(9H-fluoren-9-yl)methyl (R)-(1-((2-amino-5-nitrophenyl)amino)-3-phenyl-1-thioxopropan-2-yl)carbamate | 385438-93-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 英文名称: (9H-fluoren-9-yl)methyl (R)-(1-((2-amino-5-nitrophenyl)amino)-3-phenyl-1-thioxopropan-2-yl)carbamate
• 英文别名: (9H-fluoren-9-yl)methyl(R)-(1-((2-amino-5-nitrophenyl)amino)-3-phenyl-1-thioxopropan-2-yl)carbamate；N-Fmoc-D-phenylalanine 2-amino-5-nitrothioanilide；9H-fluoren-9-ylmethyl N-[(2R)-1-(2-amino-5-nitroanilino)-3-phenyl-1-sulfanylidenepropan-2-yl]carbamate
• CAS: 385438-93-7
• 化学式: C₃₀H₂₆N₄O₄S
• 分子量: 538.627
• InChiKey: DMPYYMCLIIFFEN-MUUNZHRXSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.7
• 重原子数：
  39
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.13
• 拓扑面积：
  154
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (9H-fluoren-9-yl)methyl (R)-(1-((2-amino-5-nitrophenyl)amino)-3-phenyl-1-thioxopropan-2-yl)carbamate 生成 1,1-dimethylprop-2-ynyl 2,2,2-trichloroacetimidate
  参考文献：
  名称：

  躯干酰胺A（1）的固相全合成。

  摘要：

  海洋生物是新型生物活性化合物的丰富来源。在此，提出了目前在临床前试验中的trunkamide A的固相全合成。Trunkamide A包含噻唑啉杂环和两个Ser和Thr残基，其羟基官能团被修饰为反向异戊烯基（rPr）。合成的基础如下：（i）在氯三苯甲基树脂上使用具有叔丁基和芴基的准正交保护方案进行固相肽链延伸；（ii）基于HOAt的偶联剂的混合物；（iii）溶液中的环化。此外，讨论了以下合成步骤：（i）Ser和Thr的反向异戊二烯基衍生物的制备；（ii）引入噻唑啉前体作为受保护的氨基硫代酸衍生物；（iii）用DAST形成噻唑啉环。所有这些特征使该策略特别适合于躯干酰胺A和其他包含相同基序的肽的大规模合成。

  DOI：

  10.1021/jo015703t
• 作为产物：
  描述：

  Fmoc-D-苯丙氨酸 在 N-甲基吗啉 、 tetraphosphorus decasulfide 、 sodium carbonate 、 氯甲酸异丁酯 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 3.75h， 生成 (9H-fluoren-9-yl)methyl (R)-(1-((2-amino-5-nitrophenyl)amino)-3-phenyl-1-thioxopropan-2-yl)carbamate
  参考文献：
  名称：

  蒂姆化学期刊获奖者——他们现在在哪里？用于合成含硫代酰胺的肽和蛋白质的改进的 Fmoc 脱保护方法

  摘要：

  硫代酰胺在肽和蛋白质中的位点选择性掺入为广泛的应用提供了有用的工具。目前的掺入方法存在产率低以及差向异构化的问题。在这里，我们描述了在芴甲氧羰基 (Fmoc) 脱保护中使用 1,8-二氮杂双环 [5.4.0] undec-7-ene (DBU) 而不是哌啶如何减少差向异构化并提高含硫代酰胺肽的产量。此外，我们证明在合成含有侧链硫代酰胺的肽时，使用 DBU 可避免副产物的形成。

  DOI：

  10.1055/s-0036-1589027

文献信息

• Thieme Chemistry Journals Awardees – Where Are They Now? Improved Fmoc Deprotection Methods for the Synthesis of Thioamide-Containing Peptides and Proteins
  作者：D. Szantai-Kis、Christopher Walters、Taylor Barrett、Eileen Hoang、E. Petersson

  DOI：10.1055/s-0036-1589027

  日期：2017.9

  thioamides into peptides and proteins provides a useful tool for a wide range of applications. Current incorporation methods suffer from low yields as well as epimerization. Here, we describe how the use of 1,8-diazabicyclo[5.4.0]undec-7-ene (DBU) rather than piperidine in fluorenylmethyloxycarbonyl (Fmoc) deprotection reduces epimerization and increases yields of thioamide-containing peptides. Furthermore

  硫代酰胺在肽和蛋白质中的位点选择性掺入为广泛的应用提供了有用的工具。目前的掺入方法存在产率低以及差向异构化的问题。在这里，我们描述了在芴甲氧羰基 (Fmoc) 脱保护中使用 1,8-二氮杂双环 [5.4.0] undec-7-ene (DBU) 而不是哌啶如何减少差向异构化并提高含硫代酰胺肽的产量。此外，我们证明在合成含有侧链硫代酰胺的肽时，使用 DBU 可避免副产物的形成。
• Efficient Site-Specific Incorporation of Thioamides into Peptides on a Solid Support
  作者：Somnath Mukherjee、Hitesh Verma、Jayanta Chatterjee

  DOI：10.1021/acs.orglett.5b01484

  日期：2015.6.19

  Designing bioactive peptides containing thioamide functionality to modulate their pharmacological properties has been thwarted so far because of various synthetic challenges. The fast, efficient, and inexpensive synthesis and incorporation of a wide range of thionated amino acids into a growing peptide chain on a solid support is reported using standard Fmoc-based chemistry. The commonly employed methodology is comprehensively investigated and optimized with significant improvements regarding the quantity of reagents and reaction conditions. The utility of the protocol is further demonstrated in the synthesis of dithionated linear and monothionated cyclic peptides, which has been a daunting task.
• Amidine Functionality As a Conformational Probe of Cyclic Peptides
  作者：Sungjoon Huh、Solomon D. Appavoo、Andrei K. Yudin

  DOI：10.1021/acs.orglett.0c03369

  日期：2020.12.4

  The amidine functionality switches between hydrogen bond donor and acceptor roles depending on pH. Herein, the amidine was incorporated to select amides in cyclo(d-Ala-Pro-d-Phe-Pro-Gly). The unprotonated amidine-containing macrocyclic conformation resembles its oxoamide counterpart. Upon protonation, minimal alterations in the macrocyclic conformation were observed despite changes to the hydrogen

  脒官能团根据 pH 在氢键供体和受体角色之间切换。在本文中，脒被掺入以选择环（d -Ala -Pro- d -Phe-Pro-Gly）中的酰胺。未质子化的含脒大环构象类似于其氧代酰胺对应物。质子化后，尽管氢键网络发生了变化，但观察到大环构象的变化很小。脒以最小的空间成本破坏氢键，使其成为研究氢键对大环构象影响的有用功能。
• Solid-Phase Total Synthesis of Trunkamide A¹
  作者：Josep M. Caba、Ignacio M. Rodriguez、Ignacio Manzanares、Ernest Giralt、Fernando Albericio

  DOI：10.1021/jo015703t

  日期：2001.11.1

  rich source of novel, biologically active compounds. Herein, the solid-phase total synthesis of trunkamide A, currently in preclinical trials, is presented. Trunkamide A contains a thiazoline heterocycle and two residues of Ser and Thr with the hydroxy function modified as reverse prenyl (rPr). Cornerstones of the synthesis are as follows: (i) solid-phase peptide chain elongation using a quasi-orthogonal

  海洋生物是新型生物活性化合物的丰富来源。在此，提出了目前在临床前试验中的trunkamide A的固相全合成。Trunkamide A包含噻唑啉杂环和两个Ser和Thr残基，其羟基官能团被修饰为反向异戊烯基（rPr）。合成的基础如下：（i）在氯三苯甲基树脂上使用具有叔丁基和芴基的准正交保护方案进行固相肽链延伸；（ii）基于HOAt的偶联剂的混合物；（iii）溶液中的环化。此外，讨论了以下合成步骤：（i）Ser和Thr的反向异戊二烯基衍生物的制备；（ii）引入噻唑啉前体作为受保护的氨基硫代酸衍生物；（iii）用DAST形成噻唑啉环。所有这些特征使该策略特别适合于躯干酰胺A和其他包含相同基序的肽的大规模合成。