N-bromoacetyldistamycin | 104855-35-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N-bromoacetyldistamycin
• CAS: 104855-35-8
• 化学式: C₂₅H₃₃BrN₈O₄
• 分子量: 589.492
• InChiKey: PDNNZROKLMOSHA-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.22
• 重原子数：
  38.0
• 可旋转键数：
  11.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  134.43
• 氢给体数：
  4.0
• 氢受体数：
  8.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  <3-15N>adenine 、 N-bromoacetyldistamycin 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 3-(acetyldistamycin)<3-(15)N>adenine
  参考文献：
  名称：

  N-溴乙酰基二霉素对 DNA 的序列特异性切割。产品和动力学分析

  摘要：

  N-溴乙酰双霉素 (BO) 是一种设计好的分子，具有两个具有不同功能的结构域：与双螺旋 DNA 的序列特异性结合和 DNA 主链的切割。亲电溴乙酰基团附加到来自天然产物多他霉素 A 的三肽的氨基末端。 足迹研究表明，N-溴乙酰双霉素在几分钟内与 167 个碱基对 (bp) 限制性片段结合，位于四个富含 A、T 的位点 5 个碱基对尺寸为 5'-TTTAA、GTTTA、AAATT 和 GAAAT-3'。在 37 °C 下反应 5 小时后，该 167 bp 限制性片段中 GTTTA 位点的单个腺嘌呤处发生切割，并遵循哌啶处理程序。BD 的共价连接发生在腺嘌呤的 N3。3-（乙酰基二霉素）腺嘌呤是 BD 与 15 碱基对寡核苷酸双链体 5'-CGGTAGTTTATCACA-3' 在 37 °C 下反应释放的产物。哌啶处理后切割位点的 3' 和 5' DNA 末端是磷酸基团。BD 对双链 DNA

  DOI：

  10.1021/ja00189a054
• 作为产物：
  描述：

  nitrolexitropsin 在 palladium on activated charcoal 氢气 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 12.08h， 生成 N-bromoacetyldistamycin
  参考文献：
  名称：

  N-溴乙酰基二霉素对 DNA 的序列特异性切割。产品和动力学分析

  摘要：

  N-溴乙酰双霉素 (BO) 是一种设计好的分子，具有两个具有不同功能的结构域：与双螺旋 DNA 的序列特异性结合和 DNA 主链的切割。亲电溴乙酰基团附加到来自天然产物多他霉素 A 的三肽的氨基末端。 足迹研究表明，N-溴乙酰双霉素在几分钟内与 167 个碱基对 (bp) 限制性片段结合，位于四个富含 A、T 的位点 5 个碱基对尺寸为 5'-TTTAA、GTTTA、AAATT 和 GAAAT-3'。在 37 °C 下反应 5 小时后，该 167 bp 限制性片段中 GTTTA 位点的单个腺嘌呤处发生切割，并遵循哌啶处理程序。BD 的共价连接发生在腺嘌呤的 N3。3-（乙酰基二霉素）腺嘌呤是 BD 与 15 碱基对寡核苷酸双链体 5'-CGGTAGTTTATCACA-3' 在 37 °C 下反应释放的产物。哌啶处理后切割位点的 3' 和 5' DNA 末端是磷酸基团。BD 对双链 DNA

  DOI：

  10.1021/ja00189a054