trans-3-cyanovinylcarbazole | 1157899-63-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: trans-3-cyanovinylcarbazole
• 英文别名: 3-cyanovinylcarbazole；(E)-3-(9H-Carbazol-3-yl)acrylonitrile；(E)-3-(9H-carbazol-3-yl)prop-2-enenitrile
• CAS: 1157899-63-2
• 化学式: C₁₅H₁₀N₂
• 分子量: 218.258
• InChiKey: HDAVJPSXEPLOMF-ONEGZZNKSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.9
• 重原子数：
  17
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.0
• 拓扑面积：
  39.6
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  1

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-deoxy-3,5-di-O-(p-toluoyl)-α-D-erythropentofuranosyl chloride 、 trans-3-cyanovinylcarbazole 在 三(3,6-二氧杂庚基)胺 、 potassium hydroxide 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 0.66h， 以33%的产率得到3-cyanovinylcarbazole-1'-β-deoxyriboside-3',5'-di-(p-toluoyl) ester
  参考文献：
  名称：

  SEQUENCE-SPECIFIC NUCLEIC ACID PURIFICATION METHOD MANNER

  摘要：

  揭示了一种用于纯化和收集包含特定核苷酸序列的核酸的方法，可以在极短的时间内进行，并且可以同时实现高度的序列特异性和高收集率。具体揭示了一种用于纯化包含特定核苷酸序列的目标核酸并存在于核酸混合物中的方法。该方法包括以下步骤：将具有由式(I)表示的基团作为碱基部分的光连接核酸与目标核酸杂交以形成杂交体；用光照射光连接核酸和目标核酸的杂交体以引起杂交体的光连接；通过洗涤去除任何未经光连接的核酸；并用光照射光连接核酸和目标核酸的杂交体以引起杂交体的光解。

  公开号：

  US20110034683A1
• 作为产物：
  描述：

  3-碘咔唑 、 丙烯腈 在 palladium diacetate 、 三苯基膦 三乙胺 作用下， 以 1,4-二氧六环 为溶剂， 反应 11.5h， 以18%的产率得到trans-3-cyanovinylcarbazole
  参考文献：
  名称：

  SEQUENCE-SPECIFIC NUCLEIC ACID PURIFICATION METHOD MANNER

  摘要：

  揭示了一种用于纯化和收集包含特定核苷酸序列的核酸的方法，可以在极短的时间内进行，并且可以同时实现高度的序列特异性和高收集率。具体揭示了一种用于纯化包含特定核苷酸序列的目标核酸并存在于核酸混合物中的方法。该方法包括以下步骤：将具有由式(I)表示的基团作为碱基部分的光连接核酸与目标核酸杂交以形成杂交体；用光照射光连接核酸和目标核酸的杂交体以引起杂交体的光连接；通过洗涤去除任何未经光连接的核酸；并用光照射光连接核酸和目标核酸的杂交体以引起杂交体的光解。

  公开号：

  US20110034683A1

文献信息

• METHOD OF SUPPRESSING FORMATION OF PHOTOCROSSLINK, AND PHOTOREACTIVE NUCLEIC ACID IN WHICH AUTO-CROSSLINK FORMATION IS SUPPRESSED
  申请人：JAPAN SCIENCE AND TECHNOLOGY AGENCY

  公开号：US20160326207A1

  公开（公告）日：2016-11-10

  Provided is a means for preventing the inactivation of a photoresponsive nucleic acid probe by suppressing the formation of a photocrosslink between a photoresponsive base having a photocrosslinkable vinyl structure and a photocrosslinkable thymine (T) or uracil (U) base, by substituting with an R group (R being —CN or —CO—R 1 , where R 1 is a saturated or unsaturated straight-chain or branched cyclic or non-cyclic C1-12 hydrocarbon group) the 5 position of a pyrimidine ring of the thymine (T) or uracil (U) base which is photocrosslinkable with the photoresponsive base having a photocrosslinkable vinyl structure.

  提供了一种防止光响应核酸探针失活的方法，通过在可光交联的含有可光交联乙烯结构的光响应碱基和可光交联胸腺嘧啶（T）或尿嘧啶（U）碱基之间抑制光交联物的形成，通过用R基（R为—CN或—CO—R1，其中R1为饱和或不饱和直链或支链环状或非环状C1-12碳氢化合物基团）替代胸腺嘧啶（T）或尿嘧啶（U）碱基的嘧啶环的5位。
• METHOD OF DETECTING TARGET NUCLEIC ACID
  申请人：Toray Industries, Inc.

  公开号：US20150240296A1

  公开（公告）日：2015-08-27

  A method of detecting a target nucleic acid by sandwich hybridization using a detection probe that hybridizes with the target nucleic acid, and a capture probe immobilized on a support wherein at least one nucleic acid base in the nucleic acid molecule(s) of the detection probe and/or capture probe with a photoreactive group includes irradiating, with light, a complex formed by hybridization between the target nucleic acid and the detection probe and/or capture probe to allow formation of a covalent bond(s) between the photoreactive group(s) and a nucleic acid base(s) in the target nucleic acid.

  一种通过夹心杂交检测目标核酸的方法，使用与目标核酸杂交的检测探针和固定在支撑物上的捕获探针，其中检测探针和/或捕获探针的核酸分子中至少有一个含有光反应基团的核酸碱基，包括照射形成的复合物，即目标核酸和检测探针和/或捕获探针之间的杂交物，以允许光反应基团和目标核酸中的核酸碱基之间形成共价键。
• NUCLEIC ACID LINKER
  申请人：The University of Tokyo

  公开号：US20160076022A1

  公开（公告）日：2016-03-17

  The present invention relates to a nucleic acid linker for producing a complex of mRNA, and a protein or a peptide which is encoded by the mRNA, the linker comprising: a spacer portion at the 5′-terminal; a polynucleotide portion hybridizable with at least a part of a sequence of the mRNA; and an arm portion which has a connection portion for the protein or the peptide at the 3′-terminal, in which the spacer portion, the polynucleotide portion, and the arm portion form a single strand, and in which the polynucleotide portion contains a photoreactive base derivative.

  本发明涉及一种用于产生mRNA和编码该mRNA的蛋白质或肽复合物的核酸连接体，该连接体包括：5'-端的间隔部分；与mRNA序列的至少一部分可以杂交的多核苷酸部分；以及具有连接蛋白质或肽的连接部分的臂部，其中间隔部分、多核苷酸部分和臂部形成单链，且多核苷酸部分包含光反应性碱基衍生物。
• METHOD FOR DETECTING TARGET NUCLEIC ACID MOLECULE
  申请人：Olympus Corporation

  公开号：EP2829614A1

  公开（公告）日：2015-01-28

  A method for detecting a target nucleic acid comprising: forming a three-component association product by allowing the association of at least a nucleic acid molecule, a first nucleic acid probe having a first marker bound thereto, and a second nucleic acid probe having a second marker bound thereto; forming at least one covalent bond between the target nucleic acid molecule and the first nucleic acid probe and between the target nucleic acid molecule and the second nucleic acid probe; and binding the three-component association product to a solid phase carrier through the second marker; recovering the three-component association product bound to the solid phase carrier; releasing the first marker from the recovered three-component association product; and detecting the target nucleic acid molecule by detecting the free first marker.

  一种检测目标核酸的方法，包括通过允许至少一个核酸分子、第一核酸探针（其上结合有第一标记）和第二核酸探针（其上结合有第二标记）的结合，形成三组分结合产物； 在目标核酸分子和第一核酸探针之间以及目标核酸分子和第二核酸探针之间形成至少一个共价键；通过第二标记将三组分结合产物结合到固相载体上；回收结合到固相载体上的三组分结合产物；从回收的三组分结合产物中释放第一标记；以及通过检测游离的第一标记检测目标核酸分子。
• PHOTOCOUPLING METHOD USING PROBE CONTAINING PHOTORESPONSIVE NUCLEIC ACIDS
  申请人：LSI Medience Corporation

  公开号：EP2878671A1

  公开（公告）日：2015-06-03

  Provided are: a photocoupling method that overcomes the problem of the stagnation of photocoupling with a target nucleotide using a probe containing a photo-responsive nucleotide, and that improves the photocoupling efficiency; and a photocoupling kit. The photocoupling method is characterized by hybridizing a target site present in a nucleic acid sample with a first probe having a sequence complementary to the target site and containing a photo-responsive nucleotide, in a reaction solution, and carrying out photocoupling by photo-irradiation, wherein self-assembly caused by the photo-responsive nucleotide contained in the first probe is suppressed. The photocoupling kit is characterized by comprising a first probe having a sequence complementary to a target site present in a nucleic acid sample, and containing a photo-responsive nucleotide; and a second probe being highly complementary to the first probe.

  本发明提供了：一种光耦合方法，该方法克服了使用含有光反应核苷酸的探针与目标核苷酸光耦合停滞的问题，并提高了光耦合效率；以及一种光耦合试剂盒。 光耦合方法的特征是在反应溶液中将核酸样品中存在的目标位点与具有与目标位点互补的序列并含有光反应核苷酸的第一探针杂交，并通过光照射进行光耦合，其中第一探针中所含的光反应核苷酸引起的自组装被抑制。光耦合试剂盒的特点是包括第一探针，其序列与核酸样品中的靶位点互补，并含有光反应核苷酸；以及与第一探针高度互补的第二探针。