Skyllamycin是来自链霉菌属的非
核糖体合成的环状双缩肽。抑制PDGF信号的Acta 2897。肽支架包含一个N末端的肉桂酰基部分,一个
天冬氨酸的β-甲基化,三个β-羟基化
氨基酸和一个罕见的α-羟基甘
氨酸。除α-羟基甘
氨酸外,通过手性GC-MS和Marfey-HPLC分析将
氨基酸的立体
化学与合成参考
氨基酸进行比较。在碱性和酸性条件下不稳定的α-羟基甘
氨酸的立体
化学是通过构象分析,结合NOESY-NMR光谱,模拟退火和自由MD模拟的数据确定的。模拟程序适用于R-和Skyllamycin结构的S-构型α-羟基甘
氨酸,并与NOESY数据进行比较。两种方法(模拟退火和自由MD模拟)均独立支持S配置的α-羟基甘
氨酸,从而实现了Skyllamycin结构中所有立体中心的分配,并将两组分黄素依赖性单加氧酶(Sky39)发挥了S选择性的作用。