[4-[8,16-dimethoxy-7,17-bis[[(2S)-4-methyl-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]pentanoyl]oxy]-3-oxo-4-oxa-1-azapentacyclo[11.8.0.02,11.05,10.014,19]henicosa-2(11),5,7,9,12,14,16,18,20-nonaen-12-yl]-2-methoxyphenyl] (2S)-4-methyl-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]pentanoate | 660397-06-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: [4-[8,16-dimethoxy-7,17-bis[[(2S)-4-methyl-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]pentanoyl]oxy]-3-oxo-4-oxa-1-azapentacyclo[11.8.0.02,11.05,10.014,19]henicosa-2(11),5,7,9,12,14,16,18,20-nonaen-12-yl]-2-methoxyphenyl] (2S)-4-methyl-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]pentanoate
• CAS: 660397-06-8
• 化学式: C₆₁H₇₈N₄O₁₇
• 分子量: 1139.31
• InChiKey: XSMCALNYTZWFRL-MXVPUGLGSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  13.4
• 重原子数：
  82
• 可旋转键数：
  28
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.49
• 拓扑面积：
  252
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  17

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  [4-[8,16-dimethoxy-7,17-bis[[(2S)-4-methyl-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]pentanoyl]oxy]-3-oxo-4-oxa-1-azapentacyclo[11.8.0.02,11.05,10.014,19]henicosa-2(11),5,7,9,12,14,16,18,20-nonaen-12-yl]-2-methoxyphenyl] (2S)-4-methyl-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]pentanoate 在 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 5.0h， 生成 [4-[7,17-bis[[(2S)-2-amino-4-methylpentanoyl]oxy]-8,16-dimethoxy-3-oxo-4-oxa-1-azapentacyclo[11.8.0.02,11.05,10.014,19]henicosa-2(11),5,7,9,12,14,16,18,20-nonaen-12-yl]-2-methoxyphenyl] (2S)-2-amino-4-methylpentanoate
  参考文献：
  名称：

  拓扑异构酶I介导的DNA切割可作为开发源自海洋生物碱lamellarin D：掺入氨基酸残基的三酯衍生物的抗肿瘤剂的指南。

  摘要：

  近来海洋生物碱lamellarin D（LAM-D）被定性为人类拓扑异构酶I的强力毒物，赋予其对肿瘤细胞的显着细胞毒活性。我们在这里报告LAM-D系列中的第一个结构-活性关系研究。两组三酯化合物，它们在6H- [1]苯并吡喃并[4'，3'：4,5]吡咯并[2,1-a]异喹啉-6-测试了一种典型的母体生物碱的五环平面生色团作为拓扑异构酶I抑制剂。A组中的非氨基化合物对拓扑异构酶I没有活性，并且基本上无细胞毒性。与之形成鲜明对比的是，B组中掺有氨基酸残基的化合物强烈促进了人类拓扑异构酶I对DNA的切割。亮氨酸三取代的LAM-D衍生物，缬氨酸，脯氨酸，苯丙氨酸或丙氨酸残基或相关的氨基侧链可稳定拓扑异构酶I-DNA复合物。用这些分子在T向下箭头G或C向下箭头G二核苷酸处检测到的DNA切割位点与LAM-D相同，但与喜树碱仅在T向下箭头G刺激拓扑异构酶I介导的切割的DNA切割位点略有不同。在DNA弛豫

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2004.01.020
• 作为产物：
  描述：

  [4-[8,16-dimethoxy-7,17-bis[[(2S)-4-methyl-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]pentanoyl]oxy]-3-oxo-4-oxa-1-azapentacyclo[11.8.0.02,11.05,10.014,19]henicosa-2(11),5,7,9,12,14,16,18-octaen-12-yl]-2-methoxyphenyl] (2S)-4-methyl-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]pentanoate 在 2,3-二氯-5,6-二氰基-1,4-苯醌 作用下， 以 氯仿 为溶剂， 反应 35.0h， 以73%的产率得到[4-[8,16-dimethoxy-7,17-bis[[(2S)-4-methyl-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]pentanoyl]oxy]-3-oxo-4-oxa-1-azapentacyclo[11.8.0.02,11.05,10.014,19]henicosa-2(11),5,7,9,12,14,16,18,20-nonaen-12-yl]-2-methoxyphenyl] (2S)-4-methyl-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]pentanoate
  参考文献：
  名称：

  拓扑异构酶I介导的DNA切割可作为开发源自海洋生物碱lamellarin D：掺入氨基酸残基的三酯衍生物的抗肿瘤剂的指南。

  摘要：

  近来海洋生物碱lamellarin D（LAM-D）被定性为人类拓扑异构酶I的强力毒物，赋予其对肿瘤细胞的显着细胞毒活性。我们在这里报告LAM-D系列中的第一个结构-活性关系研究。两组三酯化合物，它们在6H- [1]苯并吡喃并[4'，3'：4,5]吡咯并[2,1-a]异喹啉-6-测试了一种典型的母体生物碱的五环平面生色团作为拓扑异构酶I抑制剂。A组中的非氨基化合物对拓扑异构酶I没有活性，并且基本上无细胞毒性。与之形成鲜明对比的是，B组中掺有氨基酸残基的化合物强烈促进了人类拓扑异构酶I对DNA的切割。亮氨酸三取代的LAM-D衍生物，缬氨酸，脯氨酸，苯丙氨酸或丙氨酸残基或相关的氨基侧链可稳定拓扑异构酶I-DNA复合物。用这些分子在T向下箭头G或C向下箭头G二核苷酸处检测到的DNA切割位点与LAM-D相同，但与喜树碱仅在T向下箭头G刺激拓扑异构酶I介导的切割的DNA切割位点略有不同。在DNA弛豫

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2004.01.020

文献信息

• [EN] ANTITUMORAL ANALOGS OF LAMELLARINS<br/>[FR] ANALOGUES ANTITUMORAUX DE LAMELLARINES
  申请人：PHARMA MAR SAU

  公开号：WO2004014917A3

  公开（公告）日：2004-05-13
• Topoisomerase I-mediated DNA cleavage as a guide to the development of antitumor agents derived from the marine alkaloid lamellarin D: triester derivatives incorporating amino acid residues
  作者：Christelle Tardy、Michaël Facompré、William Laine、Brigitte Baldeyrou、Dolores Garcı́a-Gravalos、Andrés Francesch、Cristina Mateo、Alfredo Pastor、José A Jiménez、Ignacio Manzanares、Carmen Cuevas、Christian Bailly

  DOI：10.1016/j.bmc.2004.01.020

  日期：2004.4

  pentacyclic planar chromophore typical of the parent alkaloid were tested as topoisomerase I inhibitors. The non-amino compounds in group A showed no activity against topoisomerase I and were essentially non cytotoxic. In sharp contrast, compounds in group B incorporating amino acid residues strongly promoted DNA cleavage by human topoisomerase I. LAM-D derivatives tri-substituted with leucine, valine, proline

  近来海洋生物碱lamellarin D（LAM-D）被定性为人类拓扑异构酶I的强力毒物，赋予其对肿瘤细胞的显着细胞毒活性。我们在这里报告LAM-D系列中的第一个结构-活性关系研究。两组三酯化合物，它们在6H- [1]苯并吡喃并[4'，3'：4,5]吡咯并[2,1-a]异喹啉-6-测试了一种典型的母体生物碱的五环平面生色团作为拓扑异构酶I抑制剂。A组中的非氨基化合物对拓扑异构酶I没有活性，并且基本上无细胞毒性。与之形成鲜明对比的是，B组中掺有氨基酸残基的化合物强烈促进了人类拓扑异构酶I对DNA的切割。亮氨酸三取代的LAM-D衍生物，缬氨酸，脯氨酸，苯丙氨酸或丙氨酸残基或相关的氨基侧链可稳定拓扑异构酶I-DNA复合物。用这些分子在T向下箭头G或C向下箭头G二核苷酸处检测到的DNA切割位点与LAM-D相同，但与喜树碱仅在T向下箭头G刺激拓扑异构酶I介导的切割的DNA切割位点略有不同。在DNA弛豫