融合的非肽抑制仍然是抗 HIV 研究的一个重要目标,因为它具有低成本预防或预防病毒细胞间传播的潜力。我们在此报告了一系列已通过基于结构的药物设计方法鉴定为 gp41 融合
抑制剂的
吲哚化合物。化合物对疏
水袋的实验结合亲和力与融合抑制数据密切相关 ( R 2= 0.91),相应的病毒复制抑制证实了疏
水袋是低分子量融合
抑制剂的有效靶点。最活跃的化合物与疏
水袋结合,并以亚微摩尔
水平抑制细胞 - 细胞融合和病毒复制。通过使用蛋白质数据库中的 gp41 结构进行对接研究,建立了该系列
抑制剂的常见结合模式。分子足够灵活以符合口袋的轮廓,最活跃的化合物能够采用模拟 D 肽
PIE7 疏
水接触的结构。结果增强了我们对
吲哚化合物作为 gp41
抑制剂的理解。