苷的磷酰胺。估计了使用修饰磷酰胺的寡核苷酸合成的相对效率。

  DOI：

  10.1007/s11172-006-0473-y