2-(5-carbamoyl-2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-1-yl)acetic acid | 98279-95-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: 2-(5-carbamoyl-2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-1-yl)acetic acid
• 英文别名: 2-(5-carbamoyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)acetic acid
• CAS: 98279-95-9
• 化学式: C₇H₇N₃O₅
• mdl: MFCD10686907
• 分子量: 213.15
• InChiKey: XOCUBEHFERLZFJ-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.6
• 重原子数：
  15
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.142
• 拓扑面积：
  130
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-(5-carbamoyl-2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-1-yl)acetic acid 、 Boc-Dap(NH₂)-CONH₂ 在 N-羟基丁二酰亚胺 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 16.5h， 以28%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  用于发现 NAD+ 依赖性酶抑制剂的集中 DNA 编码化学文库

  摘要：

  DNA 编码的化学文库越来越多地用于药物研究，因为它们能够快速发现合成蛋白质配体。在这里，我们探讨了以目标类别为重点的 DNA 编码化学文库是否可以成为实现一系列蛋白质稳健筛选效率的经济高效的工具。该研究表明，为 NAD+ 结合口袋 (NADEL) 设计的 DNA 编码文库有效地对具有 ADP-核糖基转移酶活性的酶的化学结合空间进行采样。提取的信息指导合成多种酶的抑制剂，包括 PARP15 和 SIRT6。不同蛋白质的 NADEL 筛选指纹的高度相似性转化为抑制剂，对其靶标显示出选择性。

  DOI：

  10.1021/jacs.8b08039
• 作为产物：
  描述：

  2-[5-氰基-2,4-二氧代-3,4-二氢-(2H-)嘧啶-1-基]乙酸 在 sodium hydroxide 作用下， 生成 2-(5-carbamoyl-2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-1-yl)acetic acid
  参考文献：
  名称：

  Atkinson et al., Journal of the Chemical Society, 1956, p. 4118,4120

  摘要：

  DOI：

文献信息

• A Focused DNA-Encoded Chemical Library for the Discovery of Inhibitors of NAD⁺-Dependent Enzymes
  作者：Lik Hang Yuen、Srikanta Dana、Yu Liu、Samuel I. Bloom、Ann-Gerd Thorsell、Dario Neri、Anthony J. Donato、Dmitri Kireev、Herwig Schüler、Raphael M. Franzini

  DOI：10.1021/jacs.8b08039

  日期：2019.4.3

  synthesis of inhibitors for several enzymes including PARP15 and SIRT6. The high dissimilarity of NADEL screening fingerprints for different proteins translated into inhibitors that showed selectivity for their target. The discovery of patterns of enriched structures for six out of eight tested proteins is remarkable for a library of 58 302 DNA-tagged structures and illustrates the prospect of focused DNA-encoded

  DNA 编码的化学文库越来越多地用于药物研究，因为它们能够快速发现合成蛋白质配体。在这里，我们探讨了以目标类别为重点的 DNA 编码化学文库是否可以成为实现一系列蛋白质稳健筛选效率的经济高效的工具。该研究表明，为 NAD+ 结合口袋 (NADEL) 设计的 DNA 编码文库有效地对具有 ADP-核糖基转移酶活性的酶的化学结合空间进行采样。提取的信息指导合成多种酶的抑制剂，包括 PARP15 和 SIRT6。不同蛋白质的 NADEL 筛选指纹的高度相似性转化为抑制剂，对其靶标显示出选择性。
• Atkinson et al., Journal of the Chemical Society, 1956, p. 4118,4120
  作者：Atkinson et al.

  DOI：——

  日期：——
• Correction to “A Focused DNA-Encoded Chemical Library for the Discovery of Inhibitors of NAD⁺-Dependent Enzymes”
  作者：Lik Hang Yuen、Srikanta Dana、Yu Liu、Samuel I. Bloom、Ann-Gerd Thorsell、Dario Neri、Anthony J. Donato、Dmitri Kireev、Herwig Schüler、Raphael M. Franzini

  DOI：10.1021/jacs.1c06352

  日期：2021.7.28

  investigate this issue, we recorded a series of NMR spectra with A11 purchased from Fluorochem (catalog no. 313748, lot 2; Figures S19–S23 in the updated Supporting Information). The 1H NMR spectrum of A11 was the same as that obtained for the reference compound A108 (enamine, catalog no. EN300-23945; Figure S24 in the Supporting Information). In the HMBC spectra (Figure S23 in the Supporting Information)

  在我们的 DNA 编码化学库中出现的先导结构的合成和评估过程中，我们注意到含有构建块 2-(2,4-dioxotetrahydropyrimidin-1(2 H )-yl)benzoic acid（在手稿中缩写为 A11）的化合物) 显示出与含有结构单元 3-(2,4-dioxo-1,2,3,4-四氢喹唑啉-1-基)丙酸（手稿中缩写为 A108；结构如图 1 所示）的化合物相同的 NMR 谱. 为了研究这个问题，我们使用从 Fluorochem 购买的 A11 记录了一系列 NMR 光谱（目录号 313748，批次 2；更新的支持信息中的图 S19-S23）。在1A11 的 H NMR 光谱与参考化合物 A108 获得的相同（烯胺，目录号 EN300-23945；支持信息中的图 S24）。在 HMBC 光谱中（支持信息中的图 S23），羧酸基团的碳没有显示出与芳香族 C-H 质子的偶联，表明该化合物是