Avidin and streptavidin ligands based on the glycoluril bicyclic system
摘要:
我们合成了带有羧酸侧链的甘氨酰脲衍生物,并证明它们能与阿维蛋白和链霉亲和素结合。只有当戊酸基团与 N 原子结合并具有适当的立体化学结构[(+)-对映体]时,在甘氨酰脲中引入戊酸侧链才会增加与这两种蛋白质的结合力。另一方面,与未取代的甘草利相比,在桥头碳或具有相反立体化学结构的 N 原子上引入戊酸侧链[(-)-对映体]会导致结合常数下降。将每种蛋白质与外消旋配体进行直接分光光度竞争滴定,可以测量配体与蛋白质复配的对映体选择性以及两种对映体的结合常数。就 N-取代的甘氨酰脲而言,侧链延伸一个亚甲基(从戊酸酯到己酸酯)后,与两种蛋白质的结合常数都增加了。为了预测这些配体与链霉亲和素的结合模式,我们使用 AutoDock 3.05 进行了对接研究。根据预测的结合模式,讨论了立体化学和侧链位置对链霉亲和素结合常数的影响。
Avidin and streptavidin ligands based on the glycoluril bicyclic system
摘要:
我们合成了带有羧酸侧链的甘氨酰脲衍生物,并证明它们能与阿维蛋白和链霉亲和素结合。只有当戊酸基团与 N 原子结合并具有适当的立体化学结构[(+)-对映体]时,在甘氨酰脲中引入戊酸侧链才会增加与这两种蛋白质的结合力。另一方面,与未取代的甘草利相比,在桥头碳或具有相反立体化学结构的 N 原子上引入戊酸侧链[(-)-对映体]会导致结合常数下降。将每种蛋白质与外消旋配体进行直接分光光度竞争滴定,可以测量配体与蛋白质复配的对映体选择性以及两种对映体的结合常数。就 N-取代的甘氨酰脲而言,侧链延伸一个亚甲基(从戊酸酯到己酸酯)后,与两种蛋白质的结合常数都增加了。为了预测这些配体与链霉亲和素的结合模式,我们使用 AutoDock 3.05 进行了对接研究。根据预测的结合模式,讨论了立体化学和侧链位置对链霉亲和素结合常数的影响。