Structure based medicinal chemistry approach to develop 4-methyl-7-deazaadenine carbocyclic nucleosides as anti-HCV agent
作者:Anandarajan Thiyagarajan、Mohammed T.A. Salim、Tuniki Balaraju、Chandralata Bal、Masanori Baba、Ashoke Sharon
DOI:10.1016/j.bmcl.2012.09.072
日期:2012.12
The structure-based approaches were implemented to design and rationally select the molecules for synthesis and anti-HCV activity evaluation. The systematic structure–activity relationships of previously discovered molecules (types I, II, III) were analyzed to design new molecules (type IV) by bioisosteric replacement of the amino group. The ligand conformation, binding mode studies and drug like properties
实施了基于结构的方法来设计和合理选择用于合成和抗HCV活性评估的分子。通过对氨基的生物等位取代,分析了先前发现的分子(I,II,III型)的系统结构与活性之间的关系,从而设计出了新的分子(IV型)。配体构象,结合模式研究和类药物性质是选择最终合成分子的主要决定因素。通过分叉的弱氢键(C–H…O),用甲基取代氨基恢复了与RNA模板(Tem 799)的相互作用。从分子建模研究中观察到,这是一个有趣的发现。发现6c –e具有抗HCV活性(37-46μM中的EC 50),而6a,6b和6g无活性。化合物6f(EC 50 28μM)是该系列中活性最高的化合物,但它也显示出一定的细胞毒性(CC 50 52.8μM)。除6f外,没有发现任何化合物具有细胞毒性(CC 50 > 100μM)。本研究公开了基于结构的方法用于新颖的抗HCV铅发现,并为铅优化开辟了未来的范围。